首先，患者要正确认识疾病，解除恐惧心理，保持乐观的情绪，积极配合治疗。其次，还要建立良好的饮食习惯，不吸烟，不饮酒，不吃过冷或过热、辛辣刺激、油炸、熏烤、难以消化的食物，碳酸饮料、雪糕、咖啡、浓茶等伤胃的“利器”也要戒掉。同时，慎重选用对胃黏膜有刺激、伤害的药物，例如非甾体抗炎药、糖皮质激素（阿司匹林、地塞米松等）等。
慢性胃炎的药物治疗主要目的是为了缓解症状和改善黏膜组织学， 包括炎症、萎缩和肠上皮化生等（但能不能使已经萎缩肠化的胃黏膜逆转，现在还需要进一步研究证实）。治疗时应尽可能针对病因治疗，并缓解不适症状。
1．胃黏膜损害可应用胃黏膜保护药 胃是人体储存和消化食物的“房屋”，而胃黏膜就像是这座“房屋”的墙壁。要想保证胃的正常功能，首先当然要坚固墙壁。因此，无论是哪一种胃病，保护胃黏膜都是必须要采取的措施之一，尤其是对于胃黏膜已经出现萎缩现象的萎缩性胃炎患者。胃黏膜保护药（如铝碳酸镁、硫糖铝等）可以保护胃黏膜，促进糜烂愈合。
2．幽门螺杆菌感染的建议根除幽门螺杆菌 慢性胃炎的主要症状为消化不良。如果将幽门螺杆菌根除，一方面可使部分患者的消化不良症状得到改善，另一方面也能防止胃黏膜萎缩和肠上皮化生的进一步发展。当然，如果没有消化不良症状或没有幽门螺杆菌感染，则无须治疗。而对于幽门螺杆菌，目前并没有一种可以单独根除的药物，国际上通用的是采取四联疗法，最有效的组合是一种质子泵抑制药（常用的有奥美拉唑、泮托拉唑等）加铋剂再加上两种抗生素。抗生素建议是从克拉霉素、甲硝唑和阿莫西林中选择两种。同时，应避免不规范的抗幽门螺杆菌治疗，具体服用方法在幽门螺杆菌感染章节会有详细的讲解。根除治疗结束后4周，可到医院做13C呼气试验检查，吹口气就能判断自己的幽门螺杆菌是否已经被清除干净。
3．伴有胆汁反流者需治疗胆汁反流 胆汁反流也是萎缩性胃炎的病因之一。胆汁反流入胃会破坏胃黏膜的屏障功能。治疗胆汁反流需依靠促动力药物（如多潘立酮、莫沙必利等可促进胃排空，减少胆汁反流）和胃黏膜保护药（铝碳酸镁、硫糖铝等）。
4．出现上腹饱胀、恶心或呕吐等症状可应用促动力药 腹胀、恶心、呕吐等症状的出现与胃排空迟缓有关，促动力药多潘立酮、马来酸曲美布汀（瑞健）等能增加胃蠕动，促进胃排空，并可以防止或减少胆汁反流现象。
5．胃酸过多应使用抑酸治疗 出现反酸、烧心、上腹痛等症状，都是与胃酸过多有关，如果感到明显不适，可选用抑酸治疗。
6．抑郁、焦虑应进行心理治疗 对于有明显抑郁或焦虑表现的萎缩性胃炎患者，应进行心理疏解或心理治疗。
7．胃镜随访 定期进行胃镜随访检查有助于帮助了解病情变化。一般而言，不伴有肠上皮化生和异型增生的萎缩性胃炎患者建议每年去医院做1次胃镜和病理检查，而有中、重度萎缩或伴有肠上皮化生的患者，就需要提高警惕了，建议每3～6个月到医院做1次胃镜和病理的检查，以便对自己的病情变化“了如指掌”。
8．手术治疗 对于病理提示重度异性增生的患者，根据情况可选择内镜下或外科手术进行治疗。
总之，慢性萎缩性胃炎病情复杂，病程长，长期以来，西医主要是从去除病因、对症治疗、保护胃黏膜、根除幽门螺杆菌、改善胃黏膜血液循环、增强胃黏膜上皮细胞的再生和修复功能等方面进行治疗。常用的药物有胃黏膜保护药、叶酸、维甲酸等。胃镜随访是现代医学预防胃癌的主要措施，一旦出现重度的不典型增生有癌变趋势时，可考虑内镜下黏膜切除或手术治疗。
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