自古以来，普什图部落区就有自治的传统。1901年，为稳定英属印度的西北边境局势，英属印度政府建立西北边省。但是，开伯尔、库拉姆、南瓦济里斯坦和北瓦济里斯坦等普什图部落区并未划归西北边省进行管辖，而是由在德里的英属印度中央政府进行直接直辖。英属印度政府派出政治专员对各普什图部落区进行名义上的管理，实际上地方诸汗仍继续控制当地。[23]1947年，英国殖民政府离开英属印度，英属印度划分为印度与巴基斯坦两个自治领地，英属印度的普什图部落区加入巴基斯坦自治领，但继续保持其传统的自治制度。巴基斯坦的600多条法律只有44条在普什图部落区使用，而且对普什图人的生活并没有太大的影响。[24]普什图人按照其传统和习惯法生活。汗和部落长老控制着普什图地区，在当地行使管辖权。巴基斯坦中央政府派驻当地的政治代表并不干预普什图部落内部的事务。政治代表的任务是维护边境安全，防止普什图部落和氏族间可能发生的武装冲突，监督普什图部落区经济和社会发展计划的实施。政治代表通过普什图部落的部落长老履行这些使命。
普什图部落区虽然没有警察，但有名为“哈萨达尔”的武装人员。哈萨达尔均为当地人，负责当地道路和通讯设施的保卫工作。联邦直辖部落区的民事和刑事案件由部落长老会根据1901年边境刑事法规判决。1989年，开始在联邦直辖部落区实施1973年巴基斯坦政府通过的《国民登记条例》；在省辖部落区（位于马拉坎德地区）实施《西北边省商业登记条例》。[25]其他巴基斯坦法律或条例，视其需要在联邦直辖部落区内实施。
由于巴基斯坦政府对于普什图人就业问题较为重视，大量普什图人进入军队、警察和政府部门服务。为缓解普什图部落区存在的隐性失业问题，巴基斯坦政府还协助普什图人前往中东地区进行劳务输出。[26]这对于改善普什图部落区的经济状况，加速普什图部落区与巴基斯坦其他地区经济、社会一体化起到一定促进作用。在教育方面，阿里·布托执政时期（1971—1977年）曾经在普什图部落区实行8年免费教育政策，并开展成人扫盲运动。齐亚·哈克执政时期（1977—1988年），针对联邦直辖部落区的普什图部落，成立普什图语文学院，提供资金开办新学校，增加教师的数额。巴基斯坦政府强调女子教育，鼓励普什图人将女儿送到学校读书。此外，巴基斯坦政府还设立教育基金，以鼓励私人资金参与联邦直辖部落区的教育发展，提高普什图人的识字率。
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