【摘要】：如果用DNA变性剂来代替温度，则不同的DNA双链解成单链时，需要不同浓度的变性剂。现在用不同浓度的变性剂配制电泳凝胶，变性剂浓度呈梯度增加，此时，如有两份DNA样品在凝胶中电泳，就会在不同浓度的变性剂的位置上解开成为单链。DNA放在横跨整个凝胶的上样孔中。凝胶的左边PCR产物的迁移率高些，这是因为DNA保持着双链状态。
变性温度梯度凝胶电泳(_环境微生物学（下
六、变性温度梯度凝胶电泳(denaturing/temperature gradient gel electrophoresis)
变性梯度凝胶电泳(DGGE)或温度梯度凝胶电泳(TGGE)可以通过分析PCR扩增的DNA片段来研究微生物群落多样性。由于DNA双链是靠互补碱基之间的氢链连接的，碱基组成不同的DNA双链解开形成为单链所需的温度也不同;换句话说，不同的DNA分子有不同的解链温度(Tm)。如果用DNA变性剂来代替温度，则不同的DNA双链解成单链时，需要不同浓度的变性剂。现在用不同浓度的变性剂配制电泳凝胶，变性剂浓度呈梯度增加，此时，如有两份DNA样品在凝胶中电泳，就会在不同浓度的变性剂的位置上解开成为单链。这样就可以比较这两种DNA分子中单个核苷酸的不同。
DGGE或TGGE的使用如图15-13所示。该图显示垂直凝胶(左)和平行凝胶(右)。垂直凝胶中变性剂(温度或化学品)增加梯度与电泳方向垂直。DNA放在横跨整个凝胶的上样孔中。凝胶的左边(低变性剂浓度)PCR产物的迁移率高些，这是因为DNA保持着双链状态。凝胶的右边(高变性剂浓度)几乎没有迁移。在中间浓度的变性剂中，DNA有不同程度的解链和不同的迁移率。平行凝胶中，变性梯度从上到下增加，即与电泳方向平行。在这种情况下进行试验时，一般是在平行梯度凝胶的不同上样孔中重复放入同样的样品，规定上样样品之间的时间间隔。这样可以估计分离不同片段的最适条件。
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