世纪到世纪初

欧洲文艺复兴以后，化石是生物起源的见解终于渗透人心，成为学界的共识。但是，当时科学依然被强大的宗教思想所束缚。在17世纪的博物学者中，有两位博物学者的成就值得注目。一位是出生在丹麦、活跃在意大利的斯泰诺（N.Steno，1638—1686）。斯泰诺通过对意大利托斯卡纳的地质构造的考察确立了地层层序律（law of superposition of strata，1669）和结晶面角一定的法则，在地质学、矿物学上赢得很高的评价。在古生物领域，他认可化石的生物起源的理论，并通过实际比较，指明舌石是巨大鲨鱼的牙齿。斯泰诺在治学方法上与文艺复兴时代的学者有所不同，他很少依赖古典教义，而是基于自己的调查、观察，积极进行思考、讨论，导出结论来。虽说斯泰诺有着求是的精神，但最终还是未摆脱宗教观念的影响。例如，在陆地上能找到海生生物的化石，他认为是由于大洪水特别是圣经中讲到的诺亚大洪水造成的。在17世纪到18世纪初，值得提起的另一位学者是英国人雷。在分类学发展中曾提到过他的成就。对待化石，雷持有相当慎重的态度，他认为化石既有生物起源的，也有无生物起源的。如鹦鹉螺化石，由于在现存的生物中看不到有与其类似的类型，于是，雷便认为鹦鹉螺化石是属于无生物起源的。这是因为在当时，不仅限于雷，学界普遍没有生物灭绝的概念，认为生物是由神创造的，因而生物都是不灭的，相信与所有化石生物相同的生物类型一定还生存在地球的某个地方，不过未找到它们罢了。

关于高山上发现海洋生物化石的问题，那时诺亚洪水的说法依然保持着强势，可也有人提出是大地震使海底隆起成山的主张。这种主张是颇为进步的。另外，当时学界普遍认为地球的历史不过只有几千年，根本想不到会有多少亿年。因而对化石的古老性也认识不足。