所谓发展中的学科，是指人员、装备、医疗和科研用房条件基本具备，在医院处于中流地位的学科或科室。其数量较大，一般占医院全部学科总数的一半以上。他们虽然处于同一个层级，但若逐一分析，就会发现，他们处于这个层级的原因是多方面的，主要可分为三种类型。第一种类型是各方面的配备（人员、装备、用房）较好，但学科带头人能力欠佳或干劲不足，或不能凝聚人心，导致发展缓慢甚至停滞不前（优势学科的滑坡，也可进入这个层级）；第二种类型是学术带头人或科室主任虽然有干劲或有能力，但人员配置不合理，或其他工作条件跟不上，以致不能发挥其应有的作用；第三种类型是从弱小科室起步，由于其学科带头人和科室成员的努力发展到这个阶段。
由于这个层级的学科众多，且其中一部分经过努力可能成为新的优势学科，是应该高度关注的群体。医院决策层要对学科的逐一调研，找出学科发展的问题和突破口，与学科主要负责人和骨干一起，有针对性地制定各个学科的发展规划，为他们解决发展中遇到的关键问题，清除学科发展的障碍。尤其是对学科带头人个人素质差，不能胜任领导岗位者，要毫不犹豫地撤换。只有这样，才能在较短时间内促进学科的良性快速发展。
有时候，让一个很有才气的科学家或名医担任科主任并不一定是明智的。倘若没有领导才能，做了科主任后，可能是“少了一个能干的科学家或名医，多了一个蹩脚的科主任”，对学科发展和个人事业的进步都是有害的。所以，是否应该考虑将科室主任这个行政职务与学科带头人区分开来？让有管理能力且懂业务的专业人员（不一定是业务权威）担任科主任，让学术权威做学术带头人，逐步形成“主诊医师负责制”和“PI负责制”的医疗和科研组织模式，这也许是未来解决这类问题的一个办法。
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