生物医学数据库检索

第12章　生物医学信息检索

12．1　生物医学概述

生物学是研究生物各个层次的种类、结构、发育和起源进化以及生物与周围环境关系的学科。人是生物的一种，也是生物学的研究对象。20世纪特别是1940年以来，生物学吸收了数学、物理学和化学等学科的成就，逐渐发展成一门精确的、定量的、深入到分子层次的科学，现代生物学是一个有众多分支的庞大的知识体系，根据研究内容，分为分类学、解剖学、生理学、细胞学、分子生物学、遗传学、进化生物学、生态学等。

医学是以保护和增进人类健康、预防和治疗疾病为研究内容的科学。医学按其本质来说属于自然科学范畴，在现代科学技术体系中处于应用科学的地位。由于在人们的健康、疾病以及防治疾病的措施中，包含大量的精神的和社会的因素，因此医学的内容又有与思维科学和社会科学交叉的部分。在整个医学体系中，既有系统的科学知识，又有庞大的技术手段，是科学与技术的统一体。医学既是一种理论体系，又是一种实践体系，是理论与实践的统一体。医学的社会职能在于保障和促进人类在生理上、心理上、社会上的健康发展，在社会生产中，它保护劳动力，促进生产力的发展。根据研究领域的不同，医学被细分为许多不同的学科，包括基础医学、临床医学、检验医学、预防医学、特种医学及传统医学等。

生物医学的发展也越来越多地依靠与物理学、化学、数学、计算机科学及工程技术等多学科的交融，学科交叉研究成为推动生物医学向更广、更深层次发展的主要动力。

生物医学已经成为当今自然科学领域发展最快的学科，为21世纪最受关注的科学领域之一，很多发达国家已将生命科学和生物医学作为科学研究重点。

生物医学信息资源增长迅速，数量庞大，与物理、化学、计算机技术等学科存在广泛交叉，信息相对分散，为生物医学信息的查找带来困难。近年来，生物医学领域免费获取的信息资源增长迅速，网上免费信息资源已经成为生物医学信息资源的重要组成部分，因此我们应加强对网上免费资源获取与利用能力的培养。综合性数据库（如CNKI、万方、维普、EBSCO、SCI、Elsevier等）包含有生物医学信息资源，前面有关章节已经对此进行了介绍。本章主要对生物医学领域常用的、权威的专业数据库和网站进行介绍和推荐。

12．2　生物医学信息检索

12．2．1　生物医学数据库检索

1．中文数据库检索

（1）中国生物医学文献数据库

中国生物医学文献数据库（China Biology Medicine disc，CBMdisc）是由中国医学科学院医学信息研究所于1994年研制开发的中文医学文献数据库，它主要收录1978年以来1 600余种中国生物医学期刊，以及汇编、会议论文的文献记录，总计超过400万条记录，年增长量约35万条。涵盖了《中文科技资料目录（医药卫生分册）》、中文生物医学期刊目次数据库（CMCC）中的题录。学科涉及基础医学、临床医学、预防医学、药学、中医学以及中药学等生物医学领域的各个方面。

CBMdisc注重数据的深度加工和规范化处理，中国生物医学文献数据库的全部题录均根据美国国立医学图书馆《医学主题词表》（即MeSH词表），以及中国中医研究院图书情报研究所新版《中医药学主题词表》进行了主题标引，并根据《中国图书馆分类法》第四版进行了分类标引。全部题录均进行主题标引和分类标引等规范化加工处理，其检索系统与目前国际流行的Medline光盘及PubMed检索系统相兼容，功能完备，多种词表辅助检索。

（2）中国中医药数据库检索系统

中国中医科学院中医药信息研究所自1984年开始进行中医药学大型数据库的建设，目前数据库总数40余个，数据总量约120万条，包括中医药期刊文献数据库、疾病诊疗数据库、各类中药数据库、方剂数据库、民族医药数据库、药品企业数据库、各类国家标准数据库（中医证候治则疾病、药物、方剂）等相关数据库。

多类型的中医药数据库，以其充实的数据成为中医药学科雄厚的信息基础。所有的数据库都可以通过中医药数据库检索系统提供中文（简体、繁体）版联网使用，部分数据提供英文版，所有数据库还可以获取光盘版。

中医药数据库检索系统可以实现单库与多库选择查询。单表数据库检索可选择最专指的一个数据库进行相应字段的检索。

（3）中国生命科学文献数据库

中国生命科学文献数据库（Chinese Biological Abstract，CBA）原名“中国生物学文献数据库”，由中国科学院上海生命科学信息中心开发，是生命科学专业文摘型文献数据库，收录了我国生命科学及相关学科科技工作者在国内刊物中发表的研究文献，可供生物学、医学、化学、农学等领域的科学研究及教学人员使用。收录年限1950年至今，每年更新约10 000条数据，累计44万条数据。学科范围覆盖了普通生物学、细胞学、遗传学、生理学、生物化学、生物物理学、分子生物学、生态学、古生物学、病毒学、微生物学、免疫学、植物学、动物学、人类学、生物工程学、药理学以及生物学交叉与相关科学技术领域。目前有两种版本：网络版和光盘版。

