十一、真核中的转录激活因子
1.列出真核转录因子中发现的三种不同类型的DNA结合域。
2.列出真核转录因子中的三种不同类型的转录激活域。
3.画出锌指结构的详细结构图，并指出该结构中的DNA结合基序。
4.列出典型的原核螺旋-转角-螺旋结构域和Zif268锌指结构域的一个重要的相似之处和三个不同之处。
5.画出两分子GAL4蛋白N端65氨基酸的二聚体与DNA作用的结构图。图中必须清楚地画出二聚化结构域，以及与DNA作用的两个DNA结合域中的基序。在每个DNA结合域中需要什么金属离子和相应的氨基酸，各需要多少？
6.一般而言，核受体的功能是什么？给出三个例子。
7.一个核受体的每个DNA结合域中需要什么金属离子和相应的氨基酸，各需要多少？ DNA结合域的哪个部分与DNA碱基相互作用？
8.在糖皮质激素受体识别的half-sites间加入一个额外的碱基，结果会怎样？
9.同源(异型)域有什么性质？它与其他哪种DNA结合域最为相似？
10.画出亮氨酸拉链的侧面示意图。画出从尾部角度观测亮氨酸拉链的示意图。这些图如何揭示亮氨酸拉链结构和功能之间的关系？
11.画出bZIP蛋白与DNA-结合位点之间相互作用的示意图。
12.用实验证明：基因特异性转录因子的DNA结合域和转录激活域是相互独立的。
13.说出II型前起始复合物招募(recruitment)的两种模型，一个涉及全酶，另一个则不涉及。
14.用实验证明：酸性的转录激活域结合TFIID。
15.用实验证明：GAL4-AH只有在前起始复合物形成前加入，才能激活转录。
16.用实验证明：GAL4的功能之一是为前起始复合物招募TFIIB。
17.设计一个实验证明：TFIIB直接与酸性激活域结合，并给出阳性结果。
18.TFIID，而不是TBP，能够协同GAL4-AH在腺病毒E4启动子处激活转录。但是，TBP和TFIID在协助GAL4为前起始复合物招募TFIIB中起到同等重要的作用。给出一个假说解释这些现象，并用实验证明该假说。
19.用实验证明：多重GAL4结合位点增强转录的效率比单一GAL4结合位点要高很多。
20.为什么多重GAL4结合位点增强转录的效率更高？设计一个实验进行证明。
21.画出一个模型图，解释一个转录激活因子(如GAL4)与一般转录因子相互作用从而增强转录。哪些步骤依赖于TAF，哪些不依赖？
22.支持全酶招募模型(holoenzymerecruitmentmodel)的证据有哪些？
23.为何蛋白质二聚体(或四聚体)结合DNA的效率比单体高很多？为什么说转录激活因子对DNA具有高亲和力非常重要？
24.给出3个模型解释增强子如何作用于几百个碱基之外的启动子。
25.用实验证明：从一段DNA中分离出的增强子可以与另一段含有启动子的DNA相互作用。这个实验支持哪个增强子作用模型？为什么？
26.对一个基因而言多重增强子有什么优势？
27.LiCl引起过多的内胚层生成，从而阻止了海胆胚胎的发育，解释原因。
28.LEF-1是人T细胞受体α链的激活因子，但是LEF-1自身并不能激活该基因。LEF-1是如何作用的？说出实验证据。
29.LEF-1结合到靶DNA的大沟还是小沟？给出证据。
30.隔离体(insulator)有什么作用？
31.用实验证明介体(mediator)的作用。
32.作图说明CBP分别作为磷酸化CREB和核受体介体(mediator)的作用。
33.信号转导途径如何放大信号？举例说明。
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