1．抗凝治疗 DVT和PE的疾病过程表现相似，大多数近端DVT患者伴有PE（有症状或无症状性），反之亦然。临床试验也验证了单发DVT患者、DVT伴发PE患者及仅有PE患者的治疗相似。PE初始治疗可采取静脉注射UFH或LMWH，对于客观证据证实的非大块PE患者，推荐短期使用皮下注射LMWH或静脉注射UFH治疗至少5d（证据级别：1A），且LMWH优于UFH，但严重肾功能衰竭患者，静脉注射UFH优于LMWH（证据级别：1A）。临床高度怀疑的PE患者，在等待诊断性检查结果的同时给予抗凝治疗（证据级别：1C＋）。在治疗第一天，VKA联合LMWH或UFH治疗，当INR＞2．0并且稳定，可中断肝素治疗（证据级别：1A）。近年来，也出现了几种新抗凝药物，如比较合成戊糖fondaparinux（皮下注射，每天一次）与静脉注射UFH治疗PE的研究发现，二者疗效和安全性相当。但这种新的化合物尚未注册，因此不作推荐。
2．全身和局部溶栓治疗 与抗凝治疗比较，溶栓治疗更加迅速改善影像学异常和血流动力学异常，但这些获益是短暂的。溶栓和抗凝治疗患者之间的临床预后如死亡率或症状缓解并没有差异。对于大多数PE患者，建议临床医生不使用全身溶栓治疗（证据级别：1A）。应用溶栓药物治疗PE仍应个体化，临床医生可以自由地选择药物。通常血流动力学不稳定的PE且出血危险性低的患者为最佳指征。对于有选择的患者，如血流动力学不稳定的患者，可以全身溶栓治疗。由于抗凝疗效好，溶栓治疗通常用于急性大面积PE、血流动力学不稳定、无出血倾向的患者。溶栓治疗是否降低大面积PE远期致残率，还需要积累可靠的证据。另一个尚未解决的问题是对于超声证实存在右室功能不全且血流动力学稳定患者能否使用溶栓治疗。针对这些患者，需要进一步研究证实与传统抗凝治疗比较，溶栓治疗是否改善获益风险比。
药物通过血管到达溶栓目标，90%以上静脉溶栓的患者激活全身纤溶系统。虽然t－PA及其变体比链激酶和尿激酶对纤维蛋白的特异性更高，但所有这些药物都能溶解血管内任何部位的新鲜血小板－纤维蛋白栓子，引起该部位出血。所以，尽量不要应用肺血管导向溶栓，穿刺部位出血危险明显增加。对于接受溶栓药物的PE患者，建议使用短期静脉滴注溶栓优于长时间静脉滴注，PE溶栓推荐链激酶首先予负荷量25万U，随后10万U／h静脉滴注24h；尿激酶负荷量为4 400U／kg，继以2 200U／kg静脉滴注12h；t－PA100mg静脉滴注2h。目前美国尚未批准瑞替普酶（reteplase）治疗VTE，但是该药显示了迅速溶解血栓的前景，用法是间断30min分两次静脉推注10U。肝素不能与链激酶或尿激酶同时静脉滴注。应用t－PA或瑞替普酶（reteplase）溶栓时应同时使用肝素。
3．非药物治疗 对于大多数PE患者，不推荐使用机械方法如导管抽吸或粉碎术治疗PE（证据级别：1C）。对于某些不能接受溶栓治疗病情严重的患者，或病情严重没有充分时间进行静脉溶栓治疗的患者，建议采用上述机械方法（证据级别：2C）。当保守治疗失败时，紧急情况下可采用肺动脉血栓切除术，但对于大多数PE患者不推荐。其适应证为：①大块PE（可能时记录血管造影结果）；②经过肝素和复苏等措施，血流动力学仍不稳定（休克）；③溶栓失败或溶栓禁忌。在可行紧急心肺旁路术时代，非对照回顾性病例研究的手术死亡率为10%～75%。心肺骤停患者死亡率在50%～94%。一项96例患者的系列研究中（55%未达到血流动力学不稳定的标准），单因素分析显示心脏骤停和休克是死亡预测因子，多因素分析证实心脏骤停和基础心肺疾病是死亡的预测因素。手术后并发症包括成人呼吸窘迫综合征（ARDS），纵隔炎，急性肾功能衰竭，特别要注意严重神经后遗症。当患者符合上述标准并具备经验丰富的心脏外科团队时，可考虑肺动脉血栓切除术。
关于腔静脉滤器应用的报道均为非随机研究。在一项400例症状性DVT患者的随机试验中（全部接受肝素或LMWH），接受滤器组较非置入滤器组12d时PE发生率低，然而1年时再发DVT比例较高。滤器未能延长首发VTE患者早期或晚期生存率。滤器的获益被DVT复发增多所抵消。同样下腔静脉滤器不适用于多数PE患者，主要适用于PE复发高危且存在抗凝禁忌证或并发症，以及尽管充分抗凝治疗血栓复发的患者。植入滤器的禁忌证是：静脉解剖异常、妊娠、欲置入部位近端出现栓子。临时性滤器可能是未来的发展方向，但还在试验阶段。
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