第三节 美国学术研究整合平台
美国学术研究整合平台ISI Web of Knowledge是由Thomson Scientific,Inc.提供的学术信息资源整合平台,是供研究人员进行文献检索、数据分析、信息管理不可或缺的核心数据库集合。Web of Knowledge平台整合的书目数据库有Web of Science、ISI Proceedings、Current Contents Connect、Derwent Innovations Index、BIOSIS Previews、MEDLINE、Inspec等,分析工具有Journal Citation Reports(期刊引用报告)和Essential Science Indicators(基本科学指标),另外提供一部分ISI外部资源链接。Web of Knowledge的功能齐全,具有多库检索、单库检索、引文检索、全文链接、分析管理、检索结果提炼、自动跟踪检索、期刊定制、个人文献资料库管理等功能。
2007年10月Thomson Corporation推出Web of Knowledge 4.1版供用户试用,2008年2月新版全面投入使用。本节介绍的是Web of Knowledge的新本。
为了节省篇幅,在Web of Science和ISI Proceedings中介绍过的管理分析等功能,在介绍Web of Knowledge其他数据库中不再重复。不重复介绍的内容包括:输出检索结果、创建引文跟踪、创建定题跟踪、分析检索结果、提炼检索结果。
一、Web of Knowledge主界面及多库检索
Web of Knowledge主界面(图2-3-1)提供多库检索、选单库检索和其他资源检索3个入口,分述如下。
1.All Databases检索 多库(All Databases)检索是Web of Knowledge新版的默认检索界面(图2-3-1),供同时检索Web of Knowledge中的多个子数据库,功能相同于旧版中的跨库检索(cross search)。在“多库检索”页面上,检索提问框右侧的字段下拉菜单提供的字段有Topic、Title、Author、Publication Name、Year Published。选Topic检索,是同时对文献题名、关键词、文摘字段进行检索。
【例8】 通过All Databases检索近5年来“中风(stroke)康复治疗(rehabilitation)的随机对照试验(randomized controlled trial,RCT)”方面的文献。
检索步骤如下:进入ISI Web of Knowledge主页→在All Databases页面的检索提问框内分别输入stroke,rehabilitation,“randomized controlled trial”OR RCT,字段选Topic,布尔算符选AND,Limit to选Latest 5years(图2-3-1),点击“Search”→检索返回300多篇文献→点击文献标题,得到文摘(图2-3-2)。通过文摘页面右侧的View this record in other databases,可见到记录在Web of Knowledge不同子数据库中的记录格式。例如在BIOSIS Previews中可能见到生物体的门、纲、目、科等信息,在Medline中可见到标引的MeSH主题词。通过记录右面的Reference旁的数字链接可得到该文献的参考文献一览,通过Cited by可链接到引用文献一览。
图2-3-1 Web of Knowledge的主页面
图2-3-2 Web of Knowledge中的文摘显示页面
多库检索的优点是引导用户查全文献,它绕开了旧版跨库检索中须选择多个数据库的操作。
2.Select a Database检索 单库检索通过Select a Database链接进入,得到用户所在机构订购的数据库链接一览,继续点击进入Web of Knowledge的子数据库。因受订购经费限制和学科需要,不同机构的用户访问子数据库的权限会有所不同,例如2008年复旦大学的用户可用数据库有Web of Science、Current Contents Connect、ISI Proceedings、Derwent Innovations Index、BIOSIS Previews、MEDLINE、Journal Citation Reports。
3.Additional Resources 其他资源中提供的内容如下。
Analytical Tools:Journal Citation Reports(JCR)(期刊引用报告)——与科学计量学工具结合的具有分析功能的数据库(见本节第七部分)。
Web Search Tools:Thomson Scientific WebPlus——科学研究网络资源搜索工具。
Web Sites网站:ISI HighlyCited.comSM——高被引文献网,BiologyBrowser——生物学浏览器,Index to Organism Names——有机体名称索引,in-cites——重要科研、热点研究观察网,Special Topics®——特殊专题报告。
二、Web of Science
Web of Science是含有引文检索的文摘型数据库和检索化学结构、化学反应的事实型数据库的集合,记录数据主要来源于学术期刊,少数文献有全文链接。由于含有SCI等3个著名引文数据库,在Web of Knowledge的子数据库中,Web of Science影响最大、使用最多。
1.Web of Science的数据来源 Web of Science由以下5个子数据库组成。
(1)Science Citation Index Expanded(SCI-EXPANDED):“科学引文索引扩展版”收录科技期刊5900种,覆盖的期刊数量比SCI印刷版和光盘版多2100余种。SCI Expanded收录1990年至今的来源文献和最早至1900年的被引用文献,每周新增来源文献19000篇,每周新增被引文献约423000篇。
(2)Social Sciences Citation Index(SSCI):“社会科学引文索引”收录1725种社会科学期刊,选择性收录科技期刊3300种,收录来源文献1956年至今,每周新增来源文献2 900篇,每周新增被引文献约60 000篇。
