1.通常血糖仪采用毛细血管全血葡萄糖，而实验室检测的是静脉血清或血浆葡萄糖，采用血浆校准的血糖仪检测数值空腹时与实验室数值较接近，餐后或服糖后毛细血管葡萄糖浓度会略高于静脉血浆葡萄糖；若用全血校准的血糖仪检测数值，空腹时较实验室血浆葡萄糖数值低12%左右，餐后或服糖后毛细血管葡萄糖浓度与静脉血葡萄糖浓度较接近。
2.由于血糖仪采用血样大多为全血，因此血细胞比容影响较大，相同血浆葡萄糖水平时，随着血细胞比容的增加，全血葡萄糖检测值会逐步降低。若有血细胞比容校正的血糖仪可使这一差异值降到最低。
3.内源性和外源性药物的干扰，如对乙酰氨基酚、维生素C、水杨酸、尿酸、胆红素、三酰甘油、氧气、麦芽糖、木糖等。当血液中存在大量干扰物时，血糖值会有一定偏差。常见的可能使血糖测定值假性升高的干扰物质有：非葡萄糖的其他糖类物质、维生素C、高胆红素；常见的可能使血糖测定值假性降低的干扰物质有：高尿酸。
4.p H、温度、湿度及海拔高度都是血糖仪最佳工作状态的必要条件。
5.操作不当、血量不足、局部挤压、更换试纸批号校正码未换或试纸保存不当等都会影响血糖监测的准确性。
6.血糖仪的测量误差：体内血糖变化，可以影响到整个治疗，因此血糖仪误差在多少是可以接受的，往往成了关注焦点。世界卫生组织及美国食品药品监督管理局的多项数据表明，血糖仪的测试误差在20%以内，均不会影响到患者的治疗方案，例如：连续3次测定血糖，分别为6.4mmol/L、5.5mmol/L、5.9mmol/L，虽然数字不尽相同，但可以看出血糖控制良好，因而不必改动治疗方案。检测误差是所有血糖仪共有的一种特性，不是某一品牌、某一款血糖仪的问题。自测血糖时常会遇到不同品牌或相同品牌血糖仪之间测量结果不一致的问题，其实这些都是很正常的，因为快速血糖仪测量的结果是范围值，每次测量的结果通常会有一些差异，但差异不会太大，一般要求快速血糖仪同生化仪静脉血糖之间的误差不超过20%，误差值在±10%以内的血糖仪就是非常好的血糖仪。
临床上，遇到难以解释的患者自测所得到的高血糖或低血糖数值时，需要请患者复诊时带上血糖仪，请患者当面自测血糖并与医院内同时快速血糖测定的结果进行比较，以排除血糖仪、试纸及操作带来的误差。
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