要在患者知情同意的前提下制定治疗计划，患者应该参与计划的最后确定。这个时期的细致工作可以减少日后医患的纠纷。
（一）制定以主诉问题为起步的局部治疗方案
1. 主诉牙的治疗计划 如果患者主诉的症状涉及的是一颗患牙，则应该制定对该患牙的治疗方案，包括牙髓治疗、牙体修复和牙周的治疗。同时应该告知患者复查追踪疗效的时间。
2. 针对其他口腔问题的治疗计划 经常地，患者寻求医师只是一个局部的问题，因此制定治疗计划可以分为两个部分：第一部分是围绕主诉的诊断与治疗计划；第二部分是针对更多口腔问题（不限于牙体牙髓疾患）的治疗计划。第一部分针对主诉的部分也应该是整个针对全口腔治疗计划的一个部分，不应该有冲突。两个部分的计划均应该有患者的知情同意（可分开签署）。
3. 牙髓治疗方法的选择，替代方法与不治疗 医师有责任向患者介绍目前临床和科学证明有效的方法，同时也要介绍目前国家医政管理部门允许使用并且本院也使用的替代方法，介绍各自的优缺点，由患者自主选择。患者可以选择不治疗，医师需要向其说明相关的后果。医师应尊重患者不治疗的选择。
4. 牙体缺损修复方法和修复材料的选择 医师要向患者介绍所有的正在和允许使用的方法与材料。介绍各自的优缺点，由患者自主作出选择。
（二）给出口腔整体状况的分析意见
1. 对龋易感性的评估意见 根据获得的信息对患者的龋齿易感性给出诊断性评估意见，提出预防和控制的方法与意见。
2. 对牙周病易感性的评估意见 根据获得的信息对患者牙周病易感性给出诊断性评估意见，提出预防和控制的方法与意见。
3. 对口腔保健与饮食习惯给出适当评价与指导 针对患者的口腔保健状况、饮食与生活习惯中不利口腔健康的因素给出具体的意见。
告知患者上述意见对于维持口腔治疗的效果是必要的。
（三）给出整体考虑下的口腔治疗计划或建议
1. 校正不足的口腔卫生保健，建立有效的菌斑控制方法 这是牙体牙髓病治疗疗效得以维持的前提。要花一点时间与患者沟通，让患者理解并实施有效的方法。要检查效果，让患者体会到进步并坚持。
2. 校正不良的饮食习惯 龋齿、酸蚀症、磨损这些发生在牙体组织的疾病都与不良的饮食习惯有关。不良习惯得不到纠正，治疗效果难以保证。
3. 治疗牙髓病 要在确定患牙在口腔中的位置并有了全面的口腔疾病治疗计划之后，才开始对牙髓病的治疗。
4. 治疗牙周病 需要控制与治疗已有的牙龈和牙周疾病。
5. 修复牙体缺损 需要在牙龈、牙周炎症和出血情况得到控制之后再进行牙体的缺损修复。对于根管治疗后的牙体修复，应该尽可能早，以获取可靠的冠方封闭。对于因需要观察根尖周病变愈合，暂时不适宜复杂修复的，可以使用玻璃离子水门汀或复合树脂进行过渡性修复。
其他口腔问题的进一步诊断与治疗：对于需要进一步诊断和治疗的其他的口腔问题，要告知患者，积极转到其他分支领域专家那里就诊。
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