(3)Arts & Humanities Citation Index(A&HCI):“艺术与人文科学引文索引”收录1 144种艺术与人文科学期刊,选择性收录的自然科学和社会科学期刊6 800种,收录来源文献1975年至今,每周新增来源文献2 300篇,每周新增被引文献约15 250篇。
(4)Current Chemical Reactions(CCR):CCR提供了从1985年至今的90万个化学反应,月更新3000多条记录。CCR中的数据来源于39个权威出版机构的一流期刊和专利文献中的单步和多步的新合成方法。每一种方法都提供了完整的化学反应过程,同时伴有详细精确的图形来表示每个化学反应的步骤。该数据库同时收录14万条来自享有极高声望的国家研究所de la Propriete Industrielle的化学反应记录,最早的数据可回溯至18世纪。
(5)Index Chemicus(IC):IC收录1993年以来国际一流期刊上报道的新的有机化合物的化学结构与评论数据,其中许多记录展示了从最初的原料到最终产品的整个化学反应过程。IC是揭示生物活性化合物和天然产品最新信息的重要信息源。IC含记录260余万条,每周更新化合物3 500种。
Current Chemical Reactions和Index Chemicus这两个化学数据库均属事实性数据库,其检索途径有化学结构、化合物名称、化学反应名称、关键词、著者、期刊名、著者所在机构等。
2.Web of Science的检索 Web of Science的检索有Search(常规检索)、Cited Reference Search(引文检索)、Structure Search(化学结构检索)、Advanced Search(高级检索)。在检索之前,可先进入[Change Limits and Settings],从中对文献年份和Web of Science子数据库进行限定(图2-3-3)。
图2-3-3 Web of Science的常规检索页面
(1)Search:常规检索中提供的检索字段有Topic、Title、Author、Group Author(团体作者)、Publication Name、Year Published、Address、Language、Document Type。例如,查2003年以来“禽流感研究”的英文综述文献,在图2-3-3的第一个检索提问框内输入avian influenza or bird*flu,字段选title,第二个提问框后选字段Language,提问框内选English,第三个提问框后选字段Document Type,提问框内选review,页面下面的年份限定设为2003—2008,点击“Search”,检索得到40多篇文献。
Topic和Title是最常用的检索字段。由于Web of Science不设主题词,用Topic和Title检索时要考虑同义词情况。本例中的“avian influenza”和“bird flu”是同义词,都表示“禽流感”,所以用运算符or连接;bird后用截词符,表示出现“birds flu”的文献也要。
(2)Cited Reference Search:Cited Reference Search为引文检索,即通过被引用文献检索到引用文献(图2-3-4)。
在Cited Author检索框内输入被引文献著者,Cited Work框内输入被引文献期刊名,Cited Year(s)框内输入被引文献发表年。以上三者可单独一项检索,也可以同时进行两项、三项“逻辑与”检索。
【例9】 检索丁升于2005年在国际顶尖生物期刊Cell上发表的文献“Efficient transposition of the piggyBac resource(PB)transposon in mammalian cells and mice”被人引用情况,在引文检索页面(图2-3-4)的3个检索框内分别输入ding s、cell、2005,点击“Search”后,得到被引文献索引(Cited Reference Index)(图2-3-5)。
图2-3-4 Web of Science的引文检索页面
图2-3-5 Web of Science的被引文献索引
图2-3-5中,被引文献索引条目从左至右分别表示:被引文献著者(Cited Author)、被引文献所载期刊(Cited Work)、被引文献发表年、卷(Volume)、起始页、被引文献的DOI(Article ID)、引用文献数(Citing Articles)、看被引文献的记录(View Record)。勾选最左侧的复选框,点击“Finish Search”,得到50多篇引用文献(图2-3-6)。
图2-3-6 Web of Science的引文检索结果
(3)Structure Search:通过化学结构图或文本词检索,包括Index Chemicus(IC)回溯至1996,Current Chemical Reactions(CCR-EXPANDED)回溯至1840年的化合物信息和化学反应数据库信息。用“化学结构图”检索之前,须先下载和安装检索化学结构绘图插件MDL?Chime plug-in(可从http://www.mdli.com上下载)(图2-3-7)。
图2-3-7 Web of Science的Structure Search检索界面
(4)Advanced Search:Web of Science中的高级检索只限于来源文献检索,不能进行引文检索。使用高级检索有以下3个优点。
1)可在检索提问框内直接输入带有字段标识符(Field Tags)的检索词或检索式,如TS=(nanotub*SAME carbon)NOT AU=Smalley RE,其中TS表示topic字段,same表示左右检索词出现在同一句句子中。
2)可以进行检索历史保存(Save History)操作,以便日后检索同一课题文献时调用(Open Saved History)。
3)可以利用Search History中先前用过的检索式进行组配检索。这一功能在分离文献被他引和被自引时更显优势。试以丁升2005年发表在期刊Cell上的那篇文献为例:第一步:通过Cited Reference Search检索到引用了丁升该篇文献的文献,在检索历史中得到检索式#1;第二步:在Advanced Search输入AU=ding s,得到检索式#2;第三步:在Advanced Search提问框内输入#1not#2,得到检索式#3(图2-3-8)。
