1.饲喂过程中，把握好卫生环节
（1）饮水卫生：经常（夏季应做到每日）清洗各类饮水器具，水可以用二氧化氯或其他含氯消毒剂消毒，饮用水须新鲜，不饮陈水、隔夜水，防止水中细菌滋生。治疗疾病需在水中加药，尽可能让鸡能一次饮完，过长时间喝不完的余水应废弃，注入新鲜水供鸡饮用。
（2）饲料卫生：许多肠道疾患是吃出来的毛病，饲料质量不佳，杂粕比例过大，隐性霉变，粗纤维过多，鸡消化不良，肠黏膜受损，诱发其他病原微生物感染而发病。保障饲料质量是预防肠道疾病的前提。
随吃随添，定量饲喂，避免积料，冬季不超过4小时，夏季不许超过2小时，防止细菌滋生或霉变。料槽、料斗与水槽、饮水器保持一定距离，防止饲料被水溅湿，发生霉变。
饲料装卸过程避免接触地面、不结物，料仓、料车、料斗无鼠、鸟害、无集料。严格饲料检验，查看保质期固然重要，但不可全信。备料天数越少越好，最长不许超过5日，超长天数的饲料要添加抗氧化剂（一般用乙氧基喹啉）、防霉剂（常用的有丙酸钙）。
（3）环境卫生。隔离、消毒：空舍时可用作用力强，同时腐蚀性也强的消毒剂冲洗、喷雾消毒；带鸡消毒必须用刺激性弱的消毒剂喷洒。注意通风，因为10次空气消毒也赶不上1次彻底通风，通风可以带走大量尘埃、废气、病菌，这是任何消毒措施也做不到的。
2.控制可见、可知应激因素 产蛋鸡对声、光、电、色、过冷、过热、转群、营养不良、环境卫生差、尘埃飞扬、氨气等十分敏感，最小的应激也可能导致大肠杆菌病的发生。必须时刻注意避免或控制应激。
3.防控传染病应激因素 相当多的消化道传染病是条件性疫病、并发病、继发病，在发生其他传染病之后，机体抵抗力下降，肠道菌失去制约条件，菌群平衡被破坏，大肠杆菌等有害菌超量繁殖，突破免疫屏障而造成机体发病。其他传染病防控成功，基本等于消化道传染病防控成功。
4.适当应用EM制剂（生物活菌制剂），以“菌”制菌肠道菌群，只要有益菌占有优势地位，其他细菌便难以过量繁殖而“兴风作浪”。应用EM制剂（生物活菌制剂），促进有益菌繁殖，以“菌”制菌。但是，由于生物活菌制剂都是在体外通过各种营养剂培育而成，体外的环境毕竟与体内不同，进入体内的生物活菌一般不容易为机体免疫系统识别、认同，原有的“微生态区系”排异性很强，定植困难。对刚出壳时雏鸡如能迅速采食到生物活菌制剂，由于此时雏鸡肠道还是空白，谁先抢到位置谁就成为优势菌。因此让雏鸡首先接触到生物制剂，让其中的有益菌活成长为优势菌，从而排斥大肠杆菌、沙门氏菌等有害菌，对以后防止肠道细菌感染有一定作用。
成鸡使用生物活菌制剂，必须先用3日左右的抗菌药物，清理肠道原有的菌群，之后再投喂生物活菌制剂，否则不易成为肠道优势菌群。
5.饲料添加“寡糖”，借其“清道夫”作用，清理肠道“寡糖”是一类化学结构极似葡萄糖的糖类物质，常用的有木聚糖、甘露糖等30余种，它们广泛分布于植物中。“寡糖”虽极似葡萄糖的化学结构，但无葡萄糖性质，不能被动物以及人类机体消化、吸收，更不能给机体提供能量，它却可以被乳酸菌等有益菌利用，作为其能量来源。同时“寡糖”还具有吸附作用，可将大肠杆菌等有害菌吸附住，随“寡糖”一起作为粪便排出体外。因此，“寡糖”被称为肠道的“清道夫”，饲料中适量添加“寡糖”，可促使有益菌繁殖，减少有害菌数量，维持肠道菌群平衡，可减少肠道细菌病发病率。
6.使用抗菌药物预防 有些养殖户，甚至是禽病工作者主张每月给鸡投喂一个疗程抗菌药物，以预防肠道传染病。投喂药物，可以抑杀有害菌，清理肠道，看起来有道理。其实在正常情况下，肠道菌群处于动态平衡，排斥外来菌，抵抗力较强，投喂药物有可能破坏这种平衡，资金浪费不说，对肠道也无任何益处，平时不需投药保肠道健康。那么什么时候需要预防性投喂抗菌药物以控制肠道有害菌呢？只有在鸡群受到应激之后，如转群、寒流到来、天气过于闷热、雷电交加、惊群或发现肠道疾患苗头时，可以适当投喂抗菌药物预防肠道疾病。抗菌药物应使用窄谱专杀灭静止期革兰阴性菌药物，如氨基糖甙类药物，尽量不用广谱杀菌药。
7.彻底治愈球虫病 排血便的急性盲肠球虫病，易发现，及时投药，伤亡不大。症状不明显的小肠球虫，破坏肠黏膜的完整性，易诱发溃疡性肠炎、坏死性肠炎、肠毒综合征与大肠杆菌病。应早发现、早治疗，从而减少肠道疾患。
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