终末消毒是指传染源离开疫源地后进行的彻底消毒。例如当B55型腺病毒感染病人出院、转院后，应当对其住过的病室和使用的污染品进行消毒，此时的消毒就是终末消毒。而B55型腺病毒发热病区也应当严格遵守终末消毒的流程。
10．5．1 终末消毒程序
在出发前，应检查所需消毒用具、消毒剂和防护用品，做好消毒前准备工作；消毒人员到达疫点，首先查对门牌号和病人姓名，并向有关人员说明来意，做好防疫知识宣传，禁止无关人员进入消毒区域内；将脱掉的外衣放在自带的布袋中（不要放在污染或可能受到污染的地方），然后按照步骤穿戴防护服；仔细了解病人患病前和患病期间居住的房间、活动过的场所及用过的物品，病人的吐泻物、污染物倾倒或存放地点，以及污水排放处等，据此确定消毒范围和消毒对象，然后根据消毒对象及其污染情况，选择适宜的消毒方法；消毒人员在进入疫点时，应先用喷雾消毒的方法在地面消毒出一条1．5m左右宽的通道，供消毒前的采样和其他处理用；消毒前应关闭门窗，然后对室内空气和物体表面进行消毒；室内消毒后，还应该对病患可能污染的厕所、垃圾、下水道口和自来水等进行消毒；疫点消毒工作完毕后，应对消毒人员穿着的工作服、胶靴等进行喷洒消毒后脱下，将衣物污染面向内卷在一起，放在布袋中带回消毒；所用消毒工具表面用消毒剂进行擦洗消毒；填写疫点终末消毒工作记录。
10．5．2 病区各种污染对象终末消毒方法
10．5．2．1 地面、墙壁、门窗
若只进行物体表面消毒时，应按照先上后下，先左后右的方法，依次进行喷雾消毒。喷雾消毒可用有效氯为1000～2000mg／L的含氯消毒剂溶液。泥土墙吸液量为150～300ml／m2，水泥墙、木板墙、石灰墙为100ml／m2。对上述各种墙壁的喷洒消毒剂溶液不宜超过其吸液量。地面消毒先由外向内喷雾1次，喷药量为200～300ml／m2，待室内消毒完毕后，再由内向外重复喷雾1次。以上消毒处理，作用时间应不少于60分钟。
10．5．2．2 空气
人员离开，房屋经密闭后，用0．05%二氧化氯溶液20ml／m3进行气溶胶喷雾消毒，作用1小时后即可开门窗通风。
10．5．2．3 衣服、被褥、书报、纸张
耐热、耐湿的纺织品可煮沸消毒30分钟，或用流通蒸汽消毒30分钟，或用有效氯为250～500mg／L的含氯消毒剂浸泡30分钟；书报、纸张可采用过氧乙酸或环氧乙烷气体熏蒸；对污染重、经济价值不大的物品和废弃物，在征得病人同意后焚烧。
10．5．2．4 病人排泄物和呕吐物、分泌物
对病人的排泄物、呕吐物、分泌物要及时消毒处理。每病床须设置加盖容器，装入1500～2500mg／L有效氯溶液，用作排泄物、呕吐物、分泌物的随时消毒。将排泄物、呕吐物、分泌物直接放入消毒液中，作用时间为30～60分钟。消毒后可直接倒入病房卫生间。
10．5．2．5 餐（饮）具
首选煮沸消毒15～30分钟，或流通蒸汽消毒30分钟。也可用有效氯为250～500mg／L含氯消毒剂溶液浸泡30分钟后，再用清水洗净。
10．5．2．6 食物
病人的剩余饭菜不可再食用，煮沸30分钟，或用20%漂白粉乳剂、有效氯为50 000mg／L的含氯消毒剂溶液浸泡消毒2小时后处理。也可焚烧处理。
10．5．2．7 家用物品、家具
可用有效氯为1000～2000mg／L的含氯消毒剂进行浸泡、喷洒或擦洗消毒。
10．5．2．8 手与皮肤
用0．5%碘伏溶液（含有效碘5000mg／L）或0．5%氯己定醇溶液涂擦，作用1～3分钟。也可用75%乙醇浸泡1～3分钟。
10．5．2．9 运输工具
车、船内空间，可用有效氯为1000～2000mg／L的含氯消毒剂溶液喷洒至表面湿润，作用60分钟，消毒后再用清水擦洗表面以去除余氯。密封空间，用0．05%二氧化氯溶液20ml／m3进行气溶胶喷雾消毒，作用60分钟。
10．5．2．10 垃圾
可燃物垃圾应尽量焚烧，也可喷洒10 000mg／L有效氯含氯消毒剂溶液，作用60分钟以上。消毒后最好进行深埋。
10．5．2．11 疫点内的生活污水
应尽量集中在缸、桶中进行消毒。每10L污水加入有效氯为10 000mg／L的含氯消毒溶液10ml，或加漂白粉4g。混匀后作用1．5～2小时，余氯为4～6mg／L时即可排放。
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