正当美好的前景向培根招手时，一件突然发生的事却改变了培根的命运。1579年，培根的父亲尼古拉·培根突然病故，培根只得中止了他在英国驻法大使馆的服务，奔父丧回国。失去父亲，让培根异常悲痛，而且随之而来的还有物质上的巨大损失。本来尼古拉很宠爱这个小儿子，正在特别储蓄着一大笔款项，准备购买相当可观的田产，作为培根日后生活的费用。可是，由于尼古拉的突然去世，这个计划告吹了。最后，作为5个儿子中的一个，培根仅仅继承了父亲遗产的五分之一。培根的经济状况突变，一下子陷于穷困之中。而且，由于家庭环境和本人性格的影响，过惯了奢华生活的培根又不能节省开支。所以此后，培根一直处于负债的境地。
培根回国后，即住到葛莱律师公会，一面学习研究法律，一面到处谋求职位。1582年，通过考试，培根成为正式律师。1584年，他被选为国会议员。在此后的几届国会选举中，培根一直连选连任。培根在国会和法庭上的辩才是非常著名的。人们每次听到他的演讲，都深深为之打动，甚至担心演讲会很快结束。
这期间，培根已怀有改革人类知识的大志，他在给位居财政大臣的博莱的求职信中，第一次把这个志向透露出来了。他说：“最后，我承认，我在默想着一个巨大的目的，犹如我有一些平常的公民的目的一样，因为我已经把一切知识当做我研究的领域，如果我能从这个领域里把两种游民清除出去(一种人以轻浮的争辩、互相驳斥和废话，另一种人以盲目的试验、用耳闻的传说和欺骗的手段，造成了很多的损害)，我认为我就能带来一些勤勉的观察、有根据的结论和有益处的发明与发现；这样，就是那个领域中最好的情况。这个希望，不管是好奇心也好，虚荣心也好，天性也好，或者(如果人们善意视之)仁慈也好，都已经深刻印入我的心中而不能忘怀了。”
我们可以看到，此时的培根较剑桥时的培根更成熟了，从对亚里土多德的怀疑、不满，进而发展到决心要把脱离实际、脱离自然的一切知识加以改革，而把经验观察、事实依据、实践效果引入认识论。这是一个伟大抱负，是后来他提出来的科学的“伟大的复兴”的重要目标，是他为之奋斗一生的哲学志向。
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