自唐高宗咸亨元年（公元670年）吐蕃与朝廷反目相攻伐起，朝廷两次以文成公主、金城公主下嫁，可其时盟时叛，至唐玄宗开元十六年（公元728年）的近60年间，一直是朝廷最大的心腹之患。玄宗即位以来，特别重视对吐蕃的防御和征伐，曾下诏准备御驾亲征，足见其欲平定吐蕃的强烈意愿和决心。所以，当萧嵩的捷报传来，玄宗李隆基龙颜大悦，深为自己选将得人而自得。尚书右相张说本与萧嵩亲善，宰相杜暹也以西域军功而进，二人极力称颂萧嵩之功德才干，足堪宰辅。他二人所说正是玄宗所想，当即传下诏书，任命萧嵩为兵部尚书、同中书门下平章事，仍遥领河西节度使。此时，唐朝宰相制度已与唐初不同，自高宗以后，除中书令之外，尚书左、右相（即唐初的仆射）、门下省的侍中，如不加任“同中书门下平章事”或“同中书门下三品”，便不能参掌朝政，只有加任“平章事”“三品”者才是宰相。
中使奉诏星夜赶赴凉州，宣达皇帝的敕书，迎接萧嵩入京上任。萧嵩即入京，保荐牛仙客为太仆少卿，兼任凉州别驾、知河西节度留后事，即代萧嵩主凉州政务、节度府军务。
开元十七年（公元729年）六月，玄宗又任命萧嵩兼任中书令，以兵部侍郎裴光庭为中书侍郎、同中书门下平章事。自开元十四年（公元726年）四月张说被免去中书令之后，中书令一职空缺已达三年多，“其品位既高，不欲轻以授人。”一被任命为中书令者，实际上就相当于朝廷的首相。又加萧嵩为集贤殿学士、知院事，兼修国史，进勋位为金紫光禄大夫。
萧嵩有子二人，长子萧华，次子萧衡。时萧华已经结婚，玄宗赐婚于萧衡，把自己的女儿新昌公主下嫁。萧嵩、唐玄宗便成了儿女亲家。萧嵩夫人贺氏，入皇宫觐见，玄宗以“亲家”相称，礼仪极为恩重、亲切。不久，皇太子李瑛娶太常少卿薛绦之女为太子妃，特命萧嵩为迎亲大使，并加封为徐国公。当时在满朝文臣武将之中，玄宗待萧嵩“恩顾第一”，极为信重。此时，萧嵩年约62岁，加授官阶如下：
官职：中书令 正二品
兵部尚书
河西节度使
加官：集贤殿学士
知翰林院事
兼修国史
勋封：金紫光禄大夫
爵封：徐国公
开元十八年（公元730年）正月，进中书侍郎、同中书门下平章事裴光庭为侍中，不久又让他兼吏部尚书，与萧嵩共掌朝政，然而二人自开元十六年同时入为宰相以来，议事多不合。
裴光庭（公元676年—公元733年），是武则天时代名将裴行俭之子，其父死时裴光庭年仅7岁，颇得武则天的眷顾，赐婚武三思之女，累迁至太常寺丞。武氏败，裴光庭因为武三思的女婿被贬为郢州司马。唐玄宗开元中，召还京，被任命为兵部郎中、鸿胪少卿，不久被任命为宰相。裴光庭性格恬静沉默。萧嵩仪容俊伟，须髯秀美，处事谨慎机密，官吏没有谁能察知他想法。唐玄宗开元年间堪称贤明之君，深知“君不密则失臣，臣不密则失身”的君臣之道，对其二人既信重而又守密，左手用裴光庭，右手用萧嵩，加之二人性格皆内向，故而裴光庭与萧嵩争权渐生猜忌。裴光庭出任侍中兼吏部尚书后，对官吏的升迁制度做了重大改变，以限制萧嵩而扩大自己的权力。
在此之前，吏部选用官吏只看候选人员能否胜任，因而有的人就能被超越资历提拔，有的人则总是在低级职位上，甚至20年了仍未得到正式官位。裴光庭奏请：按照资历统一排队，限定年资逐级晋升，不许越级提拔，只要不是受到处罚，只要排队排到了，就可升迁，没有降职的。制书颁行后，那些平庸之辈、久滞未得升迁的官吏无不欢心鼓舞，称此法为“圣书”；而那些才华超众之士无不怨忿叹息。而做出这种改革的裴光庭恰恰是以极快的速度被越级提拔上来的。与之相反，逐级升迁上来的萧嵩和已被免去宰相之职、时任尚书右丞相、有一代贤相之称的宋璟却极力反对。双方在朝堂上下曾做过激烈的争辩，请求废除此法。萧嵩在私下也多次在玄宗面前批评此法之弊。显然，在这个问题上裴光庭是错的，而宋璟、萧嵩的意见是对的。玄宗虽开始疑惑，可又觉得刚刚颁行，不宜轻废。所以，裴光庭获得了暂时的胜利。开元二十年（公元732年）三月，裴光庭又下令：此后，凡京官外放所任代理官职，也必须经门下省审议通过。当时，门下省主事阎麟之是裴光庭的心腹，专管吏部选任官吏，凡阎麟之裁定的人选，裴光庭从不审察，当即下笔批准。时人讥讽说：“麟之口，光庭手。”
