第三节 美国《生物学文摘》与BioSIS Previews
一、概况
美国《生物学文摘》(Biological Abstracts,简称BA)创刊于1926年,1964年BA编辑部正式命名为“生物科学情报服务社”(Biosciences Information Service,简称BIOSIS)。BA是目前世界上较权威的报道有关生命科学文献的文摘刊物,它收录世界110多个国家和地区、41种文字的9 000余种期刊论文以及少量的专题论文、学位论文、科技报告和专著等,其重点在生命体鉴别、内部过程与环境作用及其应用等方面。内容偏重于基础和理论方法研究,涵盖了传统生物学(分子生物学、植物学、生态与环境科学、医学、药理学、兽医学以及动物学)、跨学科的研究课题(农艺学、生物化学、生物医学、生物技术、实验临床兽医药学、遗传学、营养学以及公共卫生学)及实验仪器与方法等广大研究领域。BA姊妹篇为《生物学文摘/报告·评论·会议》(Biological Abstracts/Reports·Reviews·Meetings,简称BA/RRM),1980年创刊,主要收录BA未包括的有关生命科学的报告、述评、新出版的生物医学图书介绍和国际会议录等,在内容报道的深度和广度方面都有增加。已有BA和BA/RRM的光盘版、网络版,大大提高了检索效率。
二、印刷版
BA为半月刊,1年1卷,1卷24期,每卷出一套累积索引(Cumulative Index)。105卷(1998年)以前每年出版2卷,每卷12期,半年出一套累积索引(Semiannual Cumula-tive Index)。
(一)结构编排与著录格式
BA主要由文摘和辅助索引两部分组成。
1.文摘部分
文摘部分包括文摘主要概念标题表和文摘正文两部分。
(1)主要概念标题表 文摘主要概念标题表相当于主题分类目次表,是文摘排序的依据。在1969年以前,文摘正文前面的目次表都是按照由一般到具体、由低级到高级的顺序编排的,里面文摘的编排也按这种顺序。自1969年起到1998年前,BA将收录的文摘按内容分为84个大类、470个小类。84个大类按字顺编排,列于每期文摘的最前面,称为文摘主要概念标题(Major Concept Headings for Abstract),标题右边为各类起始页码。文摘主要概念标题在1998年(105卷)以后改称为“主要概念标题等级表”、“主要概念标题字顺表”。
主要概念标题等级表按照生物科学的学科主题概念划分为78个一级类目、64个二级类目和27个三级类目,共169个类目,用做分类目次表,提供分类途径检索文摘部分,其后附有主要概念标题字顺表,将上述169个类目按字顺重新排列,并标出相应的文摘号(带“*”者,表示该期无此类目的文献),以便检索。
(2)文摘正文 即正文部分,是检索的对象。由主要概念标题、次级类目标题(副标题)、参见、文摘四项组成。在各级标题之下有See also参照,列出其相关主题,把有关主题联系起来,引导读者扩大检索范围。
文摘著录内容包括文摘号、著者(10人以内全部著录,第一著者姓前名后,其他著者名前姓后)、著者单位和地址(给出著者单位的著者用“*”标出)、出处[刊名全称、卷(期)页码]、论文题名(黑体标出)、内容摘要(但有5%文献没有文摘)。
2.索引部分
1998年前主要有4个索引:著者索引、生物分类索引、属类索引、主题索引,另外有卷(半年)累积索引;1998年(105卷)后改为:著者索引、生物体索引、主题索引,另外有卷(半年/全年)累积索引。
(1)著者索引(Author Index,简称AI) 通过已知著者(个人或团体)来检索有关文献的一种途径,由著者姓名、文摘号组成。个人著者姓在前,为全称,名在后,为缩写,团体著者用全称,与个人著者混编,按字顺排列。一篇文献有几个著者就有几条索引,互相参见。检索时,检索者只需按著者姓名字顺依次检索即可,著录时,只著录前10名著者,带“*”著者提供单位和地址。AI是BA中连续性最好、最简单、稳定、方便的索引。
