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测定含量步骤

时间:2023-10-20 百科知识 版权反馈
【摘要】:一般来说,不同生物其DNA含量不同。而同一种生物其DNA含量相对较稳定,因此可以通过测定DNA含量而相对区别,更进一步测定DNA分子中GO的克分子百分数,这是分类学中的一个重要指标。如上所述,DNA存在于细胞中,所以必须先将细胞破碎,此外,生物材料中,除含有核酸外,还含有其他含磷物质和含糖物质,因此必须进行预先处理,方能测定DNA含量。DNA中的2-脱氧核糖在酸性环境中与二苯胺试剂一起加热产生蓝色反应,在595nm处有最大吸收。
含量的测定_环境工程微生物实

四、DNA含量的测定

DNA是重要的生物大分子,它不但是细胞的重要组成成分之一,还和蛋白质一起构成生命的主要物质基础,而且它的主要生物学功能是直接参与生物遗传信息的传递过程,是遗传的物质基础。DNA主要集中在细胞核中,主要由腺嘌呤、鸟嘌呤、胞嘧啶和胸腺嘧啶4种碱基的脱氧核糖核苷酸组成。一般来说,不同生物其DNA含量不同。而同一种生物其DNA含量相对较稳定,因此可以通过测定DNA含量而相对区别,更进一步测定DNA分子中GO的克分子百分数,这是分类学中的一个重要指标。

如上所述,DNA存在于细胞中,所以必须先将细胞破碎,此外,生物材料中,除含有核酸外,还含有其他含磷物质和含糖物质,因此必须进行预先处理,方能测定DNA含量。

(一)生物材料的处理及核酸组分的分离

生物组织(细胞)通过匀浆器或超声波破碎后进行预处理,其目的是除去酸溶性含磷化合物。常用冷的5%~10%过氯酸(PCA)或三氯乙酸(TCA)处理粉碎(破碎)的生物材料,然后抽滤除去酸溶性部分抽提液,包括核苷酸及分子量小的寡核苷酸等。再将残留物用有机溶剂(如乙醚、氯仿等)除去脂溶性含磷化合物,抽提液中主要是磷脂类物质,留下的残渣中为不溶于酸的非脂类含磷化合物,包括DNA、RNA、蛋白质及少量其他含磷化合物。然后可按下列方法之一测定DNA含量(图10-1)。

图10-1 DNA分离的步骤

1.碱法

将酸不溶的非脂类化合物与1MNaOH(KOH)在37℃下保温过夜,RNA被降解为酸性核苷酸,而DNA不被分解,加入PCA或TCA(达到终浓度为5%~10%)酸化后,DNA即沉淀下来,上清液中为RNA的酸解产物。

2.冷酸法

将经酸和有机溶剂处理后的组织用1MPCA于40℃下处理18小时抽提出RNA,再用0.5MPCA在70℃下处理20分钟,抽提出DNA。

(二)DNA含量的测定

1.紫外吸收法

DNA分子中的嘌呤环和嘧啶环的共轭双键系统具有紫外吸收高峰在260nm的特征,DNA的克分子消光系数(或称吸收系数)e(P)260nm(pH=7.0)=6 600,含磷量为9.2%,因此,每毫升溶液1μgDNA的光密度值为0.020。只有在OD260/OD280在1.9左右得出的结果较准确。

将样品配制成5~50μgDNA/ml的溶液,于紫外分光光度计上测定260nm吸收值,计算浓度:

(L为比色杯厚度)

如果待测样品中含有酸溶性核苷酸或低聚多核苷酸,则在测定时需加钼酸铵-过氯酸沉淀剂,以沉淀除去大分子核酸,测上清液260nm处吸收值作为对照。

2.二苯胺显色法测定DNA含量

DNA中的2-脱氧核糖在酸性环境中与二苯胺试剂一起加热产生蓝色反应,在595nm处有最大吸收。DNA在40~400μg范围内,光密度与DNA的浓度成正比。如在反应液中加入少量乙醛,可提高反应灵敏度。

(1)DNA标准曲线的制定:取10支试管分成5组,依次加入0.4、0.8、1.2、1.6、2.0ml DNA标准溶液,添加蒸馏水至2.0ml,另取2支试管,各加入2.0ml蒸馏水作为对照,然后各加入4.0ml二苯胺试剂,混匀,于60℃恒温水浴中保温1小时,冷却后于595nm处进行比色测定。取平均值,绘制标准曲线。

(2)样品的测定:同标准曲线操作。

(3)DNA含量的计算

(4)二苯胺试剂:使用前称取1.0g重结晶二苯胺,溶于100ml分析纯冰乙酸中,再加入1ml过氯酸(60%以上),混匀待用,临用时加入1.0ml 1.6%乙醛。所配得试剂应为无色。

思考题

1.微生物生物量测定的意义是什么?

2.测定微生物生物量的方法有哪些?各自有何特点?

3.MPN测定法的原理是什么?

4.平板菌落计数法测定的生物量是哪部分?其计数的原则有哪些?

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