当时，有人上书请以皇室为“金”德，萧嵩奏请召集百官认真讨论此事。裴光庭站出来极力反对，私下对玄宗说：
“国家符命，久已记于史册，现在突然改易，恐怕要被后人嘲笑。”
于是，又下诏百官停止讨论此事。萧嵩不断退让，而裴光庭却不断进逼。萧嵩心有怨愤，却多忍而不发。开元二十一年（公元733年）三月，裴光庭突然病故，萧嵩奏请停止了裴光庭的所谓“循资格”而选吏之法。太常博士孙琬遵从萧嵩之意，在讨论裴光庭的谥号时说：
“裴光庭依据资格任用官吏，有失朝廷勉励人才之道，请谥为‘克’。”
于是以“克”为其谥号。其子裴稹上表申辩，玄宗亲自赐裴光庭谥号为“忠献”。
裴光庭既死，朝堂相位空缺，玄宗让萧嵩推荐宰相的人选。萧嵩当年在中书舍人任上，与同僚王丘关系较密切，深知王丘有高才，为官清明，为人正直。王丘时官居右散骑常侍、知制诰，萧嵩准备推荐他为宰相，王丘执意推辞，又盛推尚书右丞韩休。于是，萧嵩向玄宗保荐韩休，诏命韩休为黄门侍郎，同平章事，以王丘为御史大夫。
韩休为人严峻正直，不图名利。其出任宰相，朝廷群臣多以为得人开始，萧嵩认为韩休恬淡平和，有才干，共事容易，因此保荐了他。没想到韩休出任宰相后刚正不阿，于是，萧嵩渐渐地开始不安起来。玄宗有时在宫中设宴作乐，或到禁苑游玩狩猎，稍有过失和差误，便问左右随从：
“韩休他知道此事吗？”
话音刚落，韩休劝谏的表章就送到了。玄宗曾对着镜子沉默不语，心中不快。侍从见状进言道：“韩休任宰相才几个月，可陛下却瘦了许多，何不罢去呢？”
玄宗叹息道：“朕的面容虽然瘦了，但天下定会富裕。萧嵩奏事常顺从朕的旨意，可是退朝后朕连睡觉都不安稳。韩休经常与我激烈辩争，可是每日退朝后朕睡觉却十分安稳。朕任用韩休是为了国家社稷，并非是为朕自己。”
宋璟赞叹道：“没想到韩休当了宰相，却还能持守刚正不阿的节操。很多人居高位之后，为了保住自己，大都弃正归邪，阿谀奉承。韩休却坚守操行，难得啊！”
韩休多次当着玄宗的面与萧嵩发生争执，并批评萧嵩的短处，玄宗对此有些不高兴。萧嵩也深感不安，决心激流勇退，不再贪恋仕途，于是奏请告老退休。玄宗特召萧嵩，对他说：
“朕并未厌弃您，爱卿为什么要突然弃朕呢？”
萧嵩去意已决，回答说：“臣承蒙陛下的深恩厚泽，以无才无德之躯而谬居宰相，富贵已极。现在趁着陛下还没有讨厌老臣，臣方能体面地平安退去，如若陛下已经厌恶老臣，臣的脑袋都要难保了，哪里还能体面地告老退休呢？”
说着竟老泪纵横，跪倒不起。玄宗深为感动，眼圈发红，急忙起身上前将萧嵩扶起，很忧伤地说道：
“爱卿情真意切，可朕一时也难以决定。您可先回府第，容朕三思，今晚一定给您一个答复。”
这天晚上，玄宗派高力士赴萧府传诏说：“朕思之再三，还将留您在朝，以成君臣之谊有始有终。”
十二月二十四日，诏免萧嵩中书令而为尚书左丞相，韩休为工部尚书，任命裴耀即为黄门侍郎，与中书侍郎张九龄同为宰相。
萧嵩时年约66岁。在朝任宰相共六年，官至中书令，然政无异绩，也无大恶，可谓守成之相也。
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