2．外文数据库检索

（1）Medline

Medline（美国医学索引数据库）是美国国立医学图书馆（National Library of Medicine，NLM）编辑出版的国际综合生物医学信息书目数据库。NLM是目前国际上重要的生物医学文献信息服务中心，自1997年6月26日NLM宣布Medline数据库在Internet网上实现免费检索以来，Medline数据库大大加强了医学信息资源交流、获取和利用，促进了医学科学的发展。

Medline的内容涵盖3种重要的纸本医学文献检索工具：《Index Medicus》（医学索引）、《Index to Dental Literature》（牙科文献索引）、《International Nursing Index》（国际护理索引）。内容涉及70多个国家的4 300多种生物医学期刊的900多万条文献题录，并以每天1 000多条题录的速度递增，其中70%以上的记录来源于英文期刊。内容涉及医学、护理学、牙科学、兽医学、药学、环境和公共卫生等，其中许多文献记录可在出版商的允许下得到完整的论文。

多种检索平台提供Medline数据库检索功能，如Web of Science、EBSCOhost、EMbase，NLM本身提供两个在线的文献检索系统：PubMed和Internet Grateful Med （IGM）。

PubMed主要用以对Medline的免费检索，其用户界面友好，收录文献范围广、数据库更新速度快、链接点多，部分还可在网上免费直接获得全文，于是成为网上检索生物医学文献使用频率最高的免费医学网站，也是检索生物医学文献最重要、最理想的工具。下面就PubMed检索系统为例介绍Medline的使用方法。

①PubMed检索系统概括

PubMed（http：／／www．ncbi．nlm．nih．gov／pubmed）是由美国国立医学图书馆（NLM）附属国立生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）研制开发、基于web的完全免费的文摘型生物医学文献检索系统，是NCBI开发的Entrez检索系统的重要组成部分之一。PubMed除收录有Medline外，还包括DNA／蛋白质序列和三维结构资料的分子生物学数据库等，还提供诸多临床信息和近100种期刊的全文。

PubMed检索系统中除包括经规范化处理的Medline记录（标有［PubMed－indexed for Medline］）外，还包括Medline的来源期刊出版商提供的尚未经规范化处理的记录（标有［PubMed－in process］）和一些非Medline收录期刊出版商以电子方式提供添加的记录（标有［PubMed－as supplied by publisher］），因此通过PubMed检索系统检索的记录将更加全面、快捷。

②PubMed快速检索特点

直接登陆PubMed网站（图12－1），默认在PubMed数据库检索，在主页检索框中直接输入主题词、著者名、刊名等任意检索词或检索式，直接点击“search”可直接返回检索结果。

图12－1　PubMed主页

主页面的快速检索系统支持以下几种功能。

·自动词语匹配功能（automatic term mapping）。可以实现词语的自动转换和匹配，主要通过4个表来进行：MeSH转换表（MeSH translation table）、刊名转换表（journal translation table）、短语表（phrase list）、著者索引表（author index）。在检索提问栏内输入一个或若干个检索词，系统将依次到以上4个表中进行词语匹配，直到找到相匹配的词为止。如键入“aspartame cancer”，系统会自动转换成（“aspartame”［MeSH terms］or “aspartame”［all fields］）and（“neoplasms”［MeSH terms］or“neoplasms”［all fields］or “cancer”［all fields］）进行检索。

·截词功能（truncation）。使用“＊”作为通配符进行截词检索。如键入“bacter＊”，系统会找到bacteria，bacterium，bacteriophage等。

·词组检索功能（phrase searching），也叫强制检索功能。把词组加上双引号（“”），系统将会自动关闭词汇转换功能，将其作为一个词组在全部字段种进行检索。

·布尔检索。支持布尔逻辑检索，运算符号必须大写，分别是逻辑“与”（and），逻辑“或”（or），逻辑“非”（not）。运算顺序是从左到右执行，可以通过“（）”改变运算次序。

·限定检索。有字段限定检索，日期和日期范围的限定检索，语种、文献类型等其他限定检索。

③“Limits”检索

点击主页“Limits”，可进入条件限制检索界面（图12－2）。可对检索结果进行记录更新时间、文献类型、语种、人或动物、性别、文献数据子库、年龄、字段等多种条件进行限定，提高检索效果。

图12－2　PubMed的“Limits”检索页面

需要指出的是，“Limits”的各个选项在经过设定后，必须经过解除设定或重新设定，否则对后面的检索一直有效。

④“advanced”检索

点击主页面的“advanced”可进入高级检索界面（图12－3）。

图12－3　PubMed的“Advanced”检索页面

高级检索界面的检索主要包括3个部分，一是检索条件构建框（search builder），二是检索框（serch box），三是检索历史显示区（search history）。

