阿里巴巴上市前夕，马云给众多投资者发布了招股书，在招股书中，马云表示阿里巴巴不是一家拓展技术边界的科技公司， 而是一家通过持续推动技术进步，不断拓展商业边界的企业，靠众多参与者建立了一个生态系统。
马云称阿里巴巴不会成为商业帝国，而是打造开放、协同、繁荣的商业生态系统，帮助小微企业和消费者。这个复杂的生态系统注定不会呈现出简单的商业模式。同样因为系统复杂，也让竞争者不容易轻易模仿。
马云在招股书中写道：“与其他高科技公司有所不同，我们不是一家拓展技术边界的科技公司， 而是一家通过持续推动技术进步，不断拓展商业边界的企业。我们不是靠某几项技术创新，或者几个神奇创始人造就的公司，而是一个由成千上万相信未来，相信互联网能让商业社会更公平、更开放、更透明、更应该自由分享的参与者们，共同投入了大量的时间、精力和热情建立起来的一个生态系统——正如今天你们所看到的。”
“阿里巴巴的使命决定了公司不会成为一家商业帝国。我们坚信只有打造一个开放、协同、繁荣的商业生态系统，令生态系统的成员有能力充分参与其中，这样才能真正帮助到我们的客户，也就是小微企业和消费者。”
马云十分强调“生态系统”四个字，他在给投资者的公开信中，这四个字出现了二十多次，马云也多次阐明阿里巴巴并不是一个“商业帝国”，他表示任何的商业帝国都有倒台的时候，而商业系统有“春夏秋冬”，有自我更新、繁殖、演化的能力，里面的个体生命会形成生态链，从而生生不息。
如今马云想打造的生态系统范围不只是电子商务这一块，而是互联网延伸至你我生活的角落，有人甚至开玩笑说阿里巴巴简直是一个“超级怪物”，它雄踞中国互联网B2B（企业到企业）、B2C（企业到消费者）、C2C（消费者到消费者）、网络支付、网络贷款、云计算和大数据（阿里云）、物流（菜鸟）、搜索（UC）、地图（高德）、娱乐、医疗健康、文化等行业，甚至连炙手可热的恒大足球也被阿里巴巴收购了50%的股份。
数据显示，仅在过去两年里，阿里巴巴并购就花去了超过100亿美元。“老业务+新收购”构成了一个庞大的生态系统，当然这个庞大的生态系统还在不断完善中，或许将来有一天再次提到阿里巴巴的时候，中国人乃至外国人首先想到的不是淘宝、天猫，而是生活里的随便一处服务。
生态系统活得久，强调的是“活力”“生机”，业务之间有很强的关联性，就像一片森林，里面有狼、有鹿、有草、有树、有昆虫、有阳光雨露等，缺一不可，一旦全部建立起来，就能够生机勃勃地延续千万年。
而商业帝国是20世纪的概念，简单来说就是什么赚钱发展什么，由此带来的是可能投资了一项赚钱业务而业绩猛增，也可能是投资失败，拖累其他产业。这样的例子在20世纪乃至现在比比皆是，比如三星汽车可能很多人都没听说过，该项目耗费三星巨资却十分不成功，最终只好将其卖给了雷诺，成为一项鸡肋项目。
2011年，阿里巴巴把“大淘宝”计划升级为“大阿里”战略，一拆三为淘宝、天猫、一淘，融合支付宝、阿里云、菜鸟网络，打通零售和批发业务，提出电子商务新模式CBBS，马云称：“大阿里将和所有电子商务的参与者充分分享阿里集团的所有资源——包括我们所服务的消费者群体、商户、制造产业链，整合信息流、物流、支付、无线以及提供数据分享为中心的云计算服务等。”
如今阿里巴巴的生态系统开始延伸至海外，正在积极建设国际物流体系、国际信用支付体系等。
马云表示，“商业帝国”是控制型的，而“生态系统”则是发展型的，两者差距立显。建设生态系统的时候，很多投资可能不赚钱甚至赔钱，但是仍有必要投资，打造生态系统的思维不是“赚钱”思维。
阿里巴巴的生态系统格外强调人与人的互动，客户是该生态系统里最重要的部分，所有服务都在围绕着“人”这一点展开。阿里巴巴的聪明之处也在于此，在庞大的资金背景下没有盲目扩张业务，而是按照一个健康生态的方式一步步发展，如同生物进化有目的一样，人为什么有五根手指，为什么几乎所有哺乳动物都是两个眼睛两个耳朵一张嘴，这跟阿里巴巴为什么投资微博、入股恒大足球其实有异曲同工之妙，即良好的进化规律。
马云说：“如果你true believe电商、真的相信互联网，那么你应该尽快在生态系统中谋求自己的一席之地。”当然，目前在做生态系统的企业不只有阿里巴巴一家，谷歌、微软、Facebook、亚马逊、百度、腾讯等都在积极部署自己的生态系统，好像一片大陆上有着许许多多的小森林，哪片森林发展壮大，哪片森林又衰落下去，还需要时间的验证。
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