我们要让阿里人明白，我们要建立的是一个生态系统，而绝对不能建一个帝国系统。[4]
马云所说的修“生”指的是修建生态系统。从阿里巴巴的规模来看，我们习惯性地把它称为电子商务的“帝国”，但是，马云却很认真地区分了帝国系统与生态系统的不同。帝国系统意味着一种自上而下的管理体系，它依靠管理者的力量而把不同的部分连接起来，并依赖于一个权力集中的统治层的力量而生存。生态系统是一个有机的系统，是一种自然存在，是一种自组织，它不存在某种自上而下的统治力量，也不依赖某种人为的外力的控制。这个系统每个部分都相互联系，每个部分都必不可少，它们以一种自然生命的形式联结起来。帝国系统过于依赖统治者的能力，而生态系统则依赖整个系统自身的力量。
马云所欣赏的太极，就是一种依据天然自然之道的哲学，它涉及的就是自然生态的运转规律。马云希望通过太极拳的思想来助推阿里巴巴建立生态系统，太极拳拳拳相连，意气相生，体内真气相通，从而自然而然地产生出气场。但目前，阿里巴巴内部各部分都还没有相互有机地联结起来，子公司之间、部门之间、不同的业务之间还没有彼此贯通。
雅虎与阿里巴巴其他业务几乎是断裂的，最多只提供一些广告方面的支持；阿里云作为一种前沿科技，有点“高耸入云”之感，还没能很好地融入集团的其他业务中去。马云所试图打通的，不仅仅是集团内部各部分之间的关系，而且还有集团与外部企业的关系。他反复跟员工强调，不能把阿里巴巴定位为一家电子商务公司，因为公司作为一种独立的系统，与公司之外的其他公司似乎就不相贯通。他把阿里巴巴定位为一个平台，是所有中小企业都可以依赖并为其节省成本、提高效率的平台。它是中小企业乃至整个商业领域里面的一种“融合剂”，把它们有机地融合在一起，共同形成一个巨大的有机体，这就是马云修“生”养性之“生”的意思。
具体而言，对于如何把阿里巴巴修建为一个生态系统，马云从宏观层面上提出了三个方面的内容：业务系统、管理系统和组织文化系统。其中如何建立业务系统最为关键，它也是马云思考得最多的问题。他说：“我想业务系统之间的建设，是一个巨大的系统工程，是一个生态系统工程。我们一直讲生态环境，决定生态环境核心的东西不是老虎，不是人，不是大象，而是微生物。我们今天要想想怎么构建起最底层的微生物。”[5]在业务系统中，马云最为关心的是如何打通B2B业务和淘宝业务，打通两者之间的关系将会对建立整个业务系统起到关键的作用。
第二步是建立管理生态系统。马云看到，在当下想要建立一个庞大的电子商务帝国已经不太可能，因为它需要一个既懂得阿里巴巴业务也懂得管理的最高权力掌控者，但马云却并不是这样的权力掌握者，他的股权并不大，对技术也一窍不通，至多只是一个管理者。因此他说：“今天我们已经没办法找到一个人来管我们，但是我们可以建立一个巨大的管理系统。这个管理系统的建设，要利用information（信息）、利用data（资料）、利用价值体系、利用所有的process（程序），关键是要有一套管理的理念和思想。”[6]一套合理的、“有机”的管理思想对于建立管理系统至关重要，而这套管理思想是马云多年来一直思考的东西，他的目标就是借助这套思想来贯彻阿里巴巴所有的管理工作。
第三步是建立组织文化系统。其实这一步很重要，因为建立管理系统很大程度上依赖于这个组织文化系统，文化价值观念本身就能够在最大程度上帮助企业管理，实现目标。“第三是我们如何建立一个组织文化发展系统。我讲的系统，不是一套软件，而是一个理念，是一个游戏规则，同时要加上技术力量。我们一定要把它做到，这是一个极大的创新。”[7]
马云的修“生”之道是一种很先进的思想，在他的想法里面，我们看到的似乎不再是一个普普通通的公司，而是一家自觉承担起一定的社会责任和使命的组织。它以帮助中小企业为目的，以“让天下没有难做的生意”为宗旨，以科学而合理的管理文化体系为治企理念，在“倒立”着看世界的马云的眼中，只有这样的企业，才能成为一家真正意义上的现代企业。
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