检索条件构建框可以帮助检索人员选择正确的检索词。首先根据需要选择恰当的检索字段，输入检索词，并可点击“show index”，系统会自动显示与检索者输入的检索词相关的词，供检索者选择。选择合理的布尔运算符后再点击“add to search box”，系统将检索词添加到上面的检索框中。可重复上述步骤构建检索式，完成后点击“Search”，即可执行检索。

⑤MeSH database

主题标引是Medline数据库的重要特色之一，Medline数据库的叙词有主题词（headings）和副主题词（subheadings）两种，副主题词是对主题词概念的进一步限制和划分，使主题词／副主题词的组配成为一个更专指的概念，满足某一专题文献的检索。

为方便用户方面查找、选择恰当的主题词进行检索，PubMed提供了MeSH databse检索界面。点击PubMed主页中“more resource”栏目下的“mesh database”，即可进行主题词检索，在检索框中输入检索词，点击“search”进入，系统会把非主题词自动转换为主题词，并把与之相关的主题词一并列出供用户选择（图12－4）。点击选中的主题词，可进一步对其进行副主题词的限定选择，并可进行不扩展和加权等限制检索。系统默认进行扩展和不加权检索。

如检索角膜塑形治疗近视的副作用方面的文献，可以采用“orthokeratologic procedures／adverse effects”［Mesh］and“Myopia”［Mesh］进行检索，提高检索的查准率。

另外PubMed具有Journals in NCBI Databases全文链接检索功能，可以通过主题、刊名或刊名缩写以及ISSN等进行查找期刊相关信息。

图12－4　Pubmed的“Mesh Database”检索界面

（2）EMbase

EMbase（荷兰医学文摘数据库）是Eleviers Science公司编辑出版的大型生物医学及药学文摘书目数据库，是纸本检索工具荷兰《医学文摘》（Excerpta Medica）的在线版本，该数据库也是目前世界上最常用的生物医学文献之一。

2003年Elsevier Science公司将1974年以来的EMbase 900多万条生物医学记录与1966年以来的Medline中600万条不重复的数据相结合，形成了EMbase．com。

EMbase．com涵盖70个国家／地区出版的5 000多种刊物，在直观友好的界面上同步检索EMbase和Medline，涵盖了整个临床医学和生命科学的广泛范围，涵盖学科范围有可替代药物、药物研究、药理学、配药学、药剂学、药物副作用、毒理学、人体医学（临床与实验），以及与人体医学相关的基础生物医学、生物工程、生物工艺与仪器、生物技术、保健策略与管理、药物经济学、公众、职业与环境保护、污染、药物依赖性与滥用、精神病学、康复与理疗、法医学、兽医学、牙科医学、护理学、心理学、替代性动物实验，特别涵盖了大量的欧洲和亚洲的医学刊物。

EMbase．com检索界面友好，提供“search”“EMtree”“journals”和“authors”4个检索项，满足用户不同的检索要求。“search”提供快速检索（quick search）、高级检索（advanced search）、字段检索（field search）、药物检索（drug search）、疾病检索（disease search）和文章检索（article search）。EMtree词库是EMbase．com最强大的检索工具之一，EMtree由48 000多个受控叙词（也可以称为优先词）组成等级体系，共15个大类。EMtree还包含了近200 000同义词，指引从入口词查到EMbase．com使用的受控叙词。

快速检索基本检索规则：使用自然语言检索，可用单词或词组进行检索，词组检索需加单引或双引号；词序无关，不区分大小写；支持布尔运算；支持通配符检索，在检索词的末尾加上“＊”号，表示检索词的派生检索。在检索词的中间或末尾加上“？”，表示一个可变字符；支持临近检索，“＊n”表示两个检索词直接可间隔n个词。

检索结果可按相关性或出版年等进行排序，显示格式有简短记录或详细记录等。并可进行打印、保存、发送等结果输出，系统具有数据分析工具，可对检索结果进行分析。

（3）BIOSIS Previews

①BIOSIS Previews简介

BIOSIS Previews（生物学文摘）由原美国生物学文摘生命科学信息服务社编辑出版，是Biological Abstracts（生物学文摘，简称BA）和Biological Abstracts／RRM（Reports，Review，Meetings）整合的网络版本，广泛收集了与生命科学、医学和农业科学等方面的有关资料，涵盖了包括传统生物学（植物学、生态与环境科学、微生物学、医学、药理学、动物学等）、交叉科学（生物化学、生物医学、临床医学、遗传学、公告卫生学等）和诸如仪器、实验方法等相关研究的广泛研究领域。

BIOSIS Previews涵盖了近5 500种生命科学期刊和非期刊文献，如学术会议、研讨会、评论文章、美国专利、书籍、书籍章节和软件评论等，收录了1926年至今的90个国家和地区的文献资料超过1 800万条的记录，其中北美占30%，欧洲及中东占52%，亚洲和澳洲14%，是目前世界上生命科学和生物医学研究领域的著名检索工具之一。

BIOSIS Preview具有人性化的检索系统，检索项目包括有机体名称、分类、化学和生物化学、疾病与综合征、地理位置、分子序列数据、方法和仪器以及行业。BIOSIS Previews在文献标引过程中采用其独有的关联性标引，其特色在于能够标引出每一个检索字段和控制字汇之间的关联性，可使研究人员快速准确地查找相关数据。

