牙科水门汀的机械强度普遍不佳，除了个别经过树脂成分加强的以外，远逊于复合树脂材料。从材料化学成分和结构来分析，各种水门汀材料的强度也有较大差别，除了经过特殊处理的产品以外，一般来说以玻璃离子和磷酸盐水门汀最高，其次是正乙氧基苯甲酸水门汀或聚羧酸锌水门汀，再次顺序为EBA水门汀、氧化锌水门汀，氢氧化钙水门汀的强度最为低下。
水门汀的强度还与调混条件有关。一般来说，粉液比越高、混合物越黏稠、调拌越用力，最终获得的强度也就越高。但是以丙烯酸类最为液体部的材料具有一定的粉液比上限，一旦超过就会导致与被粘表面的粘结效果急剧下降。
水门汀的调拌实际上是化学反应主导的过程，因此受反应环境温度的影响十分明显。在受热的状态下固化时间可能大幅度缩短。除了环境温度以外还必须注意化学反应放热的因素。
牙科水门汀性能上的差异导致了适用范围的差别。
1．暂时充填 选择水门汀材料的根据是治疗目的和希望维持时间的长短。首选氧化锌丁香油水门汀，同时希望材料可在原位维持较长时可用EBA水门汀。但无论如何，氧化锌丁香油类水门汀的使用时间不宜超过1个月。半永久性充填的首选材料是玻璃离子，首要原因是它可封闭窝洞边缘，其次是机械强度可以满足要求。
如果出于促使窝洞脱矿牙本质重新矿化的目的，可选用氢氧化钙加玻璃离子水门汀。
不推荐磷酸锌水门汀和聚羧酸锌水门汀的原因主要是酸的刺激以及较高的溶解性，边缘封闭作用也远不及玻璃离子水门汀材料。
2．间接修复体粘固 磷酸锌水门汀、玻璃离子水门汀和聚羧酸水门汀都适用于粘结修复体，正乙氧基苯甲酸水门汀因其溶解性强而禁用于粘结。粘结时需将水门汀分别涂在冠内（或嵌体上）和牙齿表面。
传统的选择方式是磷酸锌水门汀适用于死髓牙，聚羧酸水门汀适用于活髓牙，玻璃离子水门汀同时适用于两种。不过随着材料本身性能的不断提高和临床研究的不断深入，以上选择方式也在逐渐发生变化。特别是树脂水门汀材料的出现极大改善了原有的修复体边缘水门汀溶解问题，固位力也从机械嵌合摩擦力为主向机械力、化学粘结力并重发展。
瓷嵌体、瓷贴面等薄弱的全瓷间接修复体的粘结十分特殊，传统的水门汀粘固剂并不适用，必须使用特殊树脂水门汀，并常需与牙本质粘结系统联合使用。
3．洞衬 选择的根据是窝洞的深度和修复洞形所用的充填材料。
（1）汞合金充填
中等深度洞型：用树脂改良型玻璃离子水门汀，例如3MESPE的vitrebond。
深洞型：用氢氧化钙洞衬（直接或间接盖髓）水门汀置于下层，用任何一种水门汀盖于其上方。推荐使用玻璃离子水门汀，尤其是树脂改良型玻璃离子水门汀以保证良好的洞衬封闭性。禁止将银汞材料直接放置到氢氧化钙洞衬水门汀表面，因为充填时的压力会破坏氢氧化钙水门汀结构。
（2）复合树脂充填：牙本质粘结系统可以用于直接或间接盖髓，所以一般来说无需洞衬。如果需要则推荐使用树脂改良型玻璃离子水门汀，如vitrebond，因为它可以即刻光固化，并可耐受酸蚀。禁用氧化锌丁香油水门汀，因为其妨碍复合树脂的聚合。不推荐使用氢氧化钙洞衬水门汀是因为其易受酸性环境影响。
4．盖髓 可硬固化氢氧化钙是惟一选择。
5．安抚材料 可以选用氧化锌丁香油类或氢氧化钙类水门汀。
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