2009年5月8日我国卫生部组织专家在《人感染猪流感诊疗方案（2009版）》的基础上，结合世界卫生组织和其他国家甲型H1N1流感最新诊疗经验和相关资料，研究制定了《甲型H1N1流感诊疗方案（2009年试行第一版）》。其中规定了4种治疗方案：
(1)一般治疗。休息，多饮水，密切观察病情变化；对高热病例可给予退热治疗。
(2)抗病毒治疗。应及早应用抗病毒药物。初步药敏试验提示，此甲型H1N1流感病毒对奥司他韦(达菲oseltamivir)和扎那米韦（zanamivir）敏感，对金刚烷胺和金刚乙胺耐药。奥司他韦应尽可能在发热48小时内使用（36小时内最佳），疗程为5天。奥司他韦的成人用量为75毫克每日2次。1岁及以上年龄的儿童患者应根据体重给药：体重不足15千克者，予30毫克每日2次；体重15～23千克者，45毫克每日2次；体重23～40千克者，60毫克每日2次；体重大于40千克者，75毫克每日2次。对于吞咽胶囊有困难的儿童，可选用奥司他韦混悬液。
(3)其他治疗。①如出现低氧血症或呼吸衰竭的情况，应及时给予相应的治疗措施，包括吸氧、无创机械通气或有创机械通气等。②出现其他脏器功能损害时，给予相应支持治疗。③对病情严重者（如出现感染中毒性休克合并急性呼吸窘迫综合征），可考虑给予小剂量糖皮质激素治疗。不推荐使用大剂量糖皮质激素。④合并细菌感染时，给予相应抗菌药物治疗。
(4)中医辨证治疗。
①毒袭肺卫。
症状：发热、恶寒、咽痛、头痛、肌肉酸痛、咳嗽。
治法：清热解毒，宣肺透邪。
参考方药：炙麻黄、杏仁、生石膏、柴胡、黄芩、牛蒡子、羌活、生甘草。
常用中成药：莲花清瘟胶囊、银黄类制剂、双黄连口服制剂。
②毒犯肺胃。
症状：发热或伴有恶寒、恶心、呕吐、腹痛腹泻、头痛、肌肉酸痛。
治法：清热解毒，化湿和中。
参考方药：葛根、黄芩、黄连、苍术、藿香、姜半夏、苏叶、厚朴。
常用中成药：葛根芩连微丸、藿香正气制剂等。
③毒壅气营。
症状：高热、咳嗽、胸闷憋气、喘促气短、烦躁不安、甚者神昏谵语。
治法：清气凉营。
参考方药：炙麻黄、杏仁、瓜蒌、生大黄、生石膏、赤芍、水牛角。
必要时可选用安宫牛黄丸以及痰热清、血必净、清开灵、醒脑静注射液等。
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