②BIOSIS Previews检索

BIOSIS Previews数据库检索平台有Dialog、Ovid、Web of Knowledge等。本书以Web of Knowledge检索平台为例介绍BIOSIS Previews数据库检索方法。

登陆ISI Web of Knowledge检索平台，默认进入多库统一检索界面，点击“选择一个数据库”进入BIOSIS Previews单库检索界面（图12－5）。

图12－5　BIOSIS Previews的Web of Knowledge检索界面

BIOSIS Previews检索系统支持以下技术。

·布尔逻辑运算，and、or、not，不区分大小写。

·精确短语查找，需请用引号（“”）括住短语；以连字号、句号或逗号分隔的两个单词，则词语也将视为精确短语。

·位置运算符same，两个检索词出现在同一句子中，词顺可颠倒。

·截词检索，“？”代表任意一个字符，“＊”代表一个多个字符。

Web of Knowledge检索平台提供普通检索和高级检索。普通检索界面提供主题、标题、作者、团体作者、出版物名称、编者、地址、出版年、分类数据、主题概念、概念代码、化学和生化名称、会议信息、识别码、语种、出版类型、文献类型和分类注释共17个检索入口。其中作者、团体作者、出版物名称、地址、分类数据、主题概念和概念代码字段提供索引。高级检索支持使用两个字母的字段标识、布尔逻辑运算符、括号和检索式引用来创建检索式的专业检索。

（4）Evidence－Based Medicine Reviews

Evidence－Based Medicine Reviews（EBMR，循证医学数据库）是医药界人士及医学相关研究人员研发的一套数据库，收录了1991年以来医学研发中具有临床实证基础的资料。该数据库汇集了重要的循证医学文献，提供临床医生、研究者使用，并可作为临床决策和科学研究的基础，可节省阅读大量医学文献报告的时间。该数据库主要源自4个数据库。

①ACP Journal Club（American College of Physicians，美国内科医师学会出版），库中包含Evidence Based Medicine和ACP Journal Club两种循证医学期刊的内容。每月至少过滤50种以上的核心期刊，搜寻最佳的原始文章及评论性文章。

②Cochrane临床对照试验注册资料库（Cochrane Controlled Trials Register，CCTR），所有的资料来源于协作网内各系统评价小组和其他组织的专业临床试验资料库以及Medline和EMbase上被检索出的随机对照试验（Randomized Controlled Trials，RCT）和临床对照试验（Clinical Controlled Trials，CCT）。该数据库还包括了全世界Cochrane协作网的成员从有关医学杂志会议论文集和其他来源中收集到的CCT报告。目前CCTR收录了1948年以来全世界已发表的所有RCT和CCT300 000篇有关健康保健控制、实验样品参考型书目资料，其中包括中国中心提交的RCT。

③Cochrane系统评价资料库（Cochrane Database of Systematic Review，CDSR），该库收集了协作网中49个Cochrane系统评价组在统一工作手册指导下对各种健康干预措施制作的系统评价，包括全文和研究方法。目前主要是根据随机对照试验完成的系统评价，并随着读者的建议和评论以及新的临床试验的出现不断补充和更新。Cochrane图书馆以每年新生产200～300多个系统评价的速度递增，协作网所制作的系统评价几乎涵盖了整个临床医学领域。

④疗效评价文摘库（Database of Abstracts of Reviews of Effectiveness，DARE），该库是专门收录评论性文章的全文数据库，是National Health Services’Centre Reviews and Dissemination（NHS CRD）组织出版，该组织把部分经过评估后挑选的、具有学术价值的医学期刊文章集合成DARE。包括非Cochrane系统评价（非Cochrane协作网成员发表的系统评价）的摘要和目录，是对Cochrane系统的补充。DARE的特点是其系统评价的摘要包括了作者对系统评价质量的评估。与CDSR不同的是该文摘库只收集了评论性摘要题目及出处，而没有全文，并且不一定符合Cochrane系统评价的要求。

（5）Micromedex

Micromedex（美国临床暨循证医药学数据库）数据库是由美国Thomson Healthcare（汤姆生卫生保健信息集团）制作的事实型医药知识数据库。该数据库由医药学专家针对全世界2 000余种医药学期刊文献进行分类、收集、筛选后，按照临床应用的需求，编写为基于实证的综述文献，直接提供给专业人士使用，不仅节约了医师查询的时间，还提高了临床效率，减少了对原始文献的需求，而且数据库检索界面也十分简便易学，是广大医务界人士查找信息的重要工具。

目前该库包括5个方面的信息。

①Drug Information药物咨询数据库：提供使用者药品的详细咨询服务，其中包含药品介绍、使用剂量、药物交互作用等等。

②Disease Information疾病医学数据库：提供医学上常用的一般疾病与急诊、慢性疾病的实证医学相关信息，资料包括常见与特殊的临床症状、检验结果和用药须知。

