实验三 大肠杆菌染色体DNA的提取
一、实验目的
学习高盐法制备细菌基因组DNA的方法,掌握高盐法制备细菌基因组DNA的实验原理。
二、实验原理
细菌是单细胞生物,在去污剂和蛋白酶K的作用下细胞膜裂解,释放内含物。高盐浓度和低温下裂解液中大量蛋白质被沉淀出来,与溶液中的DNA分离。随后用无水乙醇将溶液中的DNA沉淀出来,此方法优点是步骤简单、快速。
三、实验仪器、材料和试剂
1.仪器:培养箱,灭菌锅,超净工作台,离心管(1.5mL、7mL),台式高速离心机,微量移液器,枪头(1mL、200μL、10μL),枪头盒,漩涡振荡器,自来水泵,恒温摇床。
2.材料:大肠杆菌DH5α。
3.试剂:2×裂解buffer(20mmol/L Tris-Cl,200mmol/L NaCl,20mmol/L EDTA,1%SDS,pH8.0),Proteinase K(10mg/mL),6mol/L NaCl,RNaseA(10mg/mL),无水乙醇,进口分装琼脂糖,1kb DNA ladder。
四、实验步骤
1.取1.5mL大肠杆菌DH5α过夜菌(37℃,180rpm摇床培养),10000rpm离心1min。
2.用自来水泵吸干上清液,菌体充分悬浮于250μL去离子水中。
3.加250μL2×裂解buffer(20mmol/L Tris-Cl,200mmol/L NaCl,20mmol/L EDTA,1%SDS,pH8.0)和13μL Proteinase K(10mg/mL),盖紧盖子,上下颠倒5次。
4.37℃水浴保温1h。
5.加入250μL饱和(~6mol/L)NaCl。
6.盖紧管盖,在漩涡振荡器上剧烈振荡30s。
7.冰浴10min。
8.9500rpm离心10min。
9.小心转移500μL上清液至一干净离心管中,加5μL RNaseA(10mg/mL)。
10.37℃水浴保温30min。
11.加1mL无水乙醇,盖紧管盖,上下颠倒直至看清带状沉淀。
12.10000rpm离心5min。
13.用自来水泵吸干上清液,沉淀用70%乙醇洗一次,10000rpm离心2min,再次吸干上清液。
14.沉淀干燥后溶于100μL无菌水(如果溶不掉可再加一些无菌水,但最后体积不能大于300μL)。
15.取10μL琼脂糖凝胶电泳检测,实验原理和实验步骤见附录1,但胶浓度为0.7%,marker为1kb DNA ladder。
五、结果与分析
细菌基因组DNA琼脂糖凝胶电泳图形与植物和动物基因组DNA相似。
六、注意事项
1.蛋白酶K消化要彻底。
2.操作时避免机械破坏长链DNA分子。
七、思考题
请简述高盐法提取细菌基因组DNA的实验原理。
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