2005年12月2日由中华医学会肝病学分会与中华医学会感染病学分会联合制定了《慢性乙型肝炎防治指南》，确定了乙肝疫苗的具体接种程序。规定乙肝疫苗全程接种共3针，按照0、1、6个月程序，即接种第一针疫苗后，间隔1及6个月注射第二及第三针乙肝疫苗，简称为“0、1、6方案”。根据具体接种人群和疫苗的不同种类，又有不同的要求。
（1）新生儿：接种乙肝疫苗的时间越早越好，要求在出生后24小时内接种。
①HBsAg阴性母亲所生的新生儿：按上述“0、1、6方案”，每次接种5微克成10微克重组酵母或10微克中国仓鼠卵母细胞（CHO）乙型肝炎疫苗。
②HBsAg阳性母亲所生的新生儿：应在出生后24小时内尽早注射乙型肝炎免疫球蛋白（HBIG），最好在出生后12小时内，剂量应≥100U，同时在不同部位接种10微克重组酵母或20微克CHO乙型肝炎疫苗，可显著提高阻断母婴传播的效果。也可在出生后12小时内先注射1针HBIG，1个月后再注射第2针HBIG，并同时在不同部位接种一针10微克重组酵母或20微克CHO乙型肝炎疫苗，间隔1和6个月分别接种第2和第3针乙型肝炎疫苗（各10微克重组酵母或20微克CHO乙型肝炎疫苗）。后者不如前者方便，但其保护率高于前者。新生儿在出生12小时内注射HBIG和乙型肝炎疫苗后，可接受HBsAg阳性母亲的哺乳。
（2）儿童：对于既往未接种过乙肝疫苗或虽接种过乙肝疫苗，但目前两对半检查亦全为阴性的儿童，按“0、1、6方案”，每次接种5微克重组酵母或10微克中国仓鼠卵母细胞（CHO）乙型肝炎疫苗。
（3）成年人：对于既往未接种过乙肝疫苗或虽接种过乙肝疫苗，但目前两对半检查亦全为阴性的成年人，按“0、1、6方案”，每次接种20微克重组酵母或20微克CHO乙型肝炎疫苗。
（4）疫苗功能低下者：应增加疫苗的剂量（如60微克）和针次。
（5）3针免疫程序接种无应答者：可再接种3针，并与第2次接种3针乙肝疫苗后1～2个月检测血清中抗体。如无应答，可接种一针60微克重组酵母乙型肝炎疫苗。
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