③Toxicology Information毒物医学数据库：提供药品的毒性分析并提供详细的处理步骤及治疗方法。

④Complementary ＆Alternative Medicine Information另类医学数据库：此系列涵盖补充食品医学、食疗、传统医疗法，以及对病人的卫教资料，以相关的医学报道方式说明，并提供病患相关的医疗教育信息。

⑤Patient Education Information病患卫教数据库：提供病患关于疾病和用药的常识，以及长期医疗照顾的须知。

（6）Derwent Biotechnology Resource

Derwent Biotechnology Resource（德温特生物技术资源）由英国Thomson Derwent和美国科学信息研究所（Institute for Scientific Information，ISI）创建，收录了描述生物技术领域研究进展的20多种语言的1 100多种国际性期刊论文、40多家权威专利机构提供的专利、国际会议的文摘，主题覆盖生物技术的方方面面，包括遗传工程、生物化学工程、发酵、细胞培养和废物处理。2002年初，主题又扩展到生物信息学、功能基因组学、药物基因组学、生物芯片和组织工程等。

2002年以前的每条记录都有主控索引的详细摘要，包括改进的分类系统，约有37%的记录来自德温特世界专利索引，文献记录还包括ISI提供的完整的书目信息和作者摘要。

（7）Genetics Abstracts

Genetics Abstracts（遗传学文摘）由美国剑桥科学文摘社（CAS）出版，它是重组DNA技术与传统遗传学不断发展和结合的产物，提供从微生物、植物到人类各个方面的遗传学文献，反应了DNA、分化和发育、RNA、蛋白质合成、核糖体、核蛋白以及染色体、酶和遗传调控等领域的最新进展和重要信息。作为生命科学的重要资源，Genetics Abstracts直接或间接地对与人类基因组计划有关的研究人员和研究所起到显著的作用。

（8）International Pharmaceutical Abstracts

International Pharmaceutical Abstracts（IPA，国际药物学文摘数据库）是美国药师协会（American Society of Health－System Pharmacists，ASHP）编辑出版的著名药学及保健方面文献的综合书目数据库，该数据库由美国卫生系统药师协会联合制作，其药物学文摘包括1970年以来世界制药业完整的索引目录，提供药物使用和开发各阶段的信息及专业的药物使用和专业培训等各方面信息。此外，重要的药物学会议发言摘要也包括在其中。1985年起该数据库收录范围扩大到有关论述相关条例、法律、人力资源和薪资方面报道的药物期刊。1988年IPA开始收录美国医院药师学会（ASHP）的主要会议推荐的论文文摘，现在还收集AphA（美国公告卫生学会）和AACP（美国药学院联盟）年会演讲文摘，并计划收录药学院硕士和博士论文文摘。该数据库的收录内容包括药学领域的临床实践、理论、经济、科学等方面，有关临床研究的文摘还包括研究设计、病人数量、剂量、剂型、剂量时间表等。IPA的文献来源为世界范围内与健康、医疗、化妆品等共850多种期刊和美国国内的所有药剂期刊，共35万多条记录。用户可通过关键词、期刊名、商标名、PA号码、化学物质登记号、题名等多种算途径进行检索，还可以对检索条件进行限制。

（9）Toxline

Toxline数据库（毒理学数据库）是毒理学和环境卫生领域的文献数据库，它涵盖了1996年以来16个不同数据库或检索工具中的毒理学领域和与毒理学相关的化学药品学、农药学、环境污染学、诱变学和畸形学方面的期刊书目文摘资料，另外也有专著、技术报告、学位论文、通信、会议文摘等资料，内容包含化学、药理学、杀虫剂、环境污染等。该数据库由美国国家医学图书馆出版发行，文献资料来自于Tozicity Bibliography（毒性学书目）和Developmental and Reproductive Toxicology（发育与生殖毒理学文摘）。Toxline由两个部分构成，后者是美国联机医学文献分析和检索系统的毒理学和环境卫生期刊文献子集。该数据库不包括化学文摘、生物学文摘和国际药学文摘方面的信息。

Toxline提供的检索方式主要为快速检索和高级检索。快速检索包括关键词、标题、著者、刊名和任意字段5个检索途径，用户可以根据所选的检索途径在检索框中输入一个或多个检索词。高级检索分为菜单式检索和命令式检索。

12．2．2　生物医学网络资源

1．中文生物医学网络资源

（1）中国医药信息网（http：／／www．cpi．gov．cn）

中国医药信息网是由国家食品药品监督管理局信息中心建设的医药行业信息服务网站，始建于1996年，专注于医药信息的搜集、加工、研究和分析，为医药监管部门、医药行业及会员单位提供国内外医药信息及咨询、调研服务。

该网站共建有20余个医药专业数据库，主要内容包括政策法规、产品动态、市场分析、企事业动态、国外信息、药市行情等，现已成为国内外医药卫生领域不可缺少的重要信息来源。

