结核菌的生物分类学名称为结核分枝杆菌，按照分类学单位——门、纲、目、科、属、种的分类单位，结核菌属于厚壁菌门、裂殖菌纲、放线菌目、分枝杆菌科、分枝杆菌属，通过对细菌所属的种、属进行分类学定义，称其为结核分枝杆菌。结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis，MTB）复合群包括人结核分枝杆菌（M．tuberculosis complex，MTC）、牛型分枝杆菌（M．bovis）、非洲分枝杆菌（M．africanium）和田鼠分枝杆菌（M．microti）等，其中前三者对人类致病。人结核分枝杆菌感染的发病率最高。
1882年，Koch发现结核杆菌为结核病病原菌。1883年，Zopf将结核杆菌命名为Bacterium tuberculosis。1886年，Lehmann与Neumann将其正式命名为结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）。此后的百余年间，分枝杆菌的发现、分类与命名都有了很大的发展。据统计已报道分枝杆菌100余种。在微生物分类中，分枝杆菌划归放线菌目、分枝杆菌科、分枝杆菌属。根据《伯杰细菌鉴定手册》（即《Bergey’s Manual of Determinative Bacteriology》，9th Edition），将分枝杆菌属菌种基本分为两大类：一是在营养丰富的培养基内，在适宜培养温度条件下，接种很稀的新鲜培养物，在7d内即可肉眼观察到单个菌落者，称为快速生长分枝杆菌；二是在7d以上者，称为缓慢生长分枝杆菌。麻风分枝杆菌虽然也属于后一类，但在体外不能生长，尚难以用人工方法加以培养。人结核分枝杆菌（M．tuberculosis），标准菌株号为ATCC27294，致病菌种。牛型分枝杆菌（M．bovis），标准菌株号为ATCC19210，致病菌种。非洲分枝杆菌（M．africanium），标准菌株号为ATCC25420，致病菌种。田鼠分枝杆菌（M．microti），标准菌株号为NCTC8710，不致病或偶尔致病菌种。
《伯杰细菌鉴定手册》划分的缓慢生长分枝杆菌与快速生长分枝杆菌的菌种名称见表1－1和表1－2。除了表1－1和表1－2，近年来又发现了许多新的分枝杆菌，并被细菌国际命名委员会审定，但还没有统一的英文译名，故其他新发现的分枝杆菌在此不做介绍。
表1－1 缓慢生长分枝杆菌菌种名称
表1－2 快速生长分枝杆菌菌种名称
（续 表）
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