【摘要】：随着生物信息学的飞速发展，大量的数据库和分析工具应运而生，它们是生物信息学的重要内涵。分子生物信息学的发展极其迅速，本章的内容并不能反映其全部及最新进展。2008年，生物信息学数据库总数已达1 078个。
第一节 生物信息学数据库概述
生物信息学是一门交叉科学，它包含了生物信息的获取、处理、存储、分发、分析和注释等在内的所有方面，它综合运用数学、计算机科学和生物学的各种工具，来阐明和理解大量数据所包含的生物学意义——美国人类基因组计划实施5年后的总结报告。随着生物信息学的飞速发展，大量的数据库和分析工具应运而生，它们是生物信息学的重要内涵。这些数据库有些是国际性的，有些是地区的，有些在互联网上提供免费使用，有些则通过协议供学术单位使用。这些数据库各有特色，有的趋向综合性，有的追求专业性。本章节主要介绍的是当前基于Web的一些著名的数据库和流行软件。分子生物信息学的发展极其迅速，本章的内容并不能反映其全部及最新进展。
Nucleic Acids Research杂志每年的第一期中详细介绍最新版本的各种数据库。在2000年1月1日出版的28卷第一期有115种数据库。2008年，生物信息学数据库总数已达1 078个。Nucleic Acids Research杂志网站将刊登的生物信息学相关数据库分成14大类，包括：①核酸序列数据库；②RNA序列数据库；③蛋白质序列数据库；④结构数据库；⑤基因组数据库；⑥代谢酶相关产物；⑦人类和其他脊椎动物基因组；⑧人类基因和疾病；⑨其他数据和其他基因表达数据库；⑩蛋白组资源；
其他分子生物学数据库；
细胞器官数据库；
植物数据库；
免疫学数据库。每个大类下再逐级细分小类，并直接链接到相关数据库。以下对主要数据库内容进行简要介绍。
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