（2）北京大学生物信息中心（http：／／www．cbi．pku．edu．cn／chinese）

北京大学生物信息中心（CBI）成立于1997年，是欧洲分子生物学网络组织EMBnet的中国国家节点。几年来，已经与欧洲生物信息学研究所（EBI）、国际蛋白质数据库和分析中心（ExPASy）等多个国家的生物信息中心建立了合作关系，为国内外用户提供了多项生物信息服务。

该中心建立了20多个国外著名生物信息资源镜像，涵盖了从单个基因表达调控到基因组研究、从DNA序列到蛋白质结构功能，以及文献查询、网络教程等各个方面，为生命科学工作者提供全面的生物信息资源服务。

（3）国家食品药品监督管理局网站（http：／／www．sda．gov．cn／WS01／CL0001）

国家食品药品监督管理局网站由国家食品药品监督管理局主办，是了解我国食品药品监管系统相关法规、政策信息、行政审批程序、工作报告、统计年报、最新动态等信息的权威网站，该网站提供药品、医疗器械、保健食品、化妆品等数据库的查询。

（4）中华人民共和国卫生部网站

卫生部网站（http：／／www．moh．gov．cn／publicfiles／／business／htmlfiles／wsb／index．htm）由中华人民共和国卫生部主办，是了解我国卫生系统相关政策法规、最新工作动态、人事信息、卫生标准、卫生统计等相关信息的权威网站，该网站还提供执业医师注册查询、执业护士注册查询、健康相关产品查询、医学图书查询功能。

（5）丁香园（http：／／www．dxy．cn）

丁香园生物医药科技网成立于2000年7月23日，自创办以来一直致力于为广大医药生命科学专业人士提供专业交流平台。凭借着专业精神和深厚积累，专业交流不断深入和发展，丁香园已从最初每天只有数人查看的留言板逐步发展壮大成为国内规模最大、最受专业人士喜爱的医药行业网络传媒平台。内容涉及专业医学知识和对医药产品的信息和讨论等。

（6）生物秀（http：／／www．bbioo．com）

生物秀创建于2003年，通过先进的网络技术为生物医药领域提供各种应用和信息化服务，经过多年的发展，目前生物秀旗下已经拥有技术先进和功能完善的多个网站系统，包括生物秀主站、易生物B2B商务平台、中国生物科学论坛、生物部落（SNS）、生物秀知道、生物百科，生物秀视频系统等。这些系统彼此独立而又相互交叉，共同构成一个行业内最完善的网络服务体系。

（7）生物谷（http：／／www．bioon．com）

生物谷创建于2001年，生物谷内容包括生物学、医学、药学、实验、产业、培训、会议、考试等。采用科学的分类方法组织，有方便的网上查询功能。该网站通过网站和论坛互动发展的模式，为广大生物医药专业科研人员、医务工作者和管理者、生物医药院校师生、广大网民提供各类国内外最新的动态信息，内容丰富的资料、文献以及学术探讨、经验交流、沟通信息、互相促进的场所。

2．外文生物医学网络资源

（1）World Health Organization（http：／／www．who．int／search／en）

World Health Organization（WHO，世界卫生组织）是联合国负责全球卫生事业的专门机构，始建于1948年。WHO的宗旨是力求使各民族达到卫生的最高可能水平，WHO现有192个成员国，因为其全球性，它所提供的信息资源对发展中国家卫生保健的理论和实践具有重要参考指导价值。WHO丰富的信息资源整合为220个主题。既有各种具体疾病，也有各种公共卫生、环境、社会医学等重大问题。它所出版的一些工作报告、病情信息、标准、指南等等，对各国卫生事业发展都有指导意义。

（2）U．S．Food and Drug Administration（http：／／www．fda．gov）

U．S．Food and Drug Administration（FDA，美国食品与药品管理局）负责管理食品、药物、医疗器械、生物制品、动物喂养与药物、化妆品、放射－辐射产品审批、安全与药效等项目，负责向公众提供准确、有科学依据的药物、食品信息，以改善他们的健康。FDA有不少科学性和实用性很强的指导文件、手册等等，须我们深入发掘。它还有一些链接信息资源非常广泛的站点，如Oncology Tools、Food Safety．gov、foodrisk．gov等，借此可以综览全美国和欧洲许多信息。

（3）National Institutes of Health（http：／／www．nih．gov／about）

National Institutes of Health（NIH，美国国立卫生研究所）是美国公共健康服务中心的下属部门之一，隶属美国卫生与人类服务署（HHS），初创于1887年，作为美国最主要的医学与行为学研究和资助机构，NIH已经成为美国政府健康研究关注的焦点，成为世界最具影响的医学研究中心之一。NIH共拥有27个研究所及研究中心和一个院长办公室。NIH本身设有国立医学图书馆（NLM），负责编辑出版Medline。NIH不仅有下属实验室从事医学研究，还全力支持各大学、医学院校、医院等的非政府科学家及其他国内外研究机构的研究工作，并协助进行研究人员培训、促进医学信息交流。网站分卫生信息（Health Information）、科研基金（Grants ＆Funding Opportunities）、新闻（News ＆Events）、NIH科研培训与资源、下设机构（Institutes，Centers ＆Offices）、HIH介绍（About NIH）五大类目，用户可按需深入各栏获取信息，用户从该网站可获取美国医学卫生最新的研究信息、政策等。