(2)主题索引(Subject Index,简称SI) 通过关键词来检索文献的一种索引。关键词是直接从文献的题名、文摘或正文中选取的,具有实质意义的专业名词术语,是未经过规范化处理的自然语言。它包括生物体的普通名称、专有名称、属种名称,地理位置,药物的通用名、商品名、系统名,还包括疾病、生物医学技术方法、细胞、组织、普通物质名称等。自1998年105卷起,主题索引的条目由关键词(标目词)、主要概念词、说明语和文摘号组成。左栏中的Keyword作为检索标目,按字顺排列。每一行为一条索引,约60个字符。主题索引使用简便、查找迅速、容易掌握。使用中要注意同义词、近义词及关键词的单复数形式;索引词条后只提供文摘号,文摘号后有时有文献说明;数字开头的关键词排在最后;希腊字母和元素符号要用全称。
(3)生物体索引(Organism Index,OI) 生物体索引由生物分类索引(Biosystematic Index)与属类索引(Generic Index)于1998年105卷起合并而成。在每期生物体索引前,BA均附有主要生物分类等级表(Major Taxonomic Classifications)和生物体索引标题等级表(Hierarchical Headings Used in the Organism Index)。①生物分类等级表按生物分类系统将生物体分为微生物(Microorganisms)、植物(Plantae)、古生物(Paleontology)、动物(Animalia)四大界,界以下又细分为门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Fami-ly)、属(Genus)、种(Species)(1998年前,属、种被列入属类索引)。纲以上类目按生物进化次序由低到高排列,目以下类目(哺乳类为纲以下类目)按字顺排列;②生物体索引标题等级表是生物分类等级表进一步扩展的详表,同时也是每期生物体索引编排和检索的依据。使用生物体索引检索文献,需具有生物分类学的基础知识,必须了解有关生物体的学名,通过主要生物分类等级表和生物体索引标题等级表,确定有关生物体在生物分类体系中的具体位置,然后再根据文献涉及的主要概念词,从索引中检索符合要求的文献。生物体名称后有“?”者,表示该生物体尚未确定。
(4)累积索引 BA的累积索引,1998年前为每半年出版一次,分别为上半年(卷)累积索引和下半年(卷)累积索引,由著者索引、生物分类索引、属类索引、主题索引组成。从1998年105卷起,BA改为每年出版一卷,累积索引改为上半年出版一次半年累积索引,包含上半年1~12期内容,下半年出版一次全卷累积索引(包含全年24期的内容)。由著者索引、生物体索引和主题索引组成,其编排方式和检索方法与期索引相同。
(二)检索途径与方法
1.著者途径
已知著者姓名,即可通过著者索引查到文献。
2.生物索引
生物体的界、门、纲、目、科的分类等级类名时用此检索途径。
3.主题索引
已知生物学和医学术语或生物学名(即属名或属、种名)适用主题途径。
4.组配途径
主题索引与生物索引结合。当检索课题需要浏览的内容比较广泛时,用此检索途径。
三、BIOSIS Previews
(一)数据库简介
BIOSIS Previews(简称BP)由美国BIOSIS出版,是目前世界上规模较大、影响较深的关于生命科学的著名文摘和索引型检索工具之一。该数据库主要包括BA和BA RRM,收录了1969年以来100多个国家和地区将近5500种生命科学期刊以及报告、评论、学术会议、图书、专利、书籍章节和软件评论等非期刊文献。其中2000多种期刊和MEDLINE相重复,3000多种期刊为BIOSIS所独有。数据库检索系统选用了ISI公司的Web of Knowledge平台,建立了快速、灵活和先进的以知识为基础的学术信息资源整合能力,可使用户迅速、全面地获取生命科学及其相关领域的信息。
(二)检索原则
1.通配符
“*”代替无限个字母,但在Topic字段,“*”前至少应有3个字母。例如,CEL*可行,但CE*不可行。
2.截词符