图2-3-8 Web of Science高级检索中的检索历史
从#3检出的记录数与#1检出的记录数相同可以看出,51篇引用文献中没有丁升自引的文献。如果#3的检出数小于#1,则表明引用文献中有丁升的自引文献(严格讲是有ding s引用的文献)。
3.Web of Science的管理和分析功能
(1)Output Records(输出记录):Web of Science的记录输出形式有打印、E-mail发送、存盘(save to)、保存到EndNote Web和保存到其他文献管理软件。输出记录的操作步骤是:勾选记录左边的复选框(图2-3-6)→点击Add to Marked List(这一步在新版中可省略)→在页面下方的Step 1中选需要输出的记录范围,在Step 2中选输出的字段格式→在Step 3中选输出的方式(打印、发电子邮件、保存等,余略)。
(2)保存检索史并创建定题跟踪服务:通过保存检索史(Save Search History)并创建定题跟踪服务,可以定期自动获得某一课题的新文献。创建定题跟踪服务的操作步骤是:在检索返回页面上(图2-3-6)点击“Search History”→在Search History页面上点击Save History/Create Alert→进行用户名和密码登录系统(非注册用户须注册)→在Save Search History页面上进行保存检索历史的命名(History Name)等操作(图2-3-9),勾选Send Me E-mail Alerts选项,选择文献定期发送到电子邮箱中的频率(Weekly或Monthly)等,最后点击Save完成定题跟踪服务的创建。检索史可以选择保存在ISI的远地服务器上,也可以选择保存在本地的计算机上。定题跟踪服务创建成功后,所设定的电子邮箱每周或每月会收到与保存的检索式相匹配的新文献。需要注意的是,定题跟踪服务只限于与检索历史中最新一个检索式匹配的文献(检索式序号最大的),而不是与检索历史中所有检索式匹配的文献。
图2-3-9 保存检索史和创建定题跟踪服务页面
如果只需要保存检索历史以供日后检索调用,而不需要创建定题跟踪服务,在图2-3-9中不要勾选Send Me E-mail Alerts选项。
(3)创建引文跟踪服务:若对某篇特定文献日后被人引用感兴趣,可创建引文跟踪服务(Create Citation Alert)。创建引文跟踪服务后,将来只要有人引用了所设定的文献,用户的电子邮箱就会接收到引用文献的信息。创建引文跟踪服务的操作步骤是:在欲被跟踪文献的全记录显示页面,点击右侧的Create Citation Alert(图2-3-2)→用用户名和密码登录系统→返回的页面上出现This article has been successfully added to your list,表示引文跟踪服务创建成功。
若需要修改或删除已创建的引文跟踪服务,按以下步骤操作:登录Web of Knowledge→点击主页面上部的“My Citation Alerts”→点击Modify Settings→在Citation Alert Settings栏目中进行接收的E-mail地址修改和接收E-mail格式的修改,点击“Submit Changes”完成修改。若在Remove from List栏目中勾选再点击“Submit Changes”,则是删除某引文的跟踪服务。
(4)Web of Science的分析功能(Analyze,Create Citation Report):Analyze分析功能有助于从宏观上把握检索结果的各种分布情况,按文献的某一特征进行同类文献的叠加和进行从高到低的排序,以帮助回答以下问题:某一专题的核心研究人员有哪几位(按Author排序)?某一专题文献的高产国家是哪些(按Country/Territory排序)?某一方面的文献类型分布情况如何(按Document Type排序)?某一专题的权威研究机构有哪些(按Institution Name排序)?某一方面文献的语种分布如何(按Language排序)?某一专题的研究起始于什么年份或历史上研究的高峰期处于什么年代(按Publication Year排序)?某一专题文献主要集中在什么刊物上(按Source Title排序)?某一方面文献所属学科的分布情况和学科交叉情况如何(按Subject Category排序)?
分析功能的分析对象有:对常规检出文献的分析、对引用文献的分析、对相关记录的分析(相关记录是指共同引用一篇或一篇以上参考文献的文献)。以下对常规检出文献分析和引用文献分析各举一例。
【例10】 分析2003年以来“禽流感研究”方面有哪些核心著者。
在检索得到“禽流感研究”文献的返回页面上,点击“Analyze Results”→在Rank the records by this field下拉菜单中选Author(图2-3-10),点击“Analyze”→得到著者分析结果页面(图2-3-11),从中可以看到“禽流感研究”方面的核心著者,以及核心著者发表文献量占该专题总文献量的百分比。继续勾选并点击“View Records”,可以集中显示所选核心著者发表的文献记录。
图2-3-10 Web of Science检索结果分析
图2-3-11 Web of Science中的著者分析结果
【例11】 分析“丁升2005年发表于期刊Cell上的这篇文献”被哪些机构引用。
通过Cited Reference Search检索到该篇文献的引用文献一览(图2-3-6)→点击“Analyze Results”→在Rank the Records by this field下拉菜单中选Institution Name(参见图2-3-10),点击“Analyze”→得到引用文献的机构分析结果。
对引用文献进行分析,可以了解:哪些学者、哪些机构、哪些国家或地区在延续某一研究领域的工作?文献被引用的高峰期是否已过(从而可以判断被引文献对目前研究的影响力大小)?所关心的文献主要被哪些刊物引用(以便确定日后期刊选读和投稿方向)?引用文献的学科领域分布情况如何(从中可了解某课题研究的学科交叉趋势)?
