【摘要】：过去往往只限于对在实验室条件下可培养的一些细菌进行研究，而对那些尚不能被培养的细菌，只能据其与被广泛研究的种类之间的关系、生境以及与其活性相关的地球化学现象来推测其可能具有的特性。而现在，基因测序的先进性意味着能够通过分析基因编码的关键酶类来预测尚未被培养细菌种类的代谢本质。表1-1 细菌域的门、纲和代表属名称续表图1-14是利用16S rDNA序列建立的细菌域进化谱系树，多数分支的代表种类都能在海洋生境中发现。
海洋细菌_海洋微生物工程
伴随着分子生物学技术的发展，以16S rDNA测序技术为代表的分子生物学方法已广泛应用于细菌分类学的研究，这标志着对细菌分类已从表型水平发展到基因型水平，这是细菌分类学研究上的一步很大的跨越和一次极为重要的改革。过去往往只限于对在实验室条件下可培养的一些细菌进行研究，而对那些尚不能被培养的细菌，只能据其与被广泛研究的种类之间的关系、生境以及与其活性相关的地球化学现象来推测其可能具有的特性。而现在，基因测序的先进性意味着能够通过分析基因编码的关键酶类来预测尚未被培养细菌种类的代谢本质。
《伯杰氏细菌学手册》是当前国际上普遍采用的细菌分类系统。从20世纪80年代初起，该手册的撰写发起人组织了20余国的300多位专家，合作编写了4卷本的新手册，书名改为《伯杰氏系统细菌学手册》（Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology），并于1984～1989年分4卷陆续出版。这本书在表型分类的基础上，广泛采用细胞化学分析、数值分类方法和核酸技术，尤其是16S rDNA核苷酸序列分析技术，以阐明细菌的亲缘关系。表1-1是《伯杰氏系统细菌学手册》第二版中细菌域的23个门、纲和代表属的名称。
表1-1 细菌域的门、纲和代表属名称
续表
图1-14是利用16S rDNA序列建立的细菌域进化谱系树，多数分支的代表种类都能在海洋生境中发现。
图1-14 建立在16S rDNA序列基础上的细菌域进化谱系树（引自Munn，2003）
黑体字表示有海洋种类的分支
下面，介绍一些代表性的海洋细菌：
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