准种概念的提出,始于RNA病毒的研究过程中,并发现病毒准种有多种生物学意义。多数学者认为,由于RNA病毒特有的RNA聚合酶不具备校对功能,因而易造成病毒变异;免疫压力在准种形成过程中也起重要作用。由于发生致死性突变的病毒株被清除,存活的变异株与野生株之间存在基因序列微小差别,种群的各成员之间,其差别程度一般不会超过核苷酸总长度的2%~5%,差别程度尚不至于构成亚型分类,故命名为准种(quasispecies)。
董菁等以HBV基因序列为依据,以S区为研究靶区域,应用PCR扩增CHB患者血清中的S基因,经限制片段长度多态性法展示了S区的变异程度,选择克隆进行测序,比较其结果,证明了HBV准种的存在,并发现多种基因的突变形式。他们认为HBV在其长期携带者体内存在一定数量的准种形式,可分为优势克隆和非优势克隆,应有针对性地加强宿主体内HBV优势准种变化、消长规律的研究。
刘映霞等通过对CHB不同病型患者S区准种复杂性差异的分析,探讨了S区准种与疾病活动性的关系。研究结果表明,慢性HBV感染者不同疾病期单链构像多态性条带数不同,准种复杂性依次为:重型肝炎>慢性轻度、中度肝炎>病毒携带者。准种复杂性与疾病活动性的关系也体现在随访的患者中,2例重型肝炎准种数目随ALT升降而增减。研究结果提示,重型肝炎时显著增高的ALT水平是宿主强烈抗病毒免疫反应以清除肝细胞内病毒的结果。强烈宿主免疫压力可能与准种复杂性形成有关。另一方面,S基因存在细胞毒性T细胞(CTL)的表位,增加的变异病毒准种可能激活CTL反应,使病情加重。研究也发现,与HBeAg阳性组比较,HBeAg(-)组准种复杂性明显增加;前C区/C基因准种变异可使血清中检测不到HBeAg,此区存在多个CTL表位,准种变异可增加疾病活动性。推测与病情加重有关的病毒准种复杂性也可能同时存在于S区,前C/C区等多个基因处。
HBV准种特点也为HBV感染的诊断及免疫预防提出了挑战。由于准种的形成及优势种群的漂变(shift),造成HBV感染检测漏诊,供血员筛选也将受到影响。HBVac免疫预防造成准种及种群的改变,也同时造成部分人群免疫失败。因此,为了充分了解HBV分子生物学的特点,更加有效地诊断、治疗、预防HBV感染,必须重视对HBV准种特点的研究。
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