Create Citation Report建立引文分析报告,可以对检出结果进行学科趋势的分析。系统建立两个直方图,显示相关课题近20年每年发表的文献量和近20年每年的引文量。另外,系统建立个表,显示相关课题近20年每篇文献的引文量和引文记录,从而让研究者了解高被引文献和课题研究趋势。
三、ISI Proceedings
ISI Proceedings是报道会议文献和会议信息的书目数据库。
1.ISI Proceedings概况 ISI Proceedings收录6万多个会议的450多万条会议论文记录,年增加记录23万条,收录时间1990年至今,数据每周更新。ISI Proceedings由Science&Technology Proceedings(STP)和Social Sciences &Humanities Proceedings(SSHP)两部分组成,前者内容与ISTP(Index to Scientific &Technical Proceedings)一致,涵盖农业、环境科学、生物化学、分子生物学、生物技术、医学、工程、计算机科学、化学、物理学等,后者涉及心理学、社会学、公共卫生、管理学、经济学、艺术、历史、文学、哲学等领域。ISI Proceedings中约有70%的信息是科技期刊中得不到的。
2.ISI Proceedings的记录字段 ISI Proceedings中的记录字段主要有(与其他数据库重复的省略):Title(会议论文题目或会议论文集的前言题目等)、Editor(会议论文集的编者)、Conference Information(会议信息)、Keywords Plus(附加关键词,从文章后参考文献标题中提取的关键词)、Subject Category(期刊的主题分类,与JCR中期刊的主题分类一致)等。
3.ISI Proceedings的检索 ISI Proceedings的检索有Search和Advanced Search两种。
(1)Search:Search检索中的检索字段选择有Topic、Title、Author、Group Author、Publication Name(查期刊名或会议论文集名)、Address、Year Published、Conference(检索词包括会议名称、会议地点、会议时间、会议主办者)、Document Type、Language(图2-3-12)。
例如,欲检索2007年在芝加哥召开的第67届美国糖尿病学会年会上的会议文献,在Search的检索提问框内输入American Diabetes Association AND Chicago AND 2007,字段选Conference,点击“Search”,得到2700多篇该次会议的会议文献。
(2)Advanced Search:在Advanced Search中,可直接在检索词前加字段限定符,还可对已检索过的检索式进行布尔逻辑组配检索。
图2-3-12 ISI Proceedings的常规检索
【例12】 检索“生物传感器与水污染关系”的文献。
操作如下:先在Search状态下输入water pollut*,字段选Topic,点击Search,得到检索式#1;在Advanced Search中输入ts=(biosensor$AND(pollut*OR contamin*OR tox*)),点击Search,得到检索式#2;在Advanced Search页面检索历史(Search History)的Combine Sets栏中勾选#1和#2,再勾选and,点击“Combine”,得到70多篇相关会议文献。
4.提炼检索结果(Refine Results) 通过检索返回页面左侧的Refine Results,可将检出记录按同一字段中的同一属性集中显示,例如出自于同一会议的文献、刊登于同一期刊的文献、同一主题分类的文献、同一种类型的文献、同一著者的文献等。在提炼检索结果时,出现频率高的字段信息排列在前,以便优先选择。点击“Hide Refine”可屏蔽掉提炼检索结果区域(图2-3-13)。
图2-3-13 ISI Proceedings中的提炼检索结果页面
【例13】 检索近几年来“水污染”方面的会议文献,并将检索结果按会议名称提炼。
检索及提炼步骤如下:在Advance Search页面输入ts=“water pollution”AND py=2005—2008,点击Search→得到200多篇相关会议文献,点击检索历史中的检出篇数链接→在返回的检索结果页面左侧,点击Refine Results下的Conference Titles左侧的三角图形→在Conference Titles下勾选文献出现频率最高的5个会议(若要提炼更多的会议文献,点击more),点击“Refine”→屏幕返回选定的5个会议上“水污染”方面文献27篇。
四、Current Contents Connect
Current Contents Connect简称CCC,中文名称“现刊目次快讯”,是一个以快见长的多学科文摘型数据库。CCC收录期刊8000余种、图书2000余种和4400多个经过评价的学术网站信息,数据每日更新,收录文献1998年至今。
1.CCC的子数据库 CCC按学科分有9个子集,其中称为Current Contents Editions的7个子集是:
Agriculture,Biology & Environmental Sciences(ABES)
Social & Behavioral Sciences(SBS)
Clinical Medicine(CM)——收录1120种期刊及图书信息
Life Sciences(LS)——收录1370种期刊及图书信息
Physical,Chemical & Earth Sciences(PCES)
Engineering,Computing & Technology(ECT)
Arts & Humanities(AH)
2个称为Current Contents Collections的子集是:
Business Collection(BC)
Electronics &Telecommunications Collection(EC)
2.CCC的检索 CCC的检索有Search、Advanced Search、Browse Journals 3种(图2-3-14)。
图2-3-14 CCC的常规检索
(1)Search和Advanced Search:CCC中的常规检索和高级检索与Web of Knowledge中其他子数据库的检索基本一致,试举一例:通过高级检索查Collins jd发表的“食品安全与质量”方面文献,检索步骤是:进入Advanced Search,在检索提问框内输入ts=(food and(safety or quality))and au=Collins jd,点击Search得到11篇相关文献。
