毕达哥拉斯雕塑
有说法称，“全部西方哲学史不过是为柏拉图的思想做注脚，然而柏拉图本人却是在为毕达哥拉斯做注脚。”毕达哥拉斯的哲学思想具有神秘主义色彩，他和其所创立的毕达哥拉斯学派信奉“万物皆数”的理念。
伯兰特·罗素在他的《西方哲学史》中这样评价毕达哥拉斯，称其是“自有生命以来在思想方面最重要的人物之一”。毕达哥拉斯是一位杰出的数学家，也是从他那时以来，数学便开始了对哲学的深刻而又不幸的影响。
毕达哥拉斯的世界观结合了米利都学派以及自己有关数学的理论，他认为存在着许多但有限个世界，并坚持大地是圆形的。毕达哥拉斯在对数学的研究中还形成了后来的理念论和共相论，即对可理喻的东西与可感知的东西进行了区别。在毕达哥拉斯看来，可理喻的东西是完美的、永恒的，而可感知的东西则是有缺陷的。这个思想后来被柏拉图发扬光大，从此一直支配着哲学及神学思想。
毕达哥拉斯是数学家、哲学家和音乐理论家，同时也是一位门徒广布的教育家。有一次他遇到一位非常努力用功的穷人，他想教对方学习几何，于是就跟人家说：“如果你愿意跟我学习一个定理，我就赠给你一枚钱币。”看在钱的份上，乐不可支的穷人痛快答应了他。学生进步飞快，过了一个学期，他对几何产生了强烈的兴趣，反过来要求毕达哥拉斯教快一些，还建议：如果老师多教一个定理，他就给老师一枚钱币。结果毕达哥拉斯没用多长时间，又把之前他给学生的钱全部收了回来。
“哲学家”一词的最初含义是指“爱智慧的人”，哲学就是“追求智慧的学问”，而赋予它这一含义的第一人正是毕达哥拉斯。据说，有一次，毕达哥拉斯同弗琉斯的统治者雷翁谈话。雷翁对他的才学和雄辩大力盛赞，并询问他的技艺是什么。毕达哥拉斯回答说：“我没有什么技艺，只是一个爱智慧的人（哲学家）。”
对于他的“爱智慧的人”，毕达哥达斯曾有这样一个著名的比喻。他说，在现世生活里有三种人，正像到奥林匹克运动会上来的也有三种人一样：最高等的一类是那些只观看比赛的人们；次之的是那些来为比赛而比赛、夺取桂冠的人；最低等的是那些来做买卖的人。同样，在现实生活中，有些人沉沦于功名禄位，有些人则沦为金钱的奴隶，这其中仅有少数人作出了最好的选择，他们将自己的精力和时间用来思考自然，从事科学研究。最后，他们成为爱智慧的人，这就是哲学家。
毕达哥拉斯一生追求智慧，实践着自己一个哲学家、数学家的理想，但最终却倒在了政治倾轧和别人的妒忌之下。他的死据说是因为他涉及并参与了一些政治活动，也有说法认为他是因为拒绝一位权贵加入自己的团体而遭到迫害。
公元前500年左右的一天，毕达哥拉斯和他的弟子在一次讲学中，被一伙别有用心之徒放火焚烧了他们讲学的房子。他在弟子们的搀扶下逃出火海，却在逃跑的途中经过一块豆田。毕达哥拉斯的脚步停了，他宁愿被逮住打死也不愿践踏这片田地。因为在他们的戒律里有那么一条，豆子是神圣之物，他们不能食之，自然更不能践踏。后来，他被追上来的人打死了。不过，另外还有说法认为，他侥幸逃到了意大利南部塔兰托湾的梅泰彭西，在那里禁食40天后死于缪斯神庙。
学海拾贝
有一次毕达哥拉斯在大街上被铁匠铺里叮叮当当的打铁声所吸引，他觉得这个声音美妙悦耳。于是他走进铁匠铺，更进一步去聆听铁匠打铁的声音，由此他发现了数学与音乐之间存在的奇妙关系。
《雅典学院》中醉心于研究的毕达哥拉斯
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