在低乡地区，市镇仍然保持原来的商品交换和贸易功能，又没有其他明显的刺激因素，故而在河道淤塞的影响下，一些市镇出现了衰落的势头，还有一些市镇的形态发生了变化。
先以地处淀泖低地的青浦县西部的小蒸镇、大蒸镇为例来说明。据清光绪《蒸里志略》：
小蒸镇：自宋元以来，文人蔚起，为一望族。铺户毗连，商贩交通。国朝道咸间，河道淤塞，市廛日衰，及粤贼焚掠，更非昔比矣。
大蒸镇：宋元时人烟稠密，明时遭倭寇，市遂衰落。国朝乾嘉时，尚有店铺二十余家，今悉歇毕，居民皆务农服畴矣。[27]
志书作者虽然将明中期的倭乱与清道光时的“粤匪”之乱作为二镇衰落的重要因素，但也丝毫未忽略河道淤塞的影响，这一自然因素的累积性作用似乎在清后期达到了高峰。根据另一志书对该镇水利状况的记载，该镇所依存的交通干河白牛塘，在清代后期确实已经“潮泥淤塞，大半成田”，船只不得不绕行其他河道[28]。
有时河道淤塞不一定造成市镇经济的衰落，人们尽可能开浚新的河道来替代易于淤塞的河道，就可能导致市镇形态的重新布局，总的来说这是市镇聚落对水环境变化的一种积极适应。以清末青浦县的张泽镇为例进行说明。张泽镇区周围的主要河道情况如下：
黄浦江：从其西北通过，上溯的潮汐可通达该镇以内及周围的各条河道；
官绍塘：与黄浦江相通的干河，且流经镇区，是该镇市河的来源，但清初因潮淤严重，被另一条通潮河流滟泾所替代。后滟泾淤塞，当地人又重新开浚官绍塘，引黄浦水入镇；
南市河、西市河：原为镇区内交通要道，因潮淤过盛，在咸丰年间完全淤塞；
祝家港：在市镇以外，惠及周围广大乡村，为干河盐铁塘的分支。清中期受盐铁塘淤塞的影响，也出现舟楫不通的情况。咸丰六年，当地士绅组织疏浚后好转。光绪二十三年，沿河各村庄再次合作对该河进行疏浚，随后畅通；
大庙港：在市镇以外，惠及周围广大乡村，为干河滟泾的分支。清中期受滟泾淤塞的影响，大部分淤垫。同治四年起，当地士绅组织疏浚数次，遂保持畅通；
市镇以外各图的支河：有谭家泾、小洋泾、西洋泾、南余泾、大泖港、牌楼港、朱家港、斜路、东村港、南村港、庙泾及二十三图之孟泾尾段等70余条，也存在潮沙淤塞的情况，但因农田水利攸关，在乡人维护下尚能满足灌溉和通小舟之需。[29]
从上引资料来看，张泽镇周围的水环境经过一段时间的变化，在清咸丰间已是问题迭出，好在当地士绅与民众共同努力，及时疏浚旧的河道或者开出新的河道，市镇和周边乡村仍运转如常。镇人在新淤出的沙地和废弃的河道上建造市房，形成了新的街道，例如河南街，“光绪初，里中徐姓购地建屋，遂成街衢”；西大街，“原无此街，以新涨沙地集市成街”； 木行场，“光绪初建，该处前有木行房屋，今该场已满建商房住户矣”。这样一来，市镇重心逐渐发生位移，“（市集）国初均在东段，自忠义庙而东，至汇角桥而北，均为贸易繁盛之区。今则分为东西二市，皆北徙于二图宇圩，而（忠义）庙旁并未有市集”[30] ，可见市镇形态与水道通塞的关系十分密切。
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