（一）说明五脏的生理功能与相互关系
1.说明五脏的生理功能 五行学说将五脏分别归属于五行，以五行的特性来说明五脏的生理功能特点。如肝喜条达而恶抑郁，有疏泄的功能，木性可曲可直，枝叶条达，有生发的特性，故以肝属木，是以木条达生发的特性来说明肝主疏泄而恶抑郁的生理功能；心阳有温煦的作用，火性温热上炎，故以心属火，是以火的特性来说明心阳主温煦的生理功能；脾有运化水谷精微，营养五脏六腑、四肢百骸的功能，为气血生化之源，土有生化万物的特性，故以脾属土，是以土的特性来说明脾的化生气血，为后天之本的功能；肺性清肃，肺气以肃降为顺，金有清肃、收敛的特性，故以肺属金，是以金的特性来说明肺气清肃下降的生理功能；肾主藏精、主水，有滋润周身的作用，水有滋润下行的特性，故以肾属水，是以水的特性来说明肾藏精、主水的生理功能。
2.说明五脏之间的相互联系 五脏的功能活动不是孤立的，而是相互联系着的，既相互资生，又相互制约，这种相互联系就是利用五行学说的生克理论来说明的。
（1）五脏相互资生的关系：用五行相生的关系说明五脏之间相互资生、相互为用的关系。如木生火是指肝可以资生心，即肝藏血以济心，又叫肝生心；火生土是指心火可以温养脾土，又叫心生脾；土生金是指脾吸收、输布水谷精微，营养肺，又叫脾生肺；金生水是指肺气清肃下行，通调水道，使水液下归于肾，以助肾水，又叫肺生肾；水生木是指肾藏精以滋养肝脏阴血，又叫肾生肝。
（2）五脏相互制约的关系：用五行相克的关系说明五脏之间相互制约、相互克制的关系。如木克土就是指肝的疏泄功能可以抑制脾土的壅滞；土克水就是指脾运化水湿的功能可以抑制肾水的泛滥；水克火就是指肾水上济于心可以抑制心火的过亢；火克金就是指心阳的温煦功能可以抑制肺的清肃太过；金克木就是指肺气的肃降功能可以抑制肝气的升发太过。
（二）说明五脏病变的相互影响
五脏在生理上相互联系，在病理上相互影响。一脏有病，可以传至他脏，这种病理上的相互影响称为“传变”。用五行学说来说明五脏疾病的传变，可以分为相生关系的传变和相克关系的传变。
1.相生关系的传变 在相生关系中，每一行都存在着“生我”和“我生”两种联系，有“母”和“子”的双重属性。因此，相生关系的传变又包括“母病及子”和“子病犯母”两个方面。
（1）母病及子：是指疾病从母脏传于子脏。
（2）子病犯母：是指疾病由子脏传于母脏，又称“子盗母气”。
2.相克关系的传变 在相克关系中，每一行都存在着“克我”和“我克”两种联系，因此相克关系的传变又包括“相乘”和“相侮”两个方面。
（1）相乘：是指相克太过而为病。相克太过有两种情况：一种是由于一方的力量过强，导致被克的一方受到过分的克伐；另一种是由于被克的一方本身虚弱，不能任受对方的克伐。
（2）相侮：是指逆向克制而致病。相侮亦有两种情况：一种是由于一方过于强盛，不仅不受克己一方的克制，而且对其反克；另一种是由于一方的过于虚弱，不仅不能对被克一方进行克制，反而受到对方的反克。
（三）用于疾病的诊断
人体是一个有机的整体，内脏有病可以反映到相应的体表组织，出现色泽、声音、气味、形态、脉象等方面的异常变化。由于五脏与五色、五音、五味等都是以五行进行了分类归属，因此，在诊断疾病时，就可以用望、闻、问、切四诊所得来的资料，用五行的归类和生克乘侮规律来推断疾病的发生和演变。如面见青色、喜食酸味、脉见弦象，多为肝病；面见赤色、口苦、心烦、脉洪，多为心火亢盛等。
（四）用于疾病的治疗
1.控制疾病的传变 疾病的发生是人体脏腑组织功能失调的结果，脏腑组织功能失调必然导致内脏生克关系的失常。因此在治疗时，除对本脏的病变进行治疗以外，还应考虑到其他有关脏腑的传变关系，根据五行的生克乘侮规律来调整其太过与不及，控制其传变，防止其病传入他脏。例如：肝气亢盛，可致木旺乘土，传病于脾，故在泻肝时要补脾，以防止其传变。
2.确定治则和治法 五行学说用以确定治疗原则和治疗方法，有根据相生和相克关系的不同。
（1）根据相生规律确定治疗原则：临床上运用相生规律来治疗疾病，其基本治疗原则是补母和泻子，即“虚则补其母，实则泻其子”。补母用于母子关系的虚证，常用治法有滋水涵木、培土生金、金水相生、益火补土。泻子用于母子关系的实证，如肝旺泻心，心火泻胃等。
（2）根据相克规律确定治疗原则：临床上无论出现何种相克规律异常的病理变化，总的来说，无非是强弱两个方面，即克者属强，被克者属弱。因此，其基本治则为“抑强”和“扶弱”。常用的治法有抑木扶土、培土制水、佐金平木、泻南补北等。
3.用于情志疾病的治疗 情志生于五脏，分属于五行，故情志之间也存在着相生相克的关系。因此在临床上可利用情志之间互相抑制的关系来治疗某些情志疾病。如怒伤肝，悲胜怒（金克木）；思伤脾，怒胜思（木克土）等。
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