（4）National Center for Biotechnology Information（http：／／www．ncbi．nlm．nih．gov）

National Center for Biotechnology Information（NCBI，美国国立生物技术信息中心）由美国国立医学图书馆1988年建立，是一个权威的生物信息门户网站，该中心的主要任务为：储存和分析分子生物学、生物化学、遗传学知识创建自动化系统；从事研究基于计算机的信息处理过程的高级方法，用于分析生物学上重要的分子和化合物的结构与功能；促进生物学研究人员和医护人员应用数据库和软件；努力协作以获取世界范围内的生物技术信息。

NCBI首先创建GenBank数据库，在重点开发GenBank的同时，又于1991年开发了Entrez数据库检索系统。该系统整合了GenBank、EMBL、PIR和Swiss－Prot等数据库的序列信息以及Medline有关序列的文献信息，并通过相关链接，将它们有机地结合在一起。NCBI还提供了其他数据库，包括在线人类孟德尔遗传（OMIM）、三维蛋白结构的分子模型数据库（MMDB）、人类基因序列集成（UniGene）、人类基因组基因图谱（GMHG）、生物门类（Toxonomy）等数据库。

（5）BioMed Central（http：／／www．biomedcentral．com）

BioMed Central（英国生物医学中心）是生物医学领域的一家最重要的开放存取杂志出版商，目前出版近220种可开放访问的生物学和医学领域期刊，可供世界各国的读者免费检索、阅读和下载全文。BioMed Central大多数期刊发表的研究文章都即时在PubMed Central存档并进入PubMed的书目数据库，同时还被Scirus，Google，Citebase，OAIster等数据库收录。其期刊管理系统集投稿、同行评审和编辑于一体，对期刊论文采用全面和严格的同行评审的方式保证了期刊论文的质量。主题涉及麻醉学、生物化学、生物信息学、生物技术、血液紊乱、癌症、心血管紊乱、细胞生物学、化学生物学、临床病理学、临床药理学、皮肤病学、发育生物学、生态学、应急医学、内分泌紊乱、进化生物学、兽医学、动物学等。BioMed Central提供的服务项目还包括F1000Biology、F1000Medicine等。

（6）Medscape（http：／／www．medscape．com）

Medscape（医景）是Medscape公司研制建立的，诞生于1995年6月，是web网上最大的免费提供临床医学全文文献和医学教育资源的网点，是面向临床医师和其他医疗卫生专业人员的交互式的商用web站点。它能及时提供有关临床医学信息，其最大优点是能免费获得许多重要文献的全文，并提供免费药物检索和最新动态医学新闻等。该网站涵盖临床与预防医学共30多个学科与主题，定期更新内容。其学术会议内容概述新颖丰富，继续教育功能很强，是国际互联网上少见的宝贵资源，常被其他重要学术网站和国内资深专家转述引用。其公共卫生和预防医学站点有教育资源、会议资源、资源中心、病人教育、公共卫生与预防医学图书馆、包含有多种公共卫生及预防医学杂志、参考工具书及图书资源、论坛等栏目，可检索大量的预防医学及公共卫生方面的文献信息。

（7）Medical Student（http：／／www．medicalstudent．com）

Medical Student（医学生）网站选材精而少，它着重于医学教育。涵盖基础、临床、预防医学30多个学科，影像资源丰富，所推荐的各种教科书注重教学实用。有些网站很有特色，如它所推荐的生化学、矫形外科等教材，儿科学、放射学、综合性网址目录、神经外科论坛等，可谓独具匠心。在内科学部分，除链接内科各大系统资源外，还推荐医学算法（medical algorithms），该网站提供7 000多个网上免费医学运算公式，覆盖45个医学学科。

（8）Doctors’Guide（http：／／www．docguide．com／general－practice／popular／30days）

Doctors’Guide（医生指南）为临床各学科或专题提供最近期刊论文或其他医学新闻信息，它所提供的病例讨论常引导医生深入学习。此外，它提供各学科国际会议消息，比较全面，综合医学、综述论文多。

（9）Biology Links（http：／／mcb．harvard．edu／BioLinks．html）

Biology Links（生物学链接）网站由哈佛大学分子与细胞生物学系制作，实质上是一个生物学的导航系统，主要内容有生物化学与分子生物学、生物分子与生物化学数据库、教育资源、进化论、免疫学、在线生物学杂志与论文、Zebrafish链接等。另外，还提供了许多有用资料的链接，如本专业的搜索引擎、图表、部分数据库、软件等等。

（10）MedExplorer（http：／／www．medexplorer．com）

MedExplorer（医学探索）网站是医学方面的搜索引擎，1996年建立，帮助人们从浩瀚的因特网上查找与医学／健康有关的信息。专题包括男性、女性、老人与儿童健康、性健康、过敏问题、疾病中心、癌症中心、健康中心等。提供站内搜索和web搜索，并设定了多达60个的限定词，用以查找精确的结果。

