家族性BRCA1相关性乳腺癌（familial BRCA1-related breast carcinoma）与散发性基底细胞样乳腺癌有许多相似之处。以往的研究显示，家族性BRCA1相关性乳腺癌的一个显著特征是家族性BRCA1基因发生突变，而BRCA1基因在保持染色体基因组完整性、基因转录控制、细胞周期检测点调节、X染色体失活（X-chromosome inactivation，Xi）和乳腺发育中起重要作用。
从基因表型角度看，家族性BRCA1相关性乳腺癌几乎均是基底细胞样乳腺癌，从组织学角度看，家族性BRCA1相关性乳腺癌多是高级别肿瘤，肿瘤细胞增殖指数高，肿瘤组织也存在推挤性边缘和肿瘤周围淋巴细胞浸润。此外，基底细胞样乳腺癌与BRCA1相关性乳腺癌均存在较高频率的染色体异常，特别是X染色体的单亲二体型（isodisomy）伴X染色体小部分区域高表达。两者之间的相似性提示，基底细胞样乳腺癌很可能存在BRCA1基因所参与的DNA修复通路的缺陷。
BRCA1胚系突变性乳腺癌与高级别组织病理学，高增殖性、低分化性、非整倍体性、P53 突变，ER、PR、HER-2 阴性等不良预后指标相关。大量研究显示基底细胞样乳腺癌与BRCA1胚系突变有关。基底细胞样乳腺癌占BRCA1相关性乳腺癌的44%～88%。然而，关于具有基底细胞特征的散发性乳腺癌与BRCA1突变是否有关的研究较少。
BRCA1 和BRCA2 是抑癌基因，当其发生突变就可能减少、消失或错位表达。BRCA1 胞浆中的错位表达，可能与核定位信号的表达异常有关，而BRCA2 错位表达，可能由于其突变，不能参与组织修复而在胞质积聚。有研究显示BRCA1和BRCA2在基底细胞样乳腺癌癌旁组织中的表达高于基底细胞样乳腺癌，且在基底细胞样乳腺癌均出现胞浆内的错位表达。并与Yoshikawa 等的报道相一致，说明BRCA1和BRCA2在基底细胞样乳腺癌的发展中起一定作用。研究也发现BRCA1在基底细胞样乳腺癌中的表达与组织学分级、TNM 分期相关；BRCA1还与腋窝淋巴结转移有关说明BRCA1功能失调与基底细胞样乳腺癌侵袭潜能有关。
Lankhani等选择183例具有BRCA1突变的乳腺癌和63例BRCA2突变的乳腺癌作为研究对象。为了能够提前识别高风险的患者，研究者应用免疫组化的方法对5种基底样标记物（CK5/6，CK14，CK17，EGFR和骨粘连蛋白osteonectin）及ER进行检测，在多变量分析中，CK14，CK5/6和ER对BRCA的携带状态具有明显的预测价值。相反，在BRCA2相关性乳腺癌中，所有基底样标记物的表达情况与对照组相比无明显差异。基于这些研究推测，能够利用这些信息更加准确的预测乳腺癌患者携带BRCA1突变的可能性。因此，ER（－），CK5/6（+）的女性患者作为研究对象的一项回顾性研究中显示，携带BRCA1的敏感性是56%，而特异性为97%，阳性预测价值是28%，阴性预测价值是99%（图2-7-5，图2-7-6）。
图2-7-5 BRCA1、BRCA2基因突变与基底细胞样乳腺癌
图2-7-6 A. BRCA-1缺乏性乳腺癌与基底细胞样亚型乳腺癌相关；B.免疫荧光检测包括BRCA1突变或启动基因甲基化在内的BRCA-1缺陷与基底细胞样亚型的关系；C.免疫荧光检测BRCA2突变与luminalB亚型的关系
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