（一）科学哲学史的研究框架
科学哲学史研究的问题是：科学哲学诞生、孕育、发展的历史进程与基本脉络。研究的对象是：科学哲学，即关于科学的哲学思考。包括科学哲学发展各阶段典型代表人物和学派的科学哲学思想，其特点和主题转变；也包括各分支科学哲学的发展，研究其历史演变和特点。
研究的主要内容可归结为如下几个关联板块。
1.科学哲学的兴起：从自然哲学到科学哲学。基本内容包括：亚里士多德、笛卡尔、培根、莱布尼茨、圣西门等哲学家的科学哲学思想研究；伽利略、牛顿等科学家的科学哲学思想研究；前科学哲学的主旨、特点、问题和方法；孔德等第一代实证主义者的科学哲学思想研究；马赫等第二代实证主义者的科学哲学思想研究；逻辑实证主义研究；逻辑原子主义研究；预设主义研究；正统科学哲学的主旨、特点、问题和方法。
2.现代科学哲学的发展：流派与分支。基本内容包括：一般性科学哲学的发展，表现为相继出现的各个流派研究，如证伪主义研究，操作主义研究，科学哲学的历史主义转向研究，过程哲学研究，历史主义研究，逻辑实用主义研究，科学哲学的建构主义转向研究，新历史主义研究，科学实在论与反科学实在论研究，知识社会学（SSK）研究，建构主义科学哲学的主旨、特点、问题和方法研究。分支性科学哲学的发展近年来生气勃勃、方兴未艾，引人注目的如数学哲学、物理学哲学、生物学哲学、系统科学哲学、认知科学哲学、社会科学哲学等等。
3.后现代科学哲学的发展与问题。基本内容包括：海德格尔科学哲学思想研究，马尔库塞、哈贝马斯等法兰克福学派科学哲学思想研究，福柯、利奥塔、德里达等后现代主义科学哲学思想研究，费耶阿本德、罗蒂等分析哲学叛逆者的科学哲学思想研究，女性主义科学哲学研究，后殖民主义科学哲学研究，生态主义科学哲学研究，媒介生态学科学哲学思想研究，技治主义研究，另类科学哲学的主旨、特点、问题和方法，后现代科学哲学基本格局和未来走向研究。
这些内容可以看作纵向的动态研究，大致按照时间顺序依次研究前科学哲学、现代科学哲学（包括正统科学哲学、历史主义科学哲学、部分建构主义科学哲学，还包括若干重要的分支性科学哲学）、后现代科学哲学。每一个时期的研究大致以学派为基点，每个学派又以代表人物为轴线展开。
（二）科学哲学史研究的基本取向
科学哲学史研究的基本取向是：
1.融贯问题学与学派史。科学哲学总论有问题学的叙述传统，比较缺乏学派史的叙述方式。问题学直面核心问题的提出、应答、流变、增生和转换，而学派史以代表人物先后出场顺序自然呈现观点的继承、更新、进步和断裂。两者结合，一纵一横，视角更为完整，叙述更为丰满。
2.整合分析传统与人文传统。科学技术哲学长期以来被局限于分析传统中，以逻辑实证主义及其发展、回应和批判为主流。由于分析传统被看作英美哲学传统，大陆哲学则多被贴上人文哲学的标签，往往非分析的科学技术论被排除在科学哲学的学科视域之外。20 世纪后期，科学技术哲学开始把目光投向分析哲学传统之外的欧陆哲学资源，海德格尔、福柯、马尔库塞、哈贝马斯、利奥塔和德勒兹等原先被排斥在科学哲学之外的思想资源日渐受到关注，学界开始回顾性地把科学技术论分成分析—英美和人文—欧陆两大阵营。典型的比如劳斯认为，英美科学哲学家继承了分析传统，热衷于为科学制定明确的认识目标、方法及其推论形式，担负起对科学作批判性反思的任务，这种反思基本都局限在科学事业的内部；欧陆科学哲学家则继承了人文传统，往往否定自然科学的完美性，主要思索科学与其他社会实践形式的关系，关注自然科学的社会、心理和政治等非传统认识论方面。科学哲学史的研究要打破科学哲学界长期形成的英美分析传统和欧陆人文传统之间的隔阂。
3.走向审度科学的基本立场。应当以怎样的立场对科学进行哲学反思？恰当的态度是审度。审度，不是折中主义，而是整合对立观点，从而作出针对性的选择。实际上，辩护者与批判（解构）者的激烈辩驳，催生了一种比较宽容的、平和的、但不失基本坚持的科学哲学倾向。从历史发展来看，科学论也是大致经历了一个对科学从辩护到审度的转变。科学论产生之初，主要宗旨是为科学辩护，即证明自然科学的合理性，并试图用科学方法改造人文社会科学，甚至把非科学问题划归为无意义命题。辩护科学的思路在逻辑实证主义那里发展到了顶峰。但到20世纪下半叶，对科学的质疑愈演愈烈，甚至走向全盘否定科学的极端，出现了形形色色的“反科学论”。然而，对科学的全盘否定显然是不能贯彻到底的，也是与常识和现实需要不一致的，很快又引起了反弹，20世纪末的“科学大战”就是佐证。对待科学，科学哲学不能一味地辩护，也不能一味解构，而是要走向谨慎的、历史的和具体的审度。所谓“谨慎”，就是摒弃先入为主的情绪；所谓“历史”，就是随着时代变迁不断审视科学，不能对科学下一劳永逸的断语；所谓“具体”，就是要将不同领域、不同地区、不同民族、不同对象的科学问题区别对待。这样作出的选择方能在特定的时空条件下站稳脚跟。
总之，科学哲学史的研究应立足于第一手文献资料的梳理，以集成和整合国内外科学哲学史研究的第二手资料为抓手，以厘清科学哲学的发展脉络与流变史为目标，采取广泛调研、挖掘提炼、互动协同、分进合围的路线推进。
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