德谟克利特在游学时积累了大量的知识，他想把这些理论与实践结合起来，然后著成一本《宇宙大系统》。可就是这件事，给他带来了很多麻烦。
依照阿布德拉城的习惯，父亲死后，儿子有义务增加财产，让自己的家族更强大。可谁都知道，德谟克利特在分得父亲的遗产后就去各国游历了，浪迹天涯几十年才回来，大部分的财产都花完了。族里人认为他是一个“败家子”，有些贪财的亲戚企图侵占他剩下的财产，就以浪费祖产、不务正业、荒废宅院等罪，把他告上了法庭。按照该城的律例，犯有这样的罪行不仅要被剥夺所有财产，还会被驱逐出城。
好心的邻居提醒德谟克利特，让他当心一点，可他根本不拿这些当回事儿，每天依然忙着解剖动物的尸体，忙着研究和写作。邻居以为他疯了，还特意请来了当时最有名的医生希波克拉底。
当希波克拉底来的时候，德谟克利特正在解剖野兽，他一边翻看野兽的内脏，一边在本子上记录。邻居对希波克拉底说：“您看，他的精神已经失常了。”邻居刚说完，就被天上掉下来的一只大乌龟砸破了头，当场晕了过去。大家都说，老鹰是最高神宙斯的传信鸟，宙斯很喜欢德谟克利特，听见邻居说他的坏话，就让传信鸟叼着乌龟来教训他。
希波克拉底本是被邻居请去给德谟克利特看病的，结果却先给那位邻居包扎了伤口。临走时，他完全成了德谟克利特的崇拜者。没有人知道他们之间谈了什么，但希波克拉底去告诉小镇上的人：“真有人精神失常的话，那一定是你们自己，不是德谟克利特。”之后，他们频繁往来，成了一生的朋友。
不久之后，德谟克利特果然被亲戚告到法庭，但他并不畏惧。当法官问他：“那些控告属实吗？”他辩说：“我的亲属说我花光了父亲遗留下来的钱，这是真的，但我是为了研究整个宇宙的知识，我在写一部《宇宙大系统》的书，里面涉及哲学、物理学、数学、生物学、伦理学等社会生活各个领域方面的问题。”
法官又问：“为什么你研究的那些学问里，没有神学呢？”他的亲属马上说：“他不信神，按照法律当判处死刑。”德谟克利特灵机一动，说：“法官先生，您最敬仰神，这固然很好。你一定听说了，前不久我的邻居诬蔑我得了精神病，结果被天上掉下来的乌龟砸破了头，神喜欢谁可想而知。现在，请您判我的罪吧，反正最高神宙斯会为我做主的，我已经看到他派出的老鹰正朝着这里飞来。”结果，法官当即就判他无罪，那个贪财的亲属被判了诬告罪。
走出法院，希波克拉底问德谟克利特：“你不是不信神吗，怎么在法庭上又说宙斯会为你做主呢？”德谟克利特说：“真理只能和相信真理、爱好真理的人谈论。对于那些昏庸的家伙，只能用别的办法去对付！”
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