(2)Browse Journals:期刊浏览供浏览指定期刊上的文献或网站信息,检索途径有刊名字顺浏览(Browse by Journal Titles)和CCC子集浏览(Browse by Current Contents Edition)。CCC子集浏览检索的路径是:进入Browse Journals→选CCC子集名→分别点击学科名下的“期刊目次”→刊名→期→目次→记录→全文(部分记录有全文)。例如,检索胸外科杂志上的最新文献,可作如下操作:从CCC主页进入Browse Journals页面→点击Clinical Medicine→点击CARDIOVASCULAR &RESPIRATORY SYSTEMS下的Tables of Contents of Journals→点击ANNALS OF THORACIC SURGERY→点击该刊最新一期的链接→点击期刊目次中的某篇文献标题→得到记录的题录和摘要。若要进一步了解该文章的参考文献或引用文献,分别点击记录右侧“References”和Cited by旁的数字。浏览最新文献时,Cited by的数据往往为零,是因为最新的文献尚未被引用。
除了期刊文献,CCC的Browse Journals中还提供Current Web Contents——由ISI专业人员编辑评估的5000多个的专业网站信息。网站记录的主要字段有:网站名、网页链接、网站描述、关键词、网站编辑机构、最近评价日期等。例如,在子集Clinical Medicine中的CARDIOVASCULAR &RESPIRATORY SYSTEMS下,点击Current Web Contents,得到近200个“心血管与呼吸系统”方面的网站介绍和网页链接。
3.CCC的特色 CCC的最大特色是报道文献及时,一些尚在印刷中的期刊可见于CCC最新卷期中(用eFirst标记),且数据每日更新。其他特色还有:可看到期刊的目次;按分集编辑出版,可使机构订购和用户检索更具针对性;部分期刊有全文链接(取决于用户所在单位是否订购了该刊的电子版);文献记录中有参考文献链接和引用文献链接的比例多;可检索到由ISI专业人员评价编辑的专业网站信息。
五、BIOSIS Previews
BIOSIS Previews简称BP,是世界著名的生命科学文摘型数据库。BP收录期刊5500多种,内容涵盖植物学、动物学、微生物学、生物医学、农学、药理学、生态学、临床医学、生物化学、生物物理学、生物工程、生物技术等领域,文献类型有期刊论文、综述、会议文献、报告、图书、美国专利等。BP内容来自于Biological Abstracts(BA)和Biological Abstracts/RRM(Reports,Review,Meetings)两种检索工具,收录了1969年以来的1400余万条记录,年增记录56万条,数据每周更新。
1.BP的字段 与其他数据库相比,BP记录中的字段稍显复杂,多个字段具有生物学特征。列举部分字段如下。
Concept Code——概念代码,是对应于某一概念的五位数编码,例如,17502表示Muscle-Anatomy(肌肉-解剖)、22022表示Pharmacology-Muscle system(药理学-肌肉系统)。
Chemical Data——包括化合物名称、化学物质登记号、药物的类别(Drug Modifier)等。
Diseases Data——包括动植物和人类的疾病名、疾病的MeSH词、疾病所属的类别(Disease Affiliation)等。
Gene Name Data——包括基因名称、基因的同义词等信息。
Geographic Data——文献涉及的地理名称。
Major Concepts——反映原文所属学科领域,如Genetics(遗传学)、Wildlife Management(野生动植物管理)。
Methods & Equipment——用以表述原文涉及的方法、仪器和技术手段。
Miscellaneous Descriptors——BP标引人员标引的其他信息。
Parts & Structures Data——用以表述大分子层级以上的生物体的组成部分,如细胞、组织、器官和人体系统。
Patent Number——专利号。
Sequence Data——包括分子序列号、分子序列的名称、化学物质登记号,分子序列的种类等。
Taxonomic Data——列出文献涉及的生物分类等信息,分有以下几个子栏目:①Super Taxa:列出文章涉及生物体的上位生物分类名,按生物分类等级从低到高排。例如,研究对象为人,列出Primates(灵长目)、Mammalia(哺乳纲)、Vertebrata(脊椎动物亚门)、Chordata(脊索动物门)、Animalia(动物界)。②Taxa Notes:列出生物体所属的界、门、纲、目、科的普通英文名。③Organism Classifier:列出生物体系代码(Biosystematic Code)和名称。生物体系代码是五位数字的编码,代表某一等级的生物分类。例如,Reptilia(爬行纲)的代码是85400,Muridae(鼠科)的代码是86375。④Organism Name:列出生物体的常用名称。⑤Details:其他说明,如年龄、性别,等等。
2.BP的检索 BP的检索途径有Search和Advanced Search两种。
(1)Search:常规检索提供的字段选择如下。
Topic——在文献的标题、文摘、主要概念词、疾病、化合物等10多个反映文献主题的字段中检索。
Publication Name——输入刊名书名的全称,或输入刊名书名的前半部分,后跟截词符*。
Taxonomic Data——输入生物分类体系名称或代码,也可从生物体分类表organism classifiers(通过Taxonomic Data索引进入)中查询到生物体的分类等级名称后,添加检索词到检索框进行检索。
Major Concepts——输入168个主要概念词之一,或从Browse Major Concepts Hierarchy中查询到主要概念词后添加到检索提问框再进行检索。
Concept Codes——可直接输入概念代码或概念标题(Concept Heading)检索,也可从Concept Codes索引中查询到概念标题后添加到检索框内检索。
Chemical and Biochemical——输入化合物名称、基因名、序列数据、化学物质登记号,实际上是在Chemical Data、Gene Data、Sequence Data这3个字段中进行检索。
