国内资源的整合，是视研究型医院为一个系统，将系统与环境中的其他系统或要素的整合。主要包括医院联合体/医院集团的组合打造、单病种优势学科大平台的整合构建、临床与科研人才的联合共享三种主要形式。
（一）研究型医院联合体/医院集团的组合打造
医院联合体/医院集团是现代医院发展的一种高级组织形态，主要是指由同一责任人或团体实施统一管理的，由两所以上医院构成的医疗服务群体，以资本、技术、管理或支付方式等为纽带而组成的医疗服务统一的利益体。
医院联合体/医院集团起源于19世纪初，美国俄亥俄州内几个诊所与教会医院形成协同建立被称为“家庭病房”的小型组织，19世纪70年代初，美国国内出现将三个或三个以上医院进行联合，成立“医疗行业综合体”或“卫生保健联合体”的萌芽。
20世纪90年代，随着医疗保险管理向管理型保健转变，美国在医疗服务组织体系方面出现了整合型医疗服务组织（integrated delivery system，IDS），特别是1993年美国整合性医疗服务卫生网和2000年区域医疗服务信息共享平台（regional health information organization，RHIO）的建设，医疗集团运营模式逐渐趋于统一。目前，美国拥有100多个医疗集团，以美国医院联合体（HCA），仁道医院联合体（HCC为MANA）、美国国际医院组织（AMI）以及梅奥医院集团（Mayo Clinic）为主要代表。
在新中国成立初期，我国也有过医院集团的萌芽形态。受计划经济的影响，一些大医院迫于病床压力，合并小医院，分担自身的医疗压力。自20世纪90年代，我国大中城市的大型公立医院开始探索公立医院的整合。政府相继颁布了一系列配套政策，支持鼓励各类医疗机构合作合并，进行卫生资源的整合。在这些政策推动下，进入了一个迅速发展的阶段，全国组建了若干医院集团/医院联合体。1984年7月，沈阳市成立了全国第一个医疗协作联合体，是我国医院集团发展的雏形。1996年12月南京鼓楼医院集团挂牌成立，标志着我国医院集团建设正式开始。
随着国家“第十二个五年规划”工作与新一轮医药卫生集体改革的全面铺开，区域卫生规划成为解决社会“看病贵，看病难”问题的重要因素。2000年发布的《关于城镇医药卫生体制改革的指导意见》“鼓励各类医疗机构合作、合并、共建医疗服务集团”。目前，全国拥有各类医院集团100余个，以北京朝阳医院集团、上海瑞金医院集团、南京长江医院集团为主要代表。
随着生物、心理、社会医学模式的转变，促使医院从传统的封闭模式改变为系统的开放模式。同时，随着医学学科分科不断细化，医疗市场的激烈竞争，促使各医院在不同的专科、不同的研究方向上形成了自身独特的优势。医院着眼于自身发展的社会利益目标，在医院之间的开展多层次、多系统的协作，避免资源的重复投入，规避不良竞争，深入挖掘和开拓医疗市场。
1．构建纵向型医院联合体 构建以一所三级综合医院为核心，以相应区域划分内的若干所二级医院和社区卫生服务中心为基础的跨资产、跨行政隶属紧密型区域性医疗联合体的基本框架。在联合体内部实行统一资源配置。推进医疗资源整合，构建区域性医疗卫生联合体。提高医疗资源的配置和利用效率，提升社区卫生服务中心的医疗服务能力和水平，促进人民群众合理就医和健康管理，为人民群众提供全程、连续、优质、便捷、经济的基本医疗服务。
2．构建医疗服务信息共享机制 ①实现健康一卡通：建立医疗便民服务一卡通信息共享平台；建立便捷化的医疗服务体系；实现医疗信息资源共享；建立个人终身健康档案；建立社区健康服务与绩效考核；建立卫生行政部门掌握的医疗卫生信息。②实现居民健康档案共享：按照国家标准建立起统一的居民健康档案；把生命周期从胚胎发育到死亡过程的各个时间点对健康情况的干扰和措施进行全程记录。③实现健康信息集中的存放和共享。实现区域内社区居民健康活动数据的集中收集、存储，实现对人整个生命周期健康信息的完整记录。④实现居民健康管理及决策的支持。通过区域卫生信息平台，对个人健康档案进行统一标准、统一存储、统一管理。
3．构建人口健康科学数据共享平台 按照统一标准规范、统一资源规划和统一技术架构，实行“逻辑上高度统一，开放共享；物理上合理分布，分工合作”的运行服务机制，服务科技创新、政府管理决策，医疗卫生事业发展，为创新型医学人才培养和健康产业发展提供科学数据共享服务。
（二）单病种优势学科大平台的整合构建
随着医学科学技术的不断发展，优势学科在医院建设中的作用越来越重要。以单病种诊治特色或疾病诊治链为基础建设优势学科群，针对疾病的不同阶段、不同情况，将各学科的诊疗方案有机地结合在一起，提供科学、完整的系列诊治服务，形成优势互补的疾病诊治链，最终形成临床疾病诊治上的特色和优势。
1．基础与临床紧密结合 充分发挥单病种临床资源、人才技术和品牌优势，加强与基础和理工科学的结合，积极开展合作研究，加强与相关企事业单位的合作，促进优秀科技成果转化，促进单病种诊治水平的提高。
2．拓展单病种诊治平台 以区域协作为基础，吸收区域内乃至国内相关领域的知名专家，以诊疗链为纽带，加强单病种的多学科诊疗。
3．循证医学与多中心合作 1996年Sackett提出循证医学（Evidence-based medicine，EBM）的概念，即自觉、公正、正确地根据所有最好的证据来决定对每一例病人作出治疗选择。传统小样本的临床资料回顾与前瞻性分析已经不适应国际医学发展，用循证医学的观点评价现有的临床研究工作，严格设计和实施的多次前瞻性RCT综合分析结果获得大样本RCT结果，可靠性最高，结论明确。应当以诚信与互惠为基础，以循证医学为依据，开展多中心的合作，构建单病种的学科优势平台。
（三）临床与科研人才的联合共享机制
人才共享实质就是智力资源共享，是人才流动的一种典型形式，是人才跨地域、跨单位、跨专业提供智力服务的外在表现形式，能够在不改变隶属关系的前提下，实现创新人才在各地域、各单位、各专业间的自由流动，最大化创新人才的能力和智力价值。共享机制的构建可分为三个层次。
1．构建不同地域的人才共享机制 通过相应的制度建设、机制构建等，实现跨地域的临床与科研人才共享；用人单位转换创新人才使用观念，通过构建灵活多样的用人机制，使其他单位的临床与科技创新人才服务于本单位，达到对特定创新人才“不求所有，但求所用”的目的。
2．构建临床与科研融合的人才共享机制 在不改变人才所属单位和原有身份的情况下，通过相应的体制安排，使临床与科研人才互相服务于对方，多方共同享有智力资源。科研人员深入临床寻找临床问题，临床医师进入实验室进行科学研究，共同解决科研与临床结合不紧问题。
3．构建不同专业的人才共享机制 交叉学科研究采用的科研方法是多学科、多方法的综合交叉，尤其重要的是现代生物医学的重大课题完成者不再是单学科的专家型，而是需要具有多学科知识的复合人才。通过打破专业壁垒，创新人才共享机制，医学与生物学、物理学、机械学、材料学、社会学、人文学等知识加以沟通和联系，培养出具有较强临床背景的临床研究科学家。
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