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图像输入前的准备

时间:2023-03-16 理论教育 版权反馈
【摘要】:Mimics软件支持DICOM 3.0标准的图像,同时也支持较早的ACR-NEMA格式。同时Mimics软件支持BMP和TIFF格式的灰度图像。注意的是,DICOM格式的影像数据,文件头中一般已经包含了这些参数,Mimics软件可以自动识别,不需要手工输入。如果图像以其他方式命名,则需要编制一份图像名称与序数词对应表,以便Mimics输入,同时也可以手工调整图像的位置,虽然Mimics软件提供了这两种备选的方法,但笔者不推荐这样做。

Mimics软件支持DICOM 3.0标准的图像,同时也支持较早的ACR-NEMA格式(1.0and 2.0)。同时Mimics软件支持BMP和TIFF格式的灰度图像。Mimics软件不支持彩色图像和JPEG格式的图像。

不管是准备输入DICOM格式连续断层扫描数据还是输入连续人体或组织切片断层图像数据,都需要事先对所要输入的数据有充分的了解,对所要研究的项目有详细的设计。图像输入之前,必须准备或确认以下图像信息:

·患者名称(patient name),可以是患者的名字,也可以是研究项目名称,要方便分类管理。

·研究机构(institute),可以选择填或不填。

·层距(slice distance)、像素尺寸(pixel size)和扫描架倾斜度(gantry tilt)(图2-7),连续断层图像集合为一个体数据集,要求连续断层图像的大小一致,同时需要知道图像的像素与物体实际尺寸的比例(pixel size,如同地图的比例尺),层距(slice distance)以及扫描架倾斜度(gantry tilt)3个必需的参数。

图2-7 扫描架倾斜度(gantry tilt)

注意的是,DICOM格式的影像数据,文件头中一般已经包含了这些参数,Mimics软件可以自动识别,不需要手工输入。如果需要对连续人体标本切片或组织切片进行三维重建,则在开始阶段要详细地设计,在切片上要加入标尺和定位杆,以保证连续断层图像层与层之间能够配准裁剪成大小一致,同时获得准确的像素尺寸、层距及切削角度等关键参数。

·连续断层图像的排序(sort),建议以序数词(num.)或字母顺序(alpha.)为连续断层图像命名,以方便输入。如果图像以其他方式命名,则需要编制一份图像名称与序数词对应表,以便Mimics输入(import table positions from),同时也可以手工调整图像的位置,虽然Mimics软件提供了这两种备选的方法,但笔者不推荐这样做。

·第一张图像的位置(first table position)和方位(orientation),如果要对一个大的数据集分步重建,比如对中国数字人人体切片进行解剖重建,那么不可能一次输入所有的断层图像,可能会选择分步重建不同的解剖结构,比如股骨与胫骨。为了使两次重建的股骨与胫骨三维模型保持准确的三维坐标,需要注意以下两个参数。

第一张图像的位置(first table position),比如,如果定义股骨自上向下第一张位置为0,胫骨数据第一张的物理位置距股骨第一张为50cm的话,那么分别重建股骨和胫骨时,first table position的参数股骨为0,胫骨为50cm。

方位(orientation),在分步重建时,来自于一个大的数据集的子数据集,定义解剖姿势(前后、左右、上下)必须一致,否则所建的不同模型输入同一坐标系中位置会发生混乱。

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