实验项目十五 酵母蛋白质和RNA的提取
学习目标
【知识目标】
(1)能用自己的语言描述酵母蛋白质和RNA提取的原理。
(2)能够迅速而准确地陈述酵母蛋白质和RNA提取的实验操作要点。
(3)能够准确鉴别酵母蛋白质和RNA提取的结果,并能说明其意义。
【能力目标】
(1)能够正确完成酵母蛋白质和RNA提取的各项操作内容,做到步骤正确、动作连贯协调、内容全面无遗漏。
(2)能够正确分析酵母蛋白质和RNA提取的结果。
案例引导
患者,男,42岁,近期出现全身乏力、食欲减退、恶心、呕吐、厌油、腹胀、肝区痛、尿色加深等症状。肝功能检查ALT升高。HCV-RNA检查呈阳性。根据所学知识,对患者作出诊断。
(提示:急性丙型肝炎)
【实验原理】
酵母细胞富含蛋白质和核酸。用稀碱液(0.2%的氢氧化钠)处理酵母细胞使细胞裂解,离心收集上清液,得到酵母核蛋白提取液。用盐酸调节提取液的pH值至3.0(核蛋白的等电点),核蛋白溶解度下降导致大量析出,离心收集沉淀物为酵母蛋白质粗制品。
酵母核蛋白是一种结合蛋白质,是蛋白质与核酸的复合物。酵母核酸主要是RNA(含量为干菌体的2.67%~10.0%),DNA含量较少,仅为0.03%~0.516%。如设法使酵母核蛋白中的蛋白质与核酸分离并除去蛋白质和DNA,就可得到较纯的RNA制品。这可通过以下操作完成:将核蛋白制品溶于含十二烷基磺酸钠(SDS)的缓冲液中,加等体积的水饱和酚,剧烈振荡后离心,将溶液分成两层,上层为水相,含有RNA;下层为酚相,变性蛋白及DNA存在于酚相及两相界面处。吸出水相并加乙醇即可沉淀出酵母RNA。若用氯仿-异戊醇进一步处理RNA制品,则可获得纯度更高的RNA。
【实验器材】
离心机,干燥箱,恒温水浴箱,真空干燥器,天平,751型分光光度计,冰箱,量筒(50mL),蒸发皿,烧杯(50mL、100mL),Eppendorf管(1.5mL),精密试纸(pH值测定范围为0.5~5.0)。
【药品及试剂】
0.2%NaOH溶液,6mol/L盐酸溶液,95%乙醇,SDS缓冲液:0.3%SDS,饱和酚液,氯仿-异戊醇液,含2%乙酸钾的95%乙醇溶液,无水乙醇,乙醚,鲜酵母或干酵母粉。
【试剂配制】
(1)SDS缓冲液:0.3%SDS,0.1mol/L NaCl,0.05mol/L乙酸钠,用乙酸将pH值调到5.0。
(2)氯仿-异戊醇液:24∶1(体积比)。
操作流程
【操作步骤】
1.酵母核蛋白的提取
称取鲜酵母30g或干酵母粉5g,放入100mL的烧杯中。加入40mL 0.2% NaOH溶液,在20~40℃水浴环境下搅拌30~60min后,在转速为4000r/min条件下离心10min,取上清液倒入50mL的烧杯中,并将烧杯置于放有冰块的250mL的大烧杯中冷却,待冷却至10℃以下时,用6mol/L HCl小心地调节溶液的pH值至3.0左右。随着pH值下降,溶液中的白色沉淀物逐渐增加,到pH值为等电点时沉淀最多(注意严格控制pH值)。pH值调好后继续于冰水中静置10min,使沉淀充分,颗粒变大。将此悬浮液以3000r/min的转速离心20min,倒掉上清液。将沉淀物转入蒸发皿内,放入干燥箱中干燥后称重,即是酵母核蛋白粗品。
2.苯酚法提取酵母RNA
取上述核蛋白研碎,加10mL SDS-缓冲液,使之成匀浆,倒入Eppendorf管(略少于管容积的一半),室温下静置10min,再加等体积的饱和酚液,室温下剧烈振荡5min后置于冰浴中分层,在转速为4000r/min的条件下离心10min,吸出上清液,转入新的Eppendorf管,加两倍体积95%乙醇(含2%乙酸钾),在冰浴中放置30min,使RNA沉淀。再以10000r/min的转速离心5min,弃去上清液,沉淀用少许无水乙醇和乙醚各洗一次,各迅速离心1min,保留沉淀。倾去乙醚后,减压真空干燥,准确称重,记录(或将沉淀溶于少量1mol/L NaCl溶液中,4℃时保存备用)。
【实验数据处理及结果分析】
1.计算核蛋白提取率
核蛋白提取率(%)=核蛋白质量(g)/酵母质量(g)×100%
2.RNA含量测定
将干燥后或保留沉淀的RNA配制成浓度为10~50μg/mL的溶液,在751型分光光度计上测定其260nm处的吸光度,按下式计算RNA含量:
3.计算RNA提取率
【注意事项】
利用等电点控制核蛋白析出时,应严格控制pH值。
【实验意义】
RNA作为遗传物质之一,它的提取和分析都有着重要的意义,这些对于研究相关遗传疾病起着重要的作用。
能力检测
一、单项选择题
1.在生物体系中下列信息传递方式尚无证据的是( )。
A.DNA→RNA B.DNA→蛋白质
C.蛋白质→RNA D.RNA→DNA
E.以上都不是
2.下列关于DNA指导的RNA合成的叙述中哪一项是错误的?( )
A.只有在DNA存在时,RNA聚合酶才能催化生成磷酸二酯键
B.转录过程中RNA聚合酶需要引物
C.RNA链的合成方向是5′→3′
D.大多数情况下只有一股DNA作为RNA的模板
E.合成的RNA链没有环状的
3.下列关于RNA的生物合成,哪一项是正确的?( )
A.转录过程需要RNA引物
B.转录生成的RNA都是翻译模板
C.蛋白质在细胞浆中合成,所以转录也在细胞浆中进行
D.DNA双链中一股单链是转录模板
E.合成方向是3′→5′
4.能特异性抑制原核生物RNA聚合酶的是( )。
A.利福平 B.鹅膏蕈碱 C.假尿嘧啶 D.亚硝酸盐 E.青霉素
5.病毒的核心是( )。
A.核酸 B.蛋白质 C.多肽 D.脂类 E.糖蛋白
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