（11）National Center for Genome Resources（http：／／www．ncgr．org）

National Center for Genome Resources（NCGR，美国国家基因组资源中心）是一个非营利性研究组织，主要由国家科学基金会（NSF）、美国农业部和卡内基研究会等机构支持。NCGR不仅通过协作、数据管理、创造性的软件发展途径为科学家们提供关于生物信息学方面的解决方案，而且发展那些便于科学家们能更好地理解生物学数据的技术。其创建维护的DNA序列关系数据库Genome Sequence Database（GSDB）收集、管理并且发送完整的DNA序列及其相关信息，以满足主要基因组测序机构的需要。

（12）European Bioinformaties Institute（http：／／www．ebi．ac．uk）

European Bioinformaties Institute（EBI，欧洲生物信息学研究所）1994年成立于英国剑桥。EBI是欧洲分子生物学网（EMBnet）的一个特别节点，是一个非营利学术机构，是欧洲分子生物学实验室的一部分。EBI维护和发布的数据库有：EMBL核酸数据库、欧洲原始核酸数据资源库、SwissProt蛋白质序列数据库（与瑞士生物信息学协会合作）、TrEMBL（SwissProt的附属数据库，由EMBL数据库编码序列翻译而来的蛋白质序列数据库）、分子结构数据库（Molecular Structure Database，MSD）（与Brookhaven国家实验室（纽约）的蛋白质三维结构数据库PDB合作）、放射杂交数据库（Radiation Hybrid Database，RHdb）。

（13）High Wire Press（http：／／highwire．stanford．edu）

High Wire Press是全球最大的提供免费全文的学术文献出版商，于1995年由美国斯坦福大学图书馆创立。最初仅出版著名的周刊《Journal of Biological Chemistry》，目前已收录电子期刊710多种，文章总数已达230多万篇，其中超过77万篇文章可免费获得全文，这些数据仍在不断增加。通过该网站还可以检索Medline收录的4 500种期刊中的1 200多万篇文章，可看到文摘题录。High Wire Press收录的期刊覆盖以下学科：生命科学、医学、物理学、社会科学。

（14）Medical Matrix（http：／／www．medmatrix．org）

Medical Matrix是一种由概念驱动的免费全文智能检索工具，包括4 600多个医学网址，1994年由堪萨斯大学创建，现由美国Medical Matrix LLC主持，是目前最重要的医学专业搜索引擎。该网络检索具有内容全、不受限的临床医学资源的全方位列表，将站点根据性质、评估、内容、特色和临床内容水平分级，是一个可免费进入的internet临床医学数据库，提供了关键词搜索和分类目录搜索，最适合临床医师使用。

（15）Health on the Net Foundation（http：／／www．hon．ch）

HON是1995年建立于瑞士的一个非赢利性国际组织，其主要目的是为职业医师和普通用户提供实用可靠的网上医药卫生信息资源，还制定了医药卫生网站开发者的道德规范。HON的特色服务是提供了两个重要的医学专业搜索引擎（MedHunt和HONselect）、影像（多媒体）资源和专题档案（HONdossier）。HON针对不同的对象患者／个人（patients／individuals）、医学专业人员（medical professionnals）和网站发行者（web publishers）有不同的界面。网站主要包括如下信息服务：HONselect是一个多功能智能型的搜索引擎，具有英文、法文、德文、西班牙文和葡萄牙文5个版本。它采用美国国立医学图书馆的MeSH词表组织网络医学信息资源，允许用户查询MeSH词的释义和等级结构，而且通过MeSH词表将4个独立的数据库（Medline、HONmedia、DailyNews、MedHunt）集成在一起，采用统一的检索界面对MeSH词、网站、权威科技论文、医药卫生领域新闻和多媒体资源提供一体化检索。

（16）Bioline international（http：／／www．bioline．org．br）

Bioline International是一家提供发展中国家出版的高质量学术期刊开放获取的非赢利电子服务机构。收录了巴西、古巴、印度、印度尼西亚、肯尼亚、南非、乌干达、津巴布韦等发展中国家的数十种经同行评审的期刊，目的是使国际学术界了解发展中国家的生命科学研究成果。

思考与练习

1．请说出几种重要的医学外文专业数据库。

2．熟悉PubMed检索技术，检索有关肿瘤（neoplasms）引起贫血（anemia）方面的英文综述文献。分别通过主题和关键途径检索，比较检索结果的区别。

3．通过PubMed检索阿司匹林（aspirin）诱发哮喘（asthma）方面的文献，分别采用和不采用主题词的加权和扩展方法进行检索，比较检索结果的区别。

4．想了解我国医学卫生方面的最新出台的法律法规应到什么网站查找？

5．想了解我国食品药品相关的政策信息及相关业务流程应到什么网站查找？

6．提供免费期刊全文的网站有哪些？

7．想了解世界健康报告及相关数据应到哪个网站查找？