科研组织管理体系由科研管理体系和科研管理制度组成，对保障课题的顺利实施，起到监督、协调、保障的作用。管理制度是由管理部门制定，具有制约性与可塑性。科研组织管理体系包括主管部门、监督部门、承担单位与课题组。
1．主管部门 负责获资助课题科研合同书的签订；定期检查监督课题的执行情况，有权对不按合同执行的课题终止资助，负责课题的结题验收。
2．监督部门 主要监督课题主管部门与承担单位的职能执行情况，如课题主持是否公正、经费是否及时到位和有无挪用等。
3．承担单位 按主管部门的要求监督本单位课题的执行情况，并将检查情况及时上报；负有本单位课题经费的使用监督责任，按年度完成经费决算报告；配合主管部门进行结题验收工作。
4．课题组 主要工作是认真完成合同中规定的研究内容，按规定时间上报年度进展报告、结题报告与经费使用情况。课题组的具体工作一般实行课题负责人制，课题负责人要求具备渊博的专业知识、敏捷的科研思维、较强的动手能力与一定的管理才能。在课题的实施过程中，课题负责人具有以下职能。
（1）负责课题设计，制定实施计划。根据课题内容要求，建立结构合理的课题组。
（2）接到项目批准通知后，需根据通知有关规定，签署责任书或计划任务合同书，按通知中的修改意见对原研究方案进行修改。
（3）掌握课题进度，跟踪前沿进展，调整课题内容。在研究计划实施过程中，课题负责人应紧密追踪本领域国内外研究动态，及时对项目进行必要调整以保持研究项目的先进。如对预期目标、研究内容做重大变更或调整时，必须首先向本单位科研管理部门提交对某些研究内容进行变更的申请，充分阐明变更的理由。各单位对申请材料应严格审查，提出具体处理意见后呈报上级主管部门审批。
（4）负责课题经费的使用管理。课题的经费开支包括科研业务费、实验材料费、仪器设备费、科研协作费、实验室建设费等。具体经费如何分配使用，由课题负责人统筹安排，但应受到有关管理部门及财务部门监督。
（5）在项目的具体实施过程中，项目负责人既要做设计师，又要做操作者，至少要亲自完成研究项目的部分关键实验，不得完全脱离具体实验过程。
（6）按照管理部门的要求，完成课题的进展报告、结题报告与经费决算。
（7）课题负责人因中途出国或身体等原因无法继续完成研究任务的，需及时上报，并按有关程序和规定及时调整课题负责人。新更换的课题负责人原则上应是原课题组成员，并具备中级以上专业技术职务。
总之，在研课题的管理需要上级主管部门、下级科研单位及课题负责人各负其责，协同配合，按照有关规定，共同做好课题的管理工作。各项目承担单位应加强对本单位课题管理，严格执行各项管理规定，以保证研究队伍的稳定、实验条件的落实、计划研究方案的实施。项目负责人全面负责课题的计划的实施。
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