上述途径培育得到的植株，必须经过严格地鉴定，证明确实无病毒存在，才可以提供给生产应用。病毒检测，是确定草莓感染病毒种类和危害程度的重要技术手段。通过专门的病毒检测途径，确定草莓的栽培植株是否带有病毒、所带的病毒种类以及病毒的积累、危害程度等，对于选择无病毒原种苗、确定栽培草莓的病毒病危害情况，以及提出相应的防治措施，都具有重要的意义。
常见的草莓病毒病检测方法，有指示植物检测法、血清学检测法、分子生物学检测法以及电镜检测法。
指示植物，指的是对某种或某几种病毒及类似病原物敏感，并且能较快显现出特有症状的植物。检测草莓病毒病常用的指示植物有野生草莓的两种类群，一种是森林草莓（F.vesca），另一种是深红草莓（F.virginiana）。目前国际上检测草莓病毒病通用的，是森林草莓中的EMC、Apline、UC4、UC5、UC6，以及森林草莓中的UC11、UC12。其中，以EMC、Apline、UC4、UC5应用较多。
（1）检测病毒指示植物的种类及效果。
在几种常用的草莓病毒检测指示植物中，不同的指示植物有各自不同的检测病毒种类，对同种病毒显现出的症状也往往有明显的差异。
1）EMC。检测范围广泛，有较大的实用价值。由于它本身常常潜带潜隐病毒A，而易与其他病毒复合侵染，使显现的症状更加清晰。所以是草莓斑驳病毒、轻型黄边病毒及潜隐病毒C理想的检测指示植物。但它在夏季高温季节叶片易出现斑点，因而影响对斑驳病毒的症状确定。
2）Apline。对蚜虫传播病毒有很好的诊断效果，而常被用在草莓病毒的蚜虫传染实验中。对检测草莓斑驳病毒、镶脉病毒，皱缩病毒及轻型黄边病毒等，均有较敏感的症状反应。
3）UC4。对斑驳病毒、皱缩病毒和轻型黄边病毒，有较好的检测效果。但不能检测镶脉病毒和潜隐病毒。
4）UC5。对多种病毒敏感，对潜隐病毒尤为敏感，对卷叶病毒是唯一敏感的指示植物。该植物耐病毒侵染，适合保存病毒，而且长势旺，叶柄粗壮，在小叶嫁接中容易成活。
5）UC6。在检测草莓镶脉病毒中明显优于其他指示植物。而对轻型黄边病毒是无症寄主，可用作保存轻型黄边病毒。
6）UC11。对皱缩病毒特别敏感，很容易显现症状。
7）UC12。既是检测镶脉病毒最好的指示植物，也是深红草莓中对拟轻型黄边病毒唯一敏感的指示植物。
各种病毒在指示植物上虽有不同的典型症状，但在实践中，同一株草莓有多种病毒复合侵染，造成某种指示植物常有多种症状反应，使得症状的变化很大。因此，为了很好地明确病毒种类，采用了成套应用指示植物的做法，常将UC4、UC5、UC6和UC10这四种指示植物同时应用，并进行比较分析，从而保证了检测结果的准确性。在常用的指示植物中，UC5对多种草莓病毒的敏感性都比较高，而且其生长势强，叶柄粗，易嫁接成活，而作为检测草莓病毒比较理想的指示植物。
（2）草莓病毒病小叶嫁接检测方法。
1）检测材料准备。在嫁接接种前1.5～2个月，将预用指示植物单株盆栽，栽后置于温、湿度及光照控制较好的温室中，加强管理并注意防治病虫害，促使指示植物苗生长健壮、组织充实。在嫁接接种当天，从待检测病毒的草莓植株上剪取完整的成熟叶片，剪后放入装有清水的烧杯中，保持嫁接叶片湿润、新鲜。注意标明待检株标号。
2）嫁接接种。先剪去待检株叶片的左右两片小叶，用中央小叶并带有1.0～1.5厘米长的小叶柄，将叶柄下部用锋利的刀片削成楔形作为接穗，准备向指示植物苗上嫁接。选生长健壮的指示植物叶片，除去中央小叶，在保留两侧小叶的两个叶柄间向下纵切1.5～2.0厘米长的切口，而后把待检接穗迅速地接入切口中，用塑料薄膜带包扎嫁接口。每株指示植物苗可同时接数片同株待检株的叶片，以便进行检测症状的印证。为了确保嫁接叶片成活，嫁接后要把整株盆栽罩上塑料罩，以利于保温和保湿。