Meeting Information——会议名称、会议地点、会议主办者、会议时间检索。
Identifying Codes——检索词包括记录顺序号(accession number)、ISSN、ISBN、专利号、美国专利分类号、专利授予日期。
在字段检索下拉菜单旁有放大镜图标,表示可链接到该字段的索引检索页面,进行索引浏览检索。
(2)Advanced Search:除标题等常见字段,BP高级检索中的可检字段还有:DS=Disease,TA=Taxonomic,MC=Major Concepts,CC=Concept Code,CH=Chemical,GN=Gene Name,SQ=Sequence,CB=Chem & Biochem,CA=CAS Registry No.,PS=Parts &Structure,MQ=Methods &Equip,GE=Geographic,GT=Geological Time,DE=Misc.Descriptors,AN=Patent Assignee,MI=Meeting Info,IC=Identifying Codes。
3.BP的检索举例
【例14】 通过Search中的Concept Codes字段检索“水溶性维生素营养”方面文献。
进入BP的Search页面,输入vitamin,字段选Concept Codes,点击Search→未得到检索结果,表明vitamin不是概念标题(Concept heading)。点击字段右侧的放大镜图标,进入Concept Codes的索引,在检索提问框内输入vitamin,点击“Find”→在返回的Concept Codes索引检索结果中见到“13210Nutrition-Water-soluble vitamins”,点击该条索引词左侧的add→屏幕下方的检索框内出现该检索词(图2-3-15),点击“ok”→检索词被粘贴到Search检索页面的提问框内,点击“Search”执行检索。
图2-3-15 BIOSIS Previews的Concept Codes浏览检索
(2)通过Advanced Search检索近3~4年来“血红蛋白及葡萄糖与糖尿病关系的鼠类动物实验”方面的英文文献。
在Advanced Search页面上,在检索框内输入CH=(Hemoglobin AND glucose)AND DS=diabetes AND TA=muridae AND PY=2005—2008,在检索提问框下面的语言限定栏中选English,点击“Search”,检索返回约100篇相关文献。
4.BP的特色和检索要领
(1)提供生物分类信息和生物分类限定检索:BP记录的Taxonomic Data字段提供生物体的分类名称和有关信息。检索时可利用Taxonomic Data字段将检索限定于某一生物分类范围内,再与其他检索词进行组配检索,以提高文献的查准。例如,研究对象为人,可选Taxonomic Data字段,检索词用human或hominidae(人科),再与其他检索词进行逻辑与检索。
(2)辅助索引多:在Search和Advanced Search页面,通过字段右边的放大镜图标可进入到多个辅助索引。有辅助索引的字段有:Author、Publication Name、Taxonomic Data、Major Concepts、Concept Codes。在BP检索过程中,多利用辅助索引可帮助选词和扩展生物分类知识。
(3)字段多:BP共有30多个字段。字段多的优点之一是可见文献涉及的更多信息,二是有更多的检索切入点供选择。对于不熟悉BP某些主题字段的检索新手,亦可多利用Topic检索,因为BP的Topic检索包括对文献标题、文摘、生物分类体系、主要概念、化合物、疾病等15个涉及主题的字段进行检索。
(4)便于检索新的物种:对于新的生物物种,在Taxonomic Data字段的Organism Classifier栏目里会出现New或*,例如Osteichthyes[85206-New]。因此,若要检索新的生物物种,作如下操作:在Search检索中选字段Taxonomic Data,检索式用Osteichthyes SAME new;在高级检索中,用检索式ta=(Osteichthyes SAME new)。
六、Derwent Innovations Index
Derwent是全球最权威的专利情报和科技情报机构之一,1948年由化学家Monty Hyams在英国建立。Derwent Innovations Index简称DerwentⅡ,是Derwent编辑出版的报道专利和专利引文的数据库。
1.DerwentⅡ的数据来源和组成部分 DerwentⅡ收录世界上40多个专利机构的1480万项专利发明和3000多万条专利信息,数据来源于Denwent World Patents Index(DWPI),Patents Citation Index(PCI)和Derwent Chemistry Resource(DCR)。DerwentⅡ由Chemical、Electrical and Electronic、Engineering 3个部分组成,收录专利文献从1963年至今,数据每周更新。
2.DerwentⅡ的检索 DerwentⅡ的检索有Search,Cited Patent Search(专利引文检索),Compound Search(化合物检索)和Advanced Search。
(1)Search:常规检索中的字段检索如下。
Topic——在专利文献的标题、文摘字段中检索。
Assignee——用专利权属机构名或其代码检索。
Inventor——通过专利发明人检索。
Patent Number——专利号检索,例如WO2007047207-A2(世界知识产权组织专利号),或US2007123522-A1(美国专利号)。
International Patent Classification——国际专利分类号(IPC)检索。IPC由世界知识产权组织(WIPO)编制。
Derwent Class Code——Derwent专利分类号检索。
Derwent Manual Code——Derwent手工分类号(又称指南代码)检索。Derwent手工分类号比Derwent专利分类号更详细。
Derwent Primary Accession Numbers(PAN)——Derwent专利记录顺序号检索,例如1999-468964(前4位数为出版年份,后6位为顺序号)。
Ring Index Number——(5位数的)环系化合物索引号检索。
Derwent Compound Number——Derwent化合物编号,用Merged Markush Service(MMS)数据库中的化合物编号进行检索。
