浮游植物群落结构因季节而发生相应的变化(表2-7)。在洪湖藻类中，四季均出现的仅有34种。水温较高的夏季，有浮游植物102种，占全年全部种类的36.6%，其中硅藻类51种、绿藻类37种、蓝藻类9种，其他门类4种，分别占夏季种类总数的50.5%，36.6%，8.9%和4%;优势种类为格氏隐球藻、微小平裂藻、铜绿微囊藻，土生席藻、二角盘星藻、球囊藻等。秋季共有浮游植物123种，占全年总数的47.2%，其中绿藻类58种、硅藻类49种、蓝藻类12种，其他门类4种，分别占秋季种类数的47.2%、40%、9.8%和3%;优势种类为微小平裂藻，铜绿微囊藻，土生席藻等。冬季的浮游植物共有170种，占全年总数的60.7%，其中绿藻类72种，硅藻类62种，蓝藻类18种，其他门类17种，分别占冬季种类总数的42.4%、36.5%、0.6%和10%，优势种类为扁圆卵形藻多孔变种和小桥弯藻。春季共有浮游植物151种，占全年总数的53.9%，其中绿藻类86种，硅藻类39种，蓝藻类16种，其他门类10种，分别占春季种类总数的57.0%、25.8%、10.6%、6.6%;优势种类为极小集胞藻，具角鼓藻、双臂角星鼓藻、扁圆卵形藻多孔变种，小挤弯和斑纹窗纹藻索裂变种。
在洪湖藻类的季节变化中，除夏季以硅藻门种类占比例最大外，其他三季均以绿藻门的种类最多功能，硅藻门其次，蓝藻门居第三位。夏季的种类最少，而优势种类最多;冬季的种类最多，而优势种类最少。在洪湖藻类的季节变化中，春季鼓藻类贫营养型指示类群优势的存在表明，湖水的水质较好;而在夏秋季，中性污性水体指示种类微小平裂藻、铜绿微囊藻为主要的优势种群，说明夏秋季湖水的水质较差。
表2-7 洪湖浮游植物的种类组成及其季节变化
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