“?”代替一个字母。通配符“*”和截词符“?”均可查找前方一致或拼法不同的词。例如,organi?ation*,结果包括organization、organisation、organizational、organisational等。
3.逻辑运算符
包括SAME、NOT、AND、OR。SAME表示检索词出现在同一个句子中或者一个关键词短语里。在一个检索中出现多个算符时,计算次序为SAME>NOT>AND>OR,可以利用圆括号来提前运算优先级。对于某些相互关联词的检索,最好使用SAME运算符,例如,键入“soil SAME drain*”,可检索到包含有soil drainage或drainage of soil或well-drained soil等的论文,只要soil和drain*在一句子中,无论词与词的顺序如何,均能被检中。另外,在检索词组中,名词含有所有格时也可以使用运算符SAME,如键入paget*SAME diseases可检索到包含有paget's diseases和paget diseases的论文。
(三)检索方法
1.普通检索(Search)
普通检索提供了最基本的检索途径,是用户最常用的检索方法。可检索字段包括:主题、作者或编者、来源刊、作者地址、生物系统分类、主概念、概念代码、化学物质和生化物质、专利权人、会议信息、国际书刊号、专利号。普通检索基本能满足生命科学文献的检索要求(图4-2-9)。
(1)主题(Topic) 输入的检索词大小写不敏感。例如,输入“aids”,可检索出包含“aids,Aids,AIDS”等的文献。有些词因为单独使用时无实际意义,或者出现频率过高,系统规定这些词为禁用词(Stop Words),如in、on、about、a、an、only、do等,不能作为检索词。
图4-2-9 BP的普通检索界面
(2)标题(Title) 检索文章、图书、专利或者系列图书卷名的标题。为了结果准确,在检索时请使用英式拼写和美式拼写两种方法。
(3)主要概念(Major Concepts) 是涉及生命和生物科学领域的相关词汇,用于标示在原文中所涉及的生命科学领域的168个主要学科领域。是科研人员最常用、最有效的检索途径。输入宽泛的主题词,有词表供选择,词表分为两种格式,按字顺排列和按照概念的层级排列。
(4)学科编码(Concept Codes) 5位数的编码,代表生命科学中的广泛学科领域,每一个编码对应着一个学科名称。点击相应的链接可以看到学科编码和相应的名称。学科编码与名称用于标引自1993至今的文献。共计571个5位学科编码代表了生命科学的大类。例如,toxicology的学科代码为22501-22508,可通过通配符检索“225*”而获得。学科编码可以增加检索的准确性,并可以替代多个同义词。
(5)化学和生物化学名称(Chemicals &Biochemicals) 用以描述天然或者合成化学以及活体的化学成分信息。这些术语摘自原文。为了检索结果全面,应检索同义词和不同的术语。在该字段中含有修饰词,其中部分为控制词。1993年前,公式、同位素、元素符号以及离子被转换为扩展形式。1993年后,化学词汇的拼写和使用与原文中保持一致。例如,检索有关苏丹红的研究文献,在本字段下检索“sudan red OR sudan I”。
(6)生物系统分类(Taxonomic Data) 采用自然主题分类法,按照生物界的自然分类系统分类。全部生物体按照类、门、纲、目、科、属、种的顺序排列。大类分为微生物、植物、古生物、动物,每大类分为四级类目(门、纲、目、科)。使用任一生物体科以上类目,都可以查出与该生物相关的文献。输入物种的拉丁名,如MOLLUSCA。
(7)著者(Author) 包括原文中出现的作者、编者或者发明人的姓名。作者姓名的显示方式为:首先是姓,随后是名或者名的首字母。为确保查全率,在作者检索中要注意连字符、空格和撇号,可以用“*”辅助检索,也可以仅输入姓而不输入名字,如SMITH A*,DE LA ROSA E*。检索含有标点符号和空格的作者姓名,应检索含与不含符号2种形式:输入:obrien g*or o'brien g*,可检索:O'Brien G.;O Brien G.;Obrien G.。