Derwent Registry Number(DRN)——Derwent登记号检索,用于对Derwent WPI中最常用的2 100种化合物进行检索。
DCR Number(Derwent Chemistry Resource Number)——Derwent化学资源号检索。化学资源号的前8位数代表特定化合物,第一个后缀(1~2位数)表示化合物的立体结构,第二个后缀表示盐,第三个后缀表示物理状态、同位数等。
(2)Cited Patent Search 专利引文检索供检索了解专利被引情况,其检索途径有以下4种(图2-3-16):Cited Patent Number——被引专利号检索,即检索指定专利被人引用情况;Cited Assignee——被引专利权属机构名或其代码检索,检索某机构的专利被人引用情况;Cited Inventor——被引专利发明人检索,检索某一专利发明人发明的专利被人引用情况;Cited Derwent Primary Accession Number——被引Derwent专利记录顺序号检索。
图2-3-16 Derwent Innovations Index中的专利引文检索
【例15】 检索专利号为US5723945-A专利被引用情况。
操作步骤如下:在DerwentⅡ数据库中选Cited Patent Search→在Cited Patent Number检索框内输入US5723945-A,点击“Search”→检索返回18篇引用了该美国专利的专利文献。在引用专利记录显示页面上,点击“Original”,得到引用专利文献的说明书。
(3)Compound Search Compound Search供检索数据库Derwent Chemistry Resource(DCR)的内容。DCR既是一个供检索特定化合物的化学结构及其他化学信息的事实性数据库,也是检索Derwent书目数据库中化学专利的索引系统。
Compound Search中的检索途径有Structure Detail(化学结构图检索)和文本词(text)检索。进行化学结构图检索要先下载检索插件MDL?Chime plug-in,否则无法画图检索,也无法读到检出的化学结构图。文本词检索的途径有Compound Name(化合物名称,可用常用名,也可用系统命名),Substance Description(化合物描述词,例如alkaloids),Structure Description(化学结构描述词,例如isotope labeled),Standardized Molecular Formula(标准分子式),Molecular Formula(Derwent系统采用的分子式),Molecular Weight(分子量,例如60、<237、>123),Derwent Chemistry Resource Number(Derwent化学资源号)。
(4)Advanced Search DerwentⅡ的高级检索与Web of Knowledge其他子数据库的不同之处是可进行引文检索,如cp=EP797246,表示检索欧洲专利EP797246被引用情况。
(5)检索举例:查近6年来“治疗哮喘的吲哚衍生物”方面的专利文献,检索步骤如下:进入DerwentⅡ的Search→在[Change Limits and Settings]中选子集Chemical Section,时间段选2003—2008,在检索框内输入indole SAME derivative*AND asthma,字段选Title,点击“Search”→检索返回近40条记录→点击专利题录下的“Original”链接,可读到PDF格式的专利说明书全文。
七、Journal Citation Reports
期刊引用报告(Journal Citation Reports,JCR)是多学科期刊的评价工具。JCR通过对收录期刊的发文量和引文量等数据的统计,供科研人员分析比较期刊的质量,了解期刊在本学科中的排名等信息。通过JCR可以查询到:哪些期刊被使用频率最高?哪些期刊在本学科中影响力最大?哪些期刊发表文章最多?哪些期刊文后的参考文献最多?哪些学科文献被利用最广泛等?
1.JCR的出版情况和收录信息 JCR一年出版一次,其网络版分“自然科学版”(Science Edition)和“社会科学版”(Social Sciences Edition)。2006年JCR的“自然科学版”收录6164种科技期刊,“社会科学版”收录1768种社会科学期刊。被JCR收录的期刊必须被Web of Science和Current Contents Connect收录期满3年。
JCR中提供的数据和信息有:期刊名(缩写)、ISSN、总引用次数(Total Cites,即参考文献总数)、影响因子(Impact Factor)、即时指数(Immediacy Index,期刊当年发表的文献在当年平均被引用的次数)、发表文献数(Articles,不包括Editorials,Letters,Meeting Abstracts等)、期刊被引半衰期(Cited Half Year)、引用期刊一览(Citing Journal Listing)、被引期刊一览(Cited Journal Listing)、期刊的基本信息等。
2.影响因子(Impact Factor) JCR中最有用的数据项是期刊的影响因子。影响因子简称IF,指某刊前两年发表的论文在评价当年平均被引用的次数,即把某刊前两年的文献在当年被引用的次数作为分子,该刊前两年发表的文献数作为分母得出的数值。
【例16】 2006年期刊Human Biology的影响因子统计方法如下:
该刊2004年和2005年发表的文献在2006年被引用次数分别为90次和47次,合计为137次;该刊2004年和2005年的统计范围内的文献发表数分别是63篇和58篇,合计为121篇,前者除以后者等于1.132,即该刊2006年的影响因子为1.132。
期刊影响因子越大,表示该期刊文献的平均利用率越高,由此可推理出该期刊的质量越高。利用期刊的影响因子,可以帮助选购馆藏期刊,确定各学科的核心期刊,指引期刊选读和投稿。
3.JCR的检索 对JCR进行检索,首先选Science Edition或Social Sciences Edition之一,并在右侧的下拉菜单中选择年份,然后选择右面的3个检索入口(Select an option)之一(图2-3-17)。
图2-3-17 JCR检索主页面
(1)View a group of journals by:该检索入口又分有Subject Category(主题分类,又称学科)、Publisher(出版商)、Country/Territory(国家/地区)3个选项。
