康有为于1901年至1902年在印度定居时写了《大同书》手稿后，曾多次修改，这些修改，除增修编次、补充事例外，还反映了他思想上的演变。
《大同书》手稿没有分章节，以首卷为例，列“《大同书》第一”，一开始是“今本”《绪言·入世界观众苦》，下面序次是：
一曰投胎之苦，二曰夭折之苦，三曰废疾之苦，四曰蛮野之苦，五曰边地之苦，六曰奴婢之苦，水旱饥荒之苦，蝗虫，火焚，水灾之苦，火山之苦，地震之苦，室屋倾坏之苦，舟船覆沉之苦，汽车碰撞之苦，疫疠之苦，贫穷之苦，富人之苦，贱者之苦，贵者之苦，帝王之苦，圣神仙佛之苦，鳏寡之苦，孤独之苦，老寿之苦，愚蠢之苦，仇怨之苦，爱恋之苦，牵累、劳苦，愿欲，疫病无医之苦，刑狱之苦，苛税之苦，兵役之苦，压制之苦，阶级之苦。
“今本”则分章节，其目为：
绪言：人有不忍之心
第一章 人生之苦
第二章 天灾之苦
第三章 人道之苦
第四章 人治之苦
第五章 人情之苦
第六章 人所尊尚之苦
“今本”之“苦”，虽基本上和“手稿”相同，但它所分为六章，将各种“苦”按类排入，编次自与“手稿”有别。“手稿”中“蝗虫”、“火焚”、“劳苦”、“愿欲”下也一律加上“之苦”。说明“今本”是经过改动的。
“今本”甲部、乙部基本上是按照“甲、乙本”排印，“甲、乙本”是根据《不忍》原版付印的，《不忍》刊于1913年，也就是说：1902年《大同书》写出初稿后，到1913年《不忍》发表甲部、乙部，这十一年间，康有为是对它进行过增改的。
从“手稿”到《不忍》印出甲、乙两部时的增改，并不只是次序调整、章节另排，即内容也有增改，而这些增改，又与他游历欧美有关。如“今本”《贫穷之苦》中：
试观东伦敦之贫者，如游地狱，巴黎、纽约、芝加哥贫者亦然。菜色褴褛，处于地窖，只为丐盗，小儿养赡不足，多夭者，聚成大园，风俗愈坏，监狱愈苦，病须医愈多。英国特立部，岁费千万磅以恤之，终无补也。他日即机器极精，谋生较易，而贫民终不能免，议者至比为人之排泄物，尤为惨矣。（第32页）
这一段即为“手稿”所无。按：康有为虽曾在1899年赴英国，而他到法国和纽约，则为1905年。
美国之南科罗打市，一夕为海水没，吾尝观其影戏焉，惨哉！（第21页）
这一段，“手稿”也无。按康有为由加拿大游美国，系1905年。
犹太罗马及穆护教之抑女，亦犹是也。基督乐在天国，故亦土木其身，其清教徒苦行不食，栖山闭处，亦犹佛教焉。今西班牙之可度犹见之也……（第7页）
这一段以至最后两段（第7—8页），“手稿”均无，又如：
以欧土之化，而西班牙尚有气地拿之穴处人犹然也。（第12页）
若西班牙之气地拿人今犹穴处于迦怜拿大之故都焉。（第16页）
这二节也为“手稿”所无。按：康有为于1906年重游欧洲，至西班牙，这里虽未明言“吾见”，但谓“今在西班牙之可度犹见之也”，见“气他拿之穴处”，疑亦为游欧所见。
《大同书》也有游历后补记1902年后的见闻，如：
吾观意国奈波里之古城，犹可见惨状焉。其地近%苏%，火山裂后，百里之田庐人家沉没忽焉。今于二千余年后掘地下而古城发露，自城门、桥梁、街衢、庙宇、室庐皆如故也，室中衣冠会集筵宴如故，缝匠手针线缝衣如故，街中策马驰车如故，而大劫同尽，亿万众无可免焉。今此山尚数年十数年一大焚裂也。希腊哥林士之古城亦然。细细里岛近岁大灾，死者三万尤剧矣。（第22页）
以上加着重号（·）的，均为“手稿”所无；而最后“今此”以下，则为“今本”所增。按：康有为于1904年5月26日（四月十二日）自槟榔屿启行，经锡兰、亚丁至红海，穿苏伊士运河入地中海，经希腊群岛，6月中旬（五月初），至意大利，由巴的连诗登陆，经游奈波里而至罗马。6月27日（五月十四日），由罗马往游米兰，旋又游历欧洲各国，见所撰《欧洲十一国游记》；此后，又于1906年重游意大利。这里他将“观意大利”加上“吾”字，下面又增加希腊等，可知系1904年至1906年游意以后补加。
此外，《大同书》除甲、乙两部外，也有很多以欧美事迹作证的记述，虽未明言是“闻”或“见”，也极有可能是游历所得，于1902年后增补的，如：
伦敦、苏格兰、阿尔兰尚多乞丐徒跣者，意、班、葡贫人尤盛，则其不能尽教成才，尽养无憾，亦可见矣。妇女但依夫为食，日读小说，游戏清谈为事，则其不具人格，徒供玩具可见矣。（第189页）
以美国政体之美，而以风俗尚富之故，乃至多为纳贿杀人之事，其每“博洛”中之屋，众无赖居之，以日行剽劫棍骗为生，其他诈欺相杀之事不可胜数；意国尤甚，欧美多相若也。（第189页）
又若欧美行礼之时及跳舞之际，大宴之会，甚至来复日之夜食，大酒店之夜食，皆袒肩露臂，妇女勉强行之，多感冒致疾者，此等弊俗当亦大同世之所无；然若未尽除，尤孕妇产妇之所不忌，所当严禁者也。（第200页）
今欧美自由之风渐昌，平等之义渐出，女权日达，女学日明，美、法国且有为官吏学士者。（第203页）
由上可知，《大同书》中有着康有为于1902年以后游历欧美的见闻记录，且有的明显地标出“吾观”、“尝闻”。康有为在撰述《大同书》后，又曾增补。
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