在中蒙双边关系中，两国的经贸合作占有重要位置。2003年，中蒙建立睦邻互信伙伴关系以来两国经贸关系发展顺利； 2011年双方决定将中蒙睦邻互信伙伴关系提升为中蒙战略伙伴关系，在经贸领域的合作关系得到了扩大和深化。2013年10月，中蒙两国政府签署战略伙伴关系中长期发展纲要，为进一步扩大两国经济领域相互往来创造了有利的环境和条件。
中国已连续15年成为蒙古国最大贸易伙伴。蒙古国90%的产品均出口至中国，大约30%的产品需从中国进口。2012年，中蒙双边贸易额为65.95亿美元，同比增长2.5%。其中，中方出口26.53亿美元，同比下降2.9%，中方进口39.42亿美元，同比增长6.5%。据中方统计，2013年，中蒙双边进出口总额为59.56亿美元，下降9.7%。其中，中方出口24.50亿美元，下降7.68%，进口35.06亿美元，下降11.06%。2015年，中蒙双边贸易总额53亿美元，同比下降22.5%，占蒙古国贸易总额的62.6%；其中自华进口13.9亿美元，同比下降21.4%，对华出口39.1亿美元，同比下降22.9%。蒙古国向中国主要出口铜精粉、畜产品、原油、废钢铁等。蒙古国从中国主要进口石油制品、运输工具、粮食、水果蔬菜、轻工产品和中低档生活用品。
1990～2012年6月，我国对蒙古国直接投资存量36.395亿美元，占在蒙古国外资直接投资总额的31.76%。据蒙古国统计，截至2012年6月，中国对蒙古国投资额累计36.4亿美元，注册企业数量5 951家，占蒙古国外资总额和外资企业数的31.8%和49.1%。中国连续十多年保持蒙古国第一大外资来源国地位。2013年1月，中国对蒙古国非金融类直接投资528万美元，同比增长17.6%。截至2013年1月，中国对蒙古国投资累计22.2亿美元。投资领域主要集中在地质矿产勘探开发、餐饮、贸易、房地产、建材、轻工业、畜产品加工等行业。截至2014年初，共有445家中资企业在蒙古国从事矿产领域投资经营，其中136家为中国独资企业，其余为合资企业。上述企业持有4 744个蒙古国政府颁发的矿物开采特许证。[27]1992年起蒙古国开始对华投资，总量很小。近几年，蒙古国在中国的投资也有所增长，2010年末，投资额已达到325万美元。
2013年1月，中国在蒙古国签订承包工程、劳务合同1 262万美元，同比下降96.6%，完成营业额5 319万美元，同比下降7.4%。截至2013年1月，中国在蒙古国签订承包工程、劳务合同额累计86.1亿美元，完成营业额39.8亿美元，中国在蒙古国承建的大型项目包括泰西尔水电站、西部公路、奥尤陶勒盖铜矿建设等。2013年1月，在承包工程和劳务合同项目下，中国共向蒙古国派遣劳务人员152人，目前在外人数为5 669人。
在援助方面，中国对蒙古国的援贷迅速增加。1990年，世界银行和日本共同发起的国际援蒙会议承诺向蒙古国提供相当于3亿～5亿美元的援助。在此背景下，中蒙双方签订了《关于中国向蒙古国提供贷款的协定》《中国援助蒙古国经济技术合作协定》和《蒙古国推迟偿还中国贷款换文》，使中国对蒙古国的援助贷款持续增加。2002～2007年中国共向蒙古国提供30多亿人民币的援助和贷款，远超此前50多年的总和。此后，中国每年都向蒙古国提供6 000万～8 000万元人民币的无偿援助，并先后为蒙古国提供了2亿～3亿元人民币的优惠贷款。2010年3月中国国家开发银行又向蒙古国提供30亿美元贷款，用于蒙古国的公路和铁路建设。中国对蒙古国援助和贷款的增加为扩大和深化两国经贸合作，落实两国在资源领域的合作提供了有利条件。
在边贸和地区贸易方面，中蒙边境贸易和地区贸易是中蒙经贸合作的重要组成部分。根据1991年6月24日签订的关于中蒙边境口岸及其管理制度的协定，中蒙开辟了8对边境口岸；2004年9月28日，两国再次签订《中蒙政府关于中蒙边境口岸及其管理制度的协定》，将开放的边境口岸增加至13对；2013年中蒙共开放了18对口岸。随着中蒙经济合作的进一步深入和双边贸易的发展，中国内蒙古、新疆、宁夏、河北、吉林、甘肃等已经同蒙古国的相关省份开展了不同规模的边境贸易和经济技术合作，其中内蒙古与蒙古国之间的边境贸易最为引人瞩目，口岸运量迅速增长。中蒙边境口岸在两国经贸合作中发挥了良好的桥头堡作用，边境贸易的繁荣发展也为边境城镇对外交往和社会经济的发展带来了更多机遇。
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