【摘要】:蛋白质的折叠是指一个蛋白质从它的变性状态转变到它的特定的生物学天然构象的过程。各种光谱技术、质谱和核磁共振等试验方法都可用来研究蛋白质的折叠,为研究蛋白质折叠速率预测积累了许多实验数据。为了理解蛋白质的折叠机理,其重要任务之一便是确定蛋白质折叠速率的决定因素。许多对小的二态蛋白质的理论研究表明,蛋白质的大小、状态以及结构特征等都对其折叠速率产生影响,但在揭示它们的相互关系过程中受到种种限制。
蛋白质的折叠是指一个蛋白质从它的变性状态转变到它的特定的生物学天然构象的过程。现在人们已经普遍接受了共翻译折叠的理论,认为mRNA在核糖体上翻译的过程中,蛋白质折叠就开始了[14],这一过程遵循自由能减少规律,即蛋白质在一定时间内沿着某一或某些特定的路径(过渡态系综)达到其自由能最小(极小)的天然构象[5]。各种光谱技术、质谱和核磁共振等试验方法都可用来研究蛋白质的折叠,为研究蛋白质折叠速率预测积累了许多实验数据。为了理解蛋白质的折叠机理,其重要任务之一便是确定蛋白质折叠速率的决定因素。许多对小的二态蛋白质的理论研究表明,蛋白质的大小、状态以及结构特征等都对其折叠速率产生影响,但在揭示它们的相互关系过程中受到种种限制。经过多年的努力,到现在已经产生了许多较好的方法,能够比较精确地预测出一些小型蛋白质的折叠速率[6]。有的蛋白质折叠需要几毫秒,而有的蛋白质折叠需要几小时,所以不同蛋白质的折叠速率(蛋白质折叠所用时间的倒数,用kf表示,单位为秒-1(s-1))差别很大,为了便于不同蛋白质折叠速率的比较,人们常用ln(kf)来表示蛋白质的折叠速率。蛋白质折叠速率的预测方法大致分为基于蛋白质三级结构的预测方法,基于蛋白质二级结构的预测方法和基于蛋白质一级结构的预测方法。
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