赫拉克利特有一句名言：“人不能两次走进同一条河流。”意思是说，河水是不断流动的，你这次踏进河时的水，即刻就流走了，等你下次再踏进河时，水已经不是原来的水了。所以，你根本无法踏进同一条河流。
这句话，形象地说明了客观事物是永恒运动的，也代表了赫拉克利特的主张——万物皆流，无物常往。据说，当他发现这一规律时还落泪了，因此得到了一个别名——“哭泣的哲学家”。对于此观点，恩格斯曾经评价说：“这个原始的、朴素的但实质上正确的世界观，是古希腊哲学的世界观，而且是由赫拉克利特第一次明白地表述出来的：一切都存在，同时又不存在，因为一切都在流动，都在不断地变化，不断地产生和消失。”
除了“万物皆流”的观点，赫拉克利特还认为，事物是相互转化的，即对立统一的思想：
对立面的统一。一切事物都包含对立的两个方面，如一与多，冷与热，好与坏，善与恶，但对立物在根本上是统一的，如“疾病能使健康变得美好”“坏事能让好事变得愉快”等。
对立面的转化。对立的双方不是凝固的，而是相互联系、相互统一，且不断地向着它对立的方向转化的。比如，冷的变热，热的变冷；湿的变干，干的变湿，等等。
对立面的斗争。赫拉克利特认为，事物之所以会发生变化，原因在于对立面的斗争。斗争是事物变化的根源，如果没有斗争，那么宇宙也将不复存在。
从对立统一的观点出发，赫拉克利特还提出了一个思想，那就是认识的相对性。他认为，任何事物都有相对的两面性，事物性质的差异取决于认识主体和评价标准的不同。举几个简单的例子：驴子情愿吃草，也不要黄金；最美的猴子跟人类相比，也是丑的。
赫拉克利特的思想，渗透着浓厚的辩证法思想。他是爱菲斯学派的创始者，也是古希腊辩证法思想的创始人。尽管他的辩证法是朴素的、自发的，带有循环论的色彩，可就他生活的年代而言，有这样的思想依然是很可贵的。他的思想观点以及贡献，得到了后世不少学者及哲学家的肯定与赞扬。
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