1950年军委卫生部设防疫保健处。1952年总后卫生部设防疫卫生处，编有卫生宣传科，各大单位、军、师设防疫处（科）。大单位编制有专业机构——防疫队（在以后的历次整编中，防疫队的名称及隶属多有变化），其中设有卫生宣传科。1978年成立全军爱国卫生运动委员会（简称全军爱卫会）和全军保健领导小组，各单位也相继成立保健领导小组和保健办公室。20世纪80年代，各大单位卫生宣传科相继改名为健康教育科。
20世纪90年代中期，为推进健康教育工作的全面开展，全军逐步形成了健康教育网络体系。1997年8月，全军院校健康教育指导组正式成立，其业务工作受全军爱卫会和总后卫生部领导。1998年4月，全军健康教育中心在重庆第三军医大学正式挂牌成立（彩图32）。各军区、军兵种相继成立了健康教育指导中心，军、师、旅、团设立了健康教育指导站（室），各医院、疗养院设立健康教育室。全军卫生美术摄影中心、全军卫生书、报刊中心、全军卫生影视中心陆续成立。至1998年11月（福州会议时），全军大部分院校成立了健康教育教研室（组），开设了健康教育课程，并纳入了教学计划等。
20世纪90年代末，军事心理健康教育再次受到了全军的高度重视，正式成为军队教育与研究的一个重要内容。目前，全军院校已开设了军人心理学等课程，许多院校还成立了心理学教研室或教学研究中心。心理卫生工作成为近几年来发展最快的一项工作，全军兼职心理医生开始培训，团卫生队都建立了心理咨询室，配兼职心理医生，1999年有学者研究军人心理素质，2002年提出了军人心理素质的结构、维度，随后完成了军人心理素质量表的编制，初步建立起军人常模；2003年形成了认知、行为和情绪训练为核心的心理素质训练体系，编写出版了相应教材《军人心理素质训练》，并在部队开展了实验研究；2006年，编写了《战争心理战与防御》；2007年完成军队心理健康评估体系与软件系统的鉴定，并在全军推广；2008年，在北京召开的全军心理卫生技术指导组会议和在重庆召开的军事心理学会议上，完成了部队兼职心理医生培训教材的修订，形成了全军心理卫生指导专家的准入标准，全军心理卫生工作技术规范、非战争军事行动心理救援预案等。特别是在2008年“5．12”汶川大地震救援中，军人心理健康教育工作发挥了重要作用。
2000年5月，经批准，中国军事教育学会军事健康教育委员会正式成立。军事健康教育委员会的成立，标志着我军健康教育体系已趋于科学、完善，它将为发展全军健康教育事业，充分发挥全军健康教育人才、知识密集的优势和适应健康教育向高层次发展的趋势，加强全军健康教育网络的运作，使健康教育工作纳入科学化轨道，真正在保障全军官兵健康、提高部队战斗力方面发挥出应有的作用。
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