棉花播种覆膜后，由于地膜的增温保湿作用，通常膜下杂草出土早而集中，出草高峰期比露地直播棉田早10天左右，出草结束期比露地棉田早50天左右。杂草往往还能顶破地膜旺盛生长，为害更大，因此，地膜覆盖栽培棉花必须与化学除草相结合。由于膜内的高温高湿条件有利于除草剂药效的充分发挥，因此除草剂的用量可比露地直播棉田适当减少30%左右。由于膜内杂草的种类和数量与露地棉田相同，这就要求除草剂的杀草谱要广，而持效期则不必很长。
适用于地膜覆盖棉田使用的广谱除草剂，有乙草胺、氟草隆、扑草净、敌草隆、恶草灵等；还可用异丙甲草胺、乙草胺、氟乐灵和甲草胺等与杀阔叶杂草的除草剂混合使用。
1.乙草胺 为酰胺类选择性芽前除草剂，主要被杂草的幼芽吸收，根部吸收少，能抑制杂草细胞的蛋白质合成，使杂草幼芽和根停止生长，最后导致杂草死亡。因此，应在杂草出苗前施用乙草胺，杂草萌芽长大后则施用乙草胺不能杀死杂草。乙草胺对马唐、牛筋草、狗尾草、稗草、看麦娘、早熟禾、野黍、臂形草等禾本科杂草和碎米莎草有极好的防治效果，对马齿苋、反枝苋、刺苋、酸模叶蓼、春蓼、藜、龙葵、鸭跖草、菟丝子、刺黄花稔等阔叶杂草和黄花香附子也有较好的防治效果。在棉花播种覆土后，每亩可用90%乙草胺乳油35～45毫升，加水50升，均匀喷雾，然后覆膜压土。
2.氟乐灵 对一年生禾本科杂草，如马唐、牛筋草、狗尾草、旱稗、千金子等防治效果优异；对马齿苋、小藜、野苋菜和婆婆纳等小粒种子的阔叶杂草也有较好的防治效果，田间持效期50～60天。在棉花播种前或播后覆膜前，每亩用48%氟乐灵乳油80～100毫升，加水50升，均匀喷雾。施药后应马上混土3～5厘米深，以免氟乐灵光解失效。
地膜棉田也可在播种后覆膜前，每亩用80%氟草隆可湿性粉剂100～120克，或用50%扑草净可湿性粉剂80～100克，或用25%敌草隆可湿性粉剂150～200克，或用72%异丙甲草胺乳油80～100毫升，加水50升喷雾。也可每亩用48%氟乐灵乳油80毫升与50%扑草净可湿性粉剂80克，或与25%敌草隆可湿性粉剂100克混合，加水50升，均匀喷雾。使用含有氟乐灵的配方，需及时混土后再覆膜。
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