2012年巴基斯坦政府军持续在开伯尔—普什图省和联邦直辖部落区进行军事清剿行动，同时在巴基斯坦全国范围内抓捕巴基斯坦塔利班及其盟友，阻止巴基斯坦塔利班发动自杀式袭击。巴基斯坦政府军还在巴基斯坦西北部地区努力改善安全形势，推动普什图战争难民返回家园。与此同时，为因应美国开始从阿富汗撤军的现实，巴基斯坦政府开始与巴基斯坦塔利班等武装组织展开和平谈判，以稳定巴基斯坦国内的安全形势，避免因为内耗阻碍巴基斯坦经济社会发展。但是巴基斯坦政府与巴基斯坦塔利班等武装组织的和平谈判并未取得明显的成果。
1．巴基斯坦政府军继续在巴基斯坦西北部地区进行军事清剿
自2012年开年以来，巴基斯坦政府军延续之前在巴基斯坦西北部地区进行的军事清剿行动，但并未有效摧毁巴基斯坦塔利班的有生力量。巴基斯坦反恐斗争日益呈现出低烈度与长期化的明显特征。巴基斯坦军队和警察击毙的巴基斯坦塔利班及其盟友的人数从2011年的1124人下降到2012年的654人，降幅约为42%，而654人仅仅占巴基斯坦塔利班约30000总人数的约2%。巴基斯坦军队和警察俘虏的巴基斯坦塔利班及其盟友的人数从338降到104，降幅约为69%，而104人仅仅占巴基斯坦塔利班30000总人数的约0．3%。[192]这样的战绩对于巴基斯坦军队和警察来说极为惨淡。而如此微小的损失对于巴基斯坦塔利班来说基本可算是无足轻重。巴基斯坦塔利班的有生力量化整为零，在巴基斯坦政府军防卫力量较为薄弱的俾路支斯坦重新集结。为因应塔利班主力尚存、散而不灭、败而不降、不断滋扰的现状，巴基斯坦政府军继续在巴基斯坦西北部地区进行旷日持久的小规模清剿行动。
2．巴基斯坦军队和警察逮捕、击毙多名巴基斯坦塔利班和基地组织领导人
巴基斯坦军队和警察在巴基斯坦全国范围内打击巴基斯坦塔利班及其他武装组织，并取得一定成绩，逮捕和击毙一些巴基斯坦塔利班及其他武装组织领导人。2012年1月5日，巴基斯坦安全部队逮捕被控在卡拉奇制造恐怖袭击的一个巴基斯坦塔利班指挥官和3名塔利班战士。[193]1月7日，巴基斯坦安全部队在卡拉奇实施的一次搜捕行动中打死一名巴基斯坦塔利班运动在俾路支斯坦省的领导人。[194]1月10日，巴基斯坦安全部队在瑙仕拉抓获一名通缉的巴基斯坦塔利班指挥官。[195]1月30日，巴基斯坦警方宣称击毙巴基斯坦塔利班在德拉·伊斯梅尔·汗的指挥官。[196]2月5日，巴基斯坦警方在卡拉奇逮捕一名巴基斯坦塔利班指挥官和3名塔利班战士。[197]2月18日，巴基斯坦警方声称已经逮捕2011年3月袭击位于费萨拉巴德的三军情报局地区总部的策划者。[198]3月19日，巴基斯坦警方宣布伊斯兰军领导人巴格在开伯尔部落区被击毙。[199]5月15日，巴基斯坦安全部队逮捕一名巴基斯坦塔利班埃米尔哈基姆拉·马哈苏德派驻白沙瓦的指挥官。[200]8月9日，巴基斯坦安全部队在瑙仕拉进行的搜捕行动中逮捕斯瓦特地区巴基斯坦塔利班首脑法兹鲁拉毛拉的首席助手。[201]8月25日，巴基斯坦安全部队在瑙仕拉逮捕一名巴基斯坦塔利班指挥官。[202]8月30日，巴基斯坦警方再次逮捕羌城军领导人马利克·伊沙克。[203]10月17日，巴基斯坦政府宣布：巴基斯坦塔利班在奥拉克扎伊部落区的埃米尔加里·萨伊德在瑙仕拉被捕。[204]10月17日，巴基斯坦警方逮捕羌城军在信德省分支的埃米尔。[205]
3．巴基斯坦军队和警察积极对恐怖袭击展开预防和应对行动
由于近年来巴基斯坦塔利班及其他武装组织在巴基斯坦全国各地发动大量自杀式袭击，造成严重的生命和财产损失。因此，巴基斯坦军队和警察携手，努力预防自杀式袭击，并取得一定成绩，不但逮捕了多名自杀式袭击者、自杀式袭击策划者以及自杀式袭击训练者，而且还成功阻止了一些即将发生的自杀式袭击。2012年2月2日，巴基斯坦安全部队在开伯尔部落区抓获8名武装分子，并缴获其隐藏的大量炸药。[206]4月6日，巴基斯坦安全部队在白沙瓦逮捕12名恐怖分子，并缴获大量自杀式背心。[207]12月11日，巴基斯坦安全部队在拉合尔执行的搜捕行动中逮捕两名疑似恐怖分子，并缴获大量自杀式背心。[208]
4．巴基斯坦政府努力防止巴基斯坦塔利班卷土重来
巴基斯坦政府努力改善联邦直辖部落区的安全局势，保障联邦直辖部落区重建进程的顺利开展，希望以长期的发展教育和经济开发保障短期的军事胜利，以便从根本上消除恐怖主义滋生的温床。为了增强普什图部落民对抗巴基斯坦塔利班、维护联邦直辖部落区和平的能力。巴基斯坦政府鼓励普什图部落民组织部落武装以抵御巴基斯坦塔利班的侵扰。反巴基斯坦塔利班部落武装被事实证明是巴基斯坦塔利班的劲敌。因为他们长期与巴基斯坦塔利班共同生活，对塔利班及其活动都很了解。2012年3月19日，一个反巴基斯坦塔利班部落武装在开伯尔部落区处死3名巴基斯坦塔利班外围组织伊斯兰军成员。[209]
5．巴基斯坦政府尝试与巴基斯坦塔利班展开和平谈判
为因应北约开始撤军后的阿富汗新形势，巴基斯坦政府试图与巴基斯坦塔利班及其他武装组织进行接触，试图与之达成政治和解。但是巴基斯坦政府与塔利班的谈判并未取得重大成果。2012年1月8日，作为休战协定的一部分，巴基斯坦军方希望巴基斯坦塔利班离开奥拉克扎伊部落区和开伯尔部落区，但可以留在联邦直辖部落区的其余5个部落区。[210]
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