假设这一复杂的思维过程可以分为两个基本阶段，即假设的提出阶段和假设的验证阶段。
1．假设的提出 任何假设都是针对某些待说明的事实，根据一些事实或理论所提出的。例如德谟克利特（公元前约460—370年）对于许多当时不解的事实（如为什么隔着一定距离我们还可以嗅到花或者其他有香味物体的香味？为什么加热于水，它就会蒸发？为什么压缩某些物体——如气体，其体积就会缩小？等等）。根据对于沙这种由机械微粒组成的物体和这些微粒之间的相互作用之观察、研究，就提出了“一切物体都是由原子构成，即由为空间隔开的、最小的不能再加分割的微粒组成的”这一假设。
在提出假设这一过程中，类比推理起着很大的作用。如上说的例子，德谟克利特就是由一个典型的类比推理得出那一假设的；沙堆有时也会有些细小的微粒飞散出来，沙堆也能因受到压缩减小其体积，而沙堆是由为空间隔开的、最小的不能再加分割的（当时是这样看法）微粒组成的。因此，一切物体也是由为空间隔开的、最小的不能再加分割的微粒组成的（德谟克利特称这种微粒为“原子”）。
类比推理所得的结论是或然的，因此，这一假设还需要加以验证。
2．假设的验证 假设的验证可分为两个步骤。A．对假设进行逻辑的推演，即根据逻辑规则、规律，由假设（暂时假定它是真的）推求出一系列结论；B．把所得到的这一系列结论一一拿来和实践（实验）中获得的新结果相对照。如果对照的结果，所得结论与那些结果不符，则这假设便是不正确的；如果结论与那些结果全部一致，则这假设的成立就有较大的可能性；如果结论不仅与已有的结果全部一致，而且还能预见未来的结果（事实现象），这时，这一假设便被证实，在科学上，它就上升为科学定律、科学理论。
例如：上说的假说提出后，就曾暂时以它为真推出了一系列结论，其后，这些结论便都为实践所证实。如曾有过这样一个结论：如果这一假设是真的，那么，对液体施加大的压力，组成液体的微粒就会通过容器渗透出来。于是加以实验。实验已经证实了这一结论：把矿物油装进钢制的厚容器里，施加几千个大气压力，矿物油就穿过容器壁渗透出来。
（上举德谟克利特的这一假说，在成为科学理论以前曾有很大改变，不具。）
在这一过程的第一步骤中，演绎推理起着重大作用，从暂定为真的假设推求出一系列结论来，就是运用演绎推理的过程。不用说，在其第二步骤中实践（实验）则是起着重大作用的。
这样，要能提出科学的假设，并且有效地加以验证，必须具备三个条件：
1．提出假设必须有一定的根据：已有的经验、知识（前人的理论）和新观察到的有限事实。
2．熟练地运用类比和演绎的方法。[2]
3．严格遵守假设反复验证的标准：由假设引申出来的结论；一方面要能解释已知的全部事实，另一方面能够预见新的事实。
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