多年来，黄方不分寒暑和假日一直在忘我地钻研蛋白质方面的科研难题。为了得到更精确的结果，黄方经常熬夜通宵查阅文献做实验。蛋白质的研究实验是一步一步进行的，每一步实验需要的时间也不一样，常常会为了完成一个实验而在实验室呆一整天，忘了吃饭的时间。就这样，黄方在瑞士巴塞尔学习期间，利用时间分辨荧光技术首次建立了测定多肽链内部氨基酸之间碰撞速率的方法，探讨了多肽动力学和蛋白质折叠机理，并取得了一系列重要研究成果，这些成果在化学类最高级别的学术刊物JACS和Angewandte Chemie等期刊上发表，获得国际同行的广泛认可。2004年至今，黄方利用单分子荧光技术研究蛋白质的折叠机理、结构与功能，在单分子荧光技术的发展以及蛋白质与疾病关系研究中均取得了重要突破，现已有多篇文章发表在美国科学院院刊PNAS上，至今共发表SCI论文50多篇。
黄方（左）在研究中
回国后，黄方继续从事蛋白质折叠、结构与功能的研究，以及蛋白质的工程改造。他利用单分子荧光技术研究蛋白质折叠的基本过程，解答了某些蛋白质折叠领域长期存在的机理问题。同时利用该技术对关键的癌症抑制因子p53蛋白的结构与功能进行了研究，揭示了p53蛋白在生理条件下的多重构象，并阐明了该蛋白实现功能过程的机理。2009年回国后，获得4项国家自然科学基金的资助，同时参与了国家自然科学基金重点项目以及“973计划”项目各1项。2010年，获得山东省自然科学“杰出青年基金”。2011年，入选教育部“新世纪优秀人才支持计划”，并获聘泰山学者海外特聘专家。
程开甲院士说：“搞科研，不能急于求成，不能光想着出名，要重视平凡而艰巨的基础工作，要有奉献精神。只有这样，才能求是、创新，才能超过别人。”走科研之路并非易事，但黄方十年如一日，无数个夜晚在实验室中的灯光下度过，一遍遍重复着枯燥的实验，并翻阅大量文献，在探索生命奥秘之路上执著前行。“科研是凭兴趣的，如果对自己的研究没有兴趣，那么想要做好科研是很难的。”他说。正是因为一份“十分”的热爱和耐心让他在科研路上走得更远、更稳。
创新，始终与黄方的研究离不开。谈到创新，黄方认为，要把探索自然作为科研的原动力，从揭示自然奥秘的角度开展科研。这就是一个创新的过程，你永远都能发现一些新的东西。
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