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监测环境中特定微生物的存在及其动态

时间:2023-02-14 理论教育 版权反馈
【摘要】:这种方法已被成功用于检测环境中对生态过程起重要作用的细菌的存在,如研究中在得到DGGE带谱后,将其印迹转移到尼龙膜上并与硫还原细菌特异性探针进行杂交,如与其中一样品的带谱出现了强烈的杂交信号,则表明环境中存在硫酸还原细菌。
监测环境中特定微生物的存在及其动态_环境微生物学(下

四、监测环境中特定微生物的存在及其动态

传统的微生物分离鉴定耗时费力,难以进行,而分子生物学技术的发展提供了新的对环境中微生物检测、监测的新的技术和理论方法。这里所说的监测是对已知和已认识微生物的监测与跟踪。

研究方法是首先从环境样品直接提取总DNA,经PCR扩增(特异或通用引物)得到含有某一高变区或代表区序列产物,通过DGGE得到带谱。用种或类群专一性探针与得到的条带进行杂交或将条带切下,重新扩增后测序,进而得到条带所反映的种类和种群存在的信息。

这种方法已被成功用于检测环境中对生态过程起重要作用的细菌的存在,如研究中在得到DGGE带谱后,将其印迹转移到尼龙膜上并与硫还原细菌特异性探针进行杂交,如与其中一样品的带谱出现了强烈的杂交信号,则表明环境中存在硫酸还原细菌。用PCR和RTPCR技术,准确评价了恶臭假单胞菌ATCC11172菌在已有微生物系统中对脱酚效果的影响,并观察了该菌的降解性基因在系统中表达的情况。

许多学者对细菌中的荧光基因(1ux gene)进行克隆,转移到具有分解能力的特种微生物体内,具有分解能力的菌体中就有了特定的荧光标记,通过对荧光菌和荧光量的监测可以达到对专门细菌的跟踪,并可以了解到它们与其他菌株之间在分解过程中的关系。

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