(8)地址(Address) 包含源文献中出现的作者、编者或发明人的地址信息。BIOSIS未对地址或者地址缩写词进行标准化。为了得到完整的检索结果,应使用截词和地址的不同写法。输入:univ*same washington,可检索:Georgetown University,Washing-ton,D.C.;Princeton University,Washington Road。
(9)来源出版物(Publication Name) 可以用出版物全名,也可以使用截词符“*”,还可以从出版物列表中选择。如果检索一本书,可以通过主题和出版物2种途径检索。
例1:检索有关蔷薇科植物杀虫剂的研究。分别在“Concept Codes”字段中输入“Pest control:general,pesticides‘and'herbicides”,并在“Taxonomic Data”字段中输入“rosace-ae”。
例2:检索人类感染冠状病毒的报道。在“major concepts”字段输入“infection”,在“Taxonomic Data”字段输入“Coronaviridae and hominidae”。
例3:检索有关中国污染评估控制与管理的相关文献。在“Topic”字段输入“China”,在“Major Concepts”字段输入“Pollution Assessment Control and Management”。
2.高级检索(Advanced Search)
高级检索是一种适用于专家学者的高级检索方法。是由2个大写字母组成的字段代码(如主题(TS)、篇名(TI)、作者(AU)、来源(SO)、地址(AD)、分类学(TA)、会议信息(MI)、主要概念(MC)、概念码(CC)、化学(CH))和4种逻辑运算符,以方便用户构造复杂的逻辑检索式进行检索。
(三)检索结果的保存与输出
检索历史可以保存在本地计算机或者网络计算机上,也可以保存在ISI Web of Knowledge服务器上。保存在当地的检索历史可以重新打开并运行。保存在服务器上的检索历史更容易打开和管理,并可以用于建立定题跟踪服务。请注意您所在机构是否拥有创建定题服务的权限。连接到Search History页面或者Advanced Search页面,点击Save History按钮,即可创建定题跟踪服务。
命中结果显示时,每页最多显示10条记录。总的命中记录数位于页面左下方。输出方式有打印、保存文件、E-mail发送。输出记录格式可自由选择,包括的字段有作者地址、文摘、语种、文献类型、ISSN/ISBN、BIOSIS入藏号、出版信息、勘误表、会议信息、专利信息、BIOSIS主题字段等。同时可对将要输出的文献排序,可选择的有“最新日期”、“第一作者”和“来源出版物名称”3种排序方式。当屏幕上显示出打印格式的记录后,利用浏览器的功能打印或存盘。
(四)其他功能
1.检索结果分析功能
基于Web of Knowledge平台为BIOSIS Previews提供了数据分析功能,可多角度地进行数据挖掘和可视化全景分析,如分析研究发展趋势;发现科学技术热点;揭示论文间的潜在联系等。如图4-2-10示例。在BIOSIS Previews中可供分析的字段有:
(1)专利权人 了解相关的专利主要掌握在哪些专利权人手中。
(2)著者 了解该研究领域的主要研究人员是谁。
(3)主要概念 了解该研究涉及的主要研究领域。
图4-2-10 BP检索结果分析功能示例
(4)文献类型 了解该研究主要的发表文献类型。
(5)文献语种 了解该研究主要是以何种文字发表的。
(6)出版年 了解该研究在哪几年里发表的文献最多。
(7)来源期刊 了解该研究主要刊登在哪几种期刊上。
2.管理功能
基于Web of Knowledge平台的BIOSIS Previews管理功能包括:检索策略管理,E-mail定题、引文跟踪、RSS推送服务管理,全文(链接)管理,参考文献管理,信息共享等。
(戎文慧)
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