【例17】 检索生物学领域影响因子最高的期刊。
检索步骤如下:在图2-3-17中选Science Edition,年份选2006→检索途径选View a group of journals by中的Subject Category,点击“Submit”→在Select one or more categories from the list中选Biology,点击“Submit”→得到60多种生物学方面的期刊概要一览,在Sorted by下拉菜单中选Impact Factor,点击Sort again→得到按期刊影响因子从高到低排序的期刊概要一览(图2-3-18)。可见,2006年影响因子最高的生物学期刊是PLOS BIOLOGY,影响因子为14.1。继续点击期刊名,可得到该期刊的进一步信息。
(2)Search for a specific journal:“检索特定期刊”的检索词可以是刊名全称、刊名缩写、刊名中的单词、期刊的ISSN。
(3)View all journals:在JCR所列全部期刊列表中浏览检索。
4.JCR的检索结果处理 JCR检索结果的输出有打印和保存两种方式,操作步骤是:在检出的期刊概要一览(Journal Summary List)中(图2-3-18),在需要输出期刊的Mark复选框内勾造,点击Update Marked List→点击Marked List→点击Save to file进行保存,或通过Format for Print进行打印。
图2-3-18 JCR中的期刊概要一览
5.JCR学科数据检索 通过JCR中的View Category Data(图2-3-19),可以了解一个学科文献被利用程度和学科的知识老化速度等,还可对学科之间文献被利用程度等进行比较。
图2-3-19 JCR的学科数据检索
(1)JCR的学科数据:JCR中的学科数据(Category Data)如下。
Total Cites——总引用次数,即学科中期刊所列参考文献总数。
Median Impact Factor——中值影响因子。
Aggregate Impact Factor——学科综合影响因子。
Aggregate Immediacy Index——学科综合即时指数。
Aggregate Cited Half-Life——学科综合被引半衰期。
(2)中值影响因子:“中值影响因子”取自于一个学科中影响因子排序居中的那个期刊的影响因子。若某一学科的期刊为双数时,取影响因子居中的两种期刊影响因子的平均数为该学科的中值影响因子。
(3)学科综合影响因子:“学科综合影响因子”指前两年本学科期刊上的文献在统计当年被平均引用的次数,即分子是该学科期刊前两年发表的文献在统计当年被引用的次数,分母是该学科前两年发表文献的总数。
(4)学科数据检索举例。
【例18】 检索Allergy和Anesthesiology的学科数据。
检索步骤是:在JCR主页上选JCR Science Edition和2006,检索途径选View a group of journals by中的Subject Category(图2-3-17),点击“SUBMIT”→在Select one or more categories from the list中选Allergy和Anesthesiology,勾选View Category Data(图2-3-19),点击“SUBMIT”→得到Subject Category Summary List(图2-3-20),从中可见这两个学科的中值影响因子和学科综合影响因子等数据。继续点击学科名链接,可以看到该学科各种数据的统计方法和数据图表。
图2-3-20 JCR的学科数据检索结果——学科概要一览
查询学科数据也可以先检索到某学科的所有期刊,在期刊概要一览页面上(图2-3-18)点击“View Category Summary List”。反之,在学科概要一览页面上(图2-3-20),点击“View Journal Summary List”,可以切换到该学科的期刊概要一览。
八、Web of Knowledge的个性化定制和管理
在Web of Knowledge检索页面上方有个性化定制栏目,其功能和作用如下。
1.Sign In 通过Sign In(登录)注册成为Web of Knowledge的注册用户,可以享用该检索平台的多种个性化服务。
2.My EndNote Web EndNote Web是个人电子文献管理软件,供存放用户检索输入或手工输入的文献资料。登录进My EndNote Web,可对检索积累的文献资料进行整理和再检索,并可在写作时创建符合特定期刊格式要求的参考文献清单。
3.My ResearcherID ResearcherID是一个供研究人员交流与合作的网站(www.ResearcherID.com)。在这个网站上,受到邀请的科研人员可上传和更新自己的个人简介,创建自己的论著清单,让同行共享(或不共享)自己的个人信息,旨在扩大同行之间科研合作的机会。
4.My Citation Alerts 对自己创建的引文跟踪服务进行管理,包括更改接收的E-mail地址、续订引文跟踪服务(系统默认的引文跟踪服务有效期为一年)、创建RSS Feed、删除引文跟踪服务。
5.My Journal List 供定制和修改自己感兴趣的期刊。期刊定制后,系统会自动将选定期刊最新期的目次以E-mail或RSS Feed形式发送给用户,也可以直接在Web of Knowledge主页打开定制期刊最新期的目次。创建“我的期刊列表”的前提是用户所在机构订购了Current Contents Connect。
6.My Saved Searches 对保存的检索历史和定题跟踪服务进行管理。
习题
1.Web of Knowledge和Web of Science分别由哪些部分组成?
2.Web of Science的文摘显示页面上的Cited by和References旁的数字表示什么?哪一项数据是动态的?
3.什么是影响因子?如何检索?
4.通过Web of Knowledge的All Database检索近5年来“肺癌与吸烟关系”的文献,并分析核心著者有哪些?(提示:lung cancer,lung carcinoma,smoking)
5.通过Web of Science的Cited Reference Search检索“闻玉梅1995年发表在Lancet上的一篇文献被人引用”情况,看看引用文献中有哪些文献类型?提炼出其中的综述文献。
6.通过JCR查2006年皮肤病学(Dermatology)影响因子最高的期刊。
(夏知平)
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