1．乙型肝炎病毒
（1）HBsAg与抗HBs：HBsAg阳性是HBV感染的标志之一，不能反映病毒复制、传染性及预后。抗HBs是一种保护性抗体，有清除HBV、防止再感染的作用。接种乙肝疫苗者需长期保持滴度≥10U／L；HBV相关肝移植术后抗－HBs滴度要达到以下目标：术后6个月内≥500U／L，术后6个月至1年≥200U／L，术后1年以上≥100U／L（长期保持）。
（2）HBcAg与抗HBc：HBcAg主要存在于受感染的肝细胞核内。抗HBc阳性是HBV感染的标志，出现早、滴度高、持续时间长，甚至终身携带。抗－HBc IgM是HBV感染机体后早期出现的抗体，是急性HBV感染的重要血清学标志。抗－HBc IgM阳性表示病毒复制和具有传染性HCV急性感染，抗－HBc IgM阴性预示急性乙型肝炎逐渐恢复。
（3）HBeAg与抗HBe：HBeAg是HBV复制和具有传染性的重要标志，也是HBV急性感染的早期标志。抗HBe是HBeAg的特异性抗体，是HBV感染的标志，阳性见于慢性感染或感染后恢复期。以上6种血清学指标现国内多采用ELISA法检测。
（4）HBV DNA：位于HBV核心部位，与HBeAg几乎同时出现于血清中，是HBV感染最直接、特异和灵敏的指标。应用PCR法检测，如果阳性直接表示HBV的核酸存在，病毒在复制，并具有传染性。此外，服用拉米夫定半年以上者应每3个月进行1次病毒变异的检测，采用错配聚合酶链反应－限制性片段长度多态性分析法（mPCR－RLFP）检测YMDD的基因变异。必要时，可行肝脏穿刺病理学以及免疫组化的检查。
HBV相关肝移植术后有下列任何一项阳性，但肝功能未发现异常者，即可诊断肝移植术后HBV再感染：①血清HBsAg和（或）HBeAg阳性；②血清HBV DNA阳性；③肝组织HBsAg和（或）HBcAg阳性；④肝组织HBV DNA阳性。
乙型肝炎复发必须符合以下标准才可诊断：①有以上HBV再感染的证据；②肝功能异常，并排除其他原因；③有病毒性肝炎症状和体征；④肝活检组织病理符合病毒性肝炎改变。
耐拉米夫定病毒株，如在下述3项中符合任何1项均可诊断：①测到YMDD突变株；②拉米夫定治疗1年始终未能达到HBV DNA转阴或定量法降低小于2个常用对数级；③服用拉米夫定过程中已使HBV DNA转阴、肝功能复常2次以上，但在继续服药6个月后，患者再次出现HBV DNA阳性且伴肝功能异常，且排除其他肝病者。
肾移植等其他器官移植术后，HBV感染的诊断也主要依靠血清学和病毒标记物的检测，肝脏穿刺也是有效的诊断方法。慢性HBV感染的肾移植患者（移植时HBsAg阳性）通常在移植后数月内外周血中出现HBV DNA（＋），提示病毒活动性复制，ALT及AST升高和组织学检查也提示慢性肝炎的存在。
2．丙型肝炎病毒 移植术后HCV感染的诊断主要依赖于实验室化验检查。常进行以下项目的检测。
（1）抗－HCV：现世界上广泛应用第三代HCV诊断试剂，使用ELISA法检测。抗－HCV是HCV感染机体后出现的特异性抗体，不是中和抗体，它是HCV感染的标志。其中抗－HCV IgG阳性表示体内已有HCV感染，而抗－HCV IgM阳性表示HCV急性感染。
（2）HCV－RNA：应用PCR法检测血清中的HCV RNA可直接对HCV感染进行病原学检测。HCV RNA阳性表示HCV复制活跃、传染性强，HCV RNA转阴提示预后较好。连续监测HCV RNA，结合抗－HCV的动态变化，可作为HCV的预后判断和药物疗效的评价指标。
（3）HCV基因型：多采用PCR依赖的基因分型方法进行全序列的测定，但此法只能在研究工作时使用，未应用于临床检验。
（4）肝功能的检测：肝功能试验包括血清转氨酶、胆红素、白蛋白／球蛋白比例、凝血酶原时间及活动度等。
（5）肝脏穿刺行组织病理学检查：此法还可通过免疫组化检测肝组织中HCV抗原。其中，HCV RNA的检测是目前公认的诊断HCV感染是否存在的金标准。
由于免疫抑制药物的应用，抗－HCV可出现假阴性，故抗－HCV阴性不能完全排除HCV的感染。即使是HCV RNA的检测，也可能发现不了某些间歇性、隐匿性的HCV感染。此外，HCV病毒复制和肝组织学状态之间没有明显的相关性，血清HCV RNA的水平不能很好地显示肝脏组织学状态。目前，肝组织活检仍是判断是否存在肝脏病理改变及其严重程度的重要方法。
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