3）症状观察。小叶嫁接后秋季经14～20天，春、冬季经25～30天，接入的小叶不萎蔫，不枯死，即表明嫁接成活。这时可剪去未嫁接的老叶，继续加强嫁接苗的管理，定期观察新长出叶片上的症状表现。发病调查一般应连续进行1.5～2个月。
4）主要病毒的症状表现。症状出现的时间，草莓斑驳病毒的症状往往显现最早，一般在嫁接成活后7～14天即有症状表现；其次是草莓镶脉病毒和轻型黄边病毒，两者显现症状的时间分别为15～30天和24～37天；草莓皱缩病毒显现症状最晚，要在嫁接成活后39～57天才表现出来。
在我国已经调查明确的四种蚜虫传播病毒，它们的最佳指示植物及主要症状表现见表1。
表1 四种蚜虫传播草莓病毒的检测指示植物及主要症状
病毒复合侵染的症状表现为：当斑驳病毒与轻型黄边病毒复合侵染时，幼叶褪绿并卷曲成杯状，叶柄缩短，植株矮化。斑驳病毒与皱缩病毒复合侵染时，表现出明显的皱缩症状。斑驳病毒与镶脉病毒复合侵染时，两种病毒都表现症状，但斑驳症状占优势。
植物病毒是由蛋白质和核酸组成的核蛋白，因而是一种较好的抗原，给动物注射后会产生抗体，抗体存在于血清之中称为抗血清。不同病毒产生的抗血清有各自的特异性。用已知抗血清可以鉴定未知病毒的种类。这种抗血清就是高度专一性的试剂，这种方法特异性高，测定速度快，一般几小时甚至几分钟就可以完成。所以抗血清法成为植物病毒鉴定中最有用的方法之一。抗血清鉴定法要进行抗原的制备（包括病毒的繁殖，病叶研磨和粗汁液澄清等），抗血清的采收，分离等。血清可分装到小玻璃瓶中，贮存在-15～-25℃的冰冻条件下。测定时，把稀释的抗血清与未知的病毒植物在小试管内混合，这一反应导致形成可见的沉淀。然后根据沉淀反应来鉴定病毒。
在草莓的病毒检测中，传统的方法是采用指示植物法进行生物学检测。这对确定病毒的侵染性和检测病毒的实用性，都有重要意义。但是，这种方法总共需要较长时间，有时还需反复验证，特别是在检测环境条件不能保证时，很容易造成检测结果不准确，近年建立并应用了血清学检测方法以后，缩短了检测时间，也保证了检测的准确性，但是仍存在着有些病毒的抗血清难以制备，病毒含量低时难以检测，以及植株体内常存在着某些干扰物质影响检测准确性等缺点。特别是对那些没有外壳蛋白的病原核糖核酸，如类病毒，无法用血清学方法进行检测。近年在很多植物的病毒检测中，研究并开始应用了分子生物学检测方法，在检测病毒的灵敏度、特异性反应及检测速度等方面，都克服了血清学方法的很多不足，逐步形成了一条新的检测途径。现在有三种分子生物学方法检测草莓病毒。
（1）双链RNA法。草莓在受RNA病毒侵染的植物体内，有相应复制形式的双链RNA存在，而在健康植株中未发现病毒的dsRNA。
（2）核酸分子杂交检测法。用互补DNA检测草莓单链RNA病毒的方法，又称DNA分子杂交法。
（3）聚合酶链反应（PCR）检测法。一种体外快速扩增病毒核酸序列并加以检测的技术。
借助电子显微镜能分辨0.5微米大小的病毒颗粒。这样可以直接观察病毒，检查出有无病毒存在，了解病毒颗粒的大小、形状和结构，又可以鉴定病毒的种类。这是一种较为先进的方法，但需一定的设备和技术。
由于电子的穿透力很低，制品必须薄到10～100微米，通常制成厚20微米左右的薄片，置于铜载网上，才